Lineage for Protein: Amicyanin

  1. Root: SCOPe 2.03
  2. 1287432Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
  3. 1302646Fold b.6: Cupredoxin-like [49502] (2 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets, greek-key
    variations: some members have additional 1-2 strands
  4. 1302647Superfamily b.6.1: Cupredoxins [49503] (8 families) (S)
    contains copper-binding site
  5. 1302648Family b.6.1.1: Plastocyanin/azurin-like [49504] (10 proteins)
    mono-domain proteins
  6. 1302649Protein Amicyanin [49505] (2 species)

Species:

  1. 1302650Paracoccus denitrificans [TaxId:266] [49506] (33 PDB entries)
    Uniprot P22364
    1. Domain for 1aac:
    2. Domain for 1aaj:
    3. Domain for 1aan:
    4. Domain for 1bxa:
    5. Domains for 1mda:
      1. 1302711Domain d1mdaa_: 1mda A: [22844]
        Other proteins in same PDB: d1mdah_, d1mdaj_, d1mdal_, d1mdam_
        complexed with cu
      2. 1302712Domain d1mdab_: 1mda B: [22845]
        Other proteins in same PDB: d1mdah_, d1mdaj_, d1mdal_, d1mdam_
        complexed with cu
    6. Domains for 1mg2:
      1. 1302692Domain d1mg2c_: 1mg2 C: [79061]
        Other proteins in same PDB: d1mg2a_, d1mg2b_, d1mg2d_, d1mg2e_, d1mg2f_, d1mg2h_, d1mg2i_, d1mg2j_, d1mg2l_, d1mg2m_, d1mg2n_, d1mg2p_
        complexed with cu, hem, na, po4; mutant
      2. 1302693Domain d1mg2g_: 1mg2 G: [79065]
        Other proteins in same PDB: d1mg2a_, d1mg2b_, d1mg2d_, d1mg2e_, d1mg2f_, d1mg2h_, d1mg2i_, d1mg2j_, d1mg2l_, d1mg2m_, d1mg2n_, d1mg2p_
        complexed with cu, hem, na, po4; mutant
      3. 1302694Domain d1mg2k_: 1mg2 K: [79069]
        Other proteins in same PDB: d1mg2a_, d1mg2b_, d1mg2d_, d1mg2e_, d1mg2f_, d1mg2h_, d1mg2i_, d1mg2j_, d1mg2l_, d1mg2m_, d1mg2n_, d1mg2p_
        complexed with cu, hem, na, po4; mutant
      4. 1302695Domain d1mg2o_: 1mg2 O: [79073]
        Other proteins in same PDB: d1mg2a_, d1mg2b_, d1mg2d_, d1mg2e_, d1mg2f_, d1mg2h_, d1mg2i_, d1mg2j_, d1mg2l_, d1mg2m_, d1mg2n_, d1mg2p_
        complexed with cu, hem, na, po4; mutant
    7. Domains for 1mg3:
      1. 1302703Domain d1mg3c_: 1mg3 C: [79077]
        Other proteins in same PDB: d1mg3a_, d1mg3b_, d1mg3d_, d1mg3e_, d1mg3f_, d1mg3h_, d1mg3i_, d1mg3j_, d1mg3l_, d1mg3m_, d1mg3n_, d1mg3p_
        complexed with cu, hem, na, po4; mutant
      2. 1302704Domain d1mg3g_: 1mg3 G: [79081]
        Other proteins in same PDB: d1mg3a_, d1mg3b_, d1mg3d_, d1mg3e_, d1mg3f_, d1mg3h_, d1mg3i_, d1mg3j_, d1mg3l_, d1mg3m_, d1mg3n_, d1mg3p_
        complexed with cu, hem, na, po4; mutant
      3. 1302705Domain d1mg3k_: 1mg3 K: [79085]
        Other proteins in same PDB: d1mg3a_, d1mg3b_, d1mg3d_, d1mg3e_, d1mg3f_, d1mg3h_, d1mg3i_, d1mg3j_, d1mg3l_, d1mg3m_, d1mg3n_, d1mg3p_
        complexed with cu, hem, na, po4; mutant
      4. 1302706Domain d1mg3o_: 1mg3 O: [79089]
        Other proteins in same PDB: d1mg3a_, d1mg3b_, d1mg3d_, d1mg3e_, d1mg3f_, d1mg3h_, d1mg3i_, d1mg3j_, d1mg3l_, d1mg3m_, d1mg3n_, d1mg3p_
        complexed with cu, hem, na, po4; mutant
    8. Domain for 1sf3:
    9. Domain for 1sf5:
    10. Domains for 1sfd:
      1. 1302657Domain d1sfda_: 1sfd A: [105480]
        complexed with cu, so4; mutant
      2. 1302658Domain d1sfdb_: 1sfd B: [105481]
        complexed with cu, so4; mutant
    11. Domains for 1sfh:
      1. 1302662Domain d1sfha_: 1sfh A: [105486]
        complexed with cu1, na; mutant
      2. 1302663Domain d1sfhb_: 1sfh B: [105487]
        complexed with cu1, na; mutant
    12. Domains for 1t5k:
      1. 1302669Domain d1t5ka_: 1t5k A: [106451]
        complexed with co, po4
      2. 1302670Domain d1t5kb_: 1t5k B: [106452]
        complexed with co, po4
      3. 1302671Domain d1t5kc_: 1t5k C: [106453]
        complexed with co, po4
      4. 1302672Domain d1t5kd_: 1t5k D: [106454]
        complexed with co, po4
    13. Domain for 2gb2:
    14. Domain for 2gba:
    15. Domains for 2gc4:
      1. 1302683Domain d2gc4c_: 2gc4 C: [134936]
        Other proteins in same PDB: d2gc4a1, d2gc4b_, d2gc4d_, d2gc4e1, d2gc4f_, d2gc4h_, d2gc4i1, d2gc4j_, d2gc4l_, d2gc4m1, d2gc4n_, d2gc4p_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu, hem, na
      2. 1302684Domain d2gc4g_: 2gc4 G: [134940]
        Other proteins in same PDB: d2gc4a1, d2gc4b_, d2gc4d_, d2gc4e1, d2gc4f_, d2gc4h_, d2gc4i1, d2gc4j_, d2gc4l_, d2gc4m1, d2gc4n_, d2gc4p_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu, hem, na
      3. 1302685Domain d2gc4k_: 2gc4 K: [134944]
        Other proteins in same PDB: d2gc4a1, d2gc4b_, d2gc4d_, d2gc4e1, d2gc4f_, d2gc4h_, d2gc4i1, d2gc4j_, d2gc4l_, d2gc4m1, d2gc4n_, d2gc4p_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu, hem, na
      4. 1302686Domain d2gc4o_: 2gc4 O: [134948]
        Other proteins in same PDB: d2gc4a1, d2gc4b_, d2gc4d_, d2gc4e1, d2gc4f_, d2gc4h_, d2gc4i1, d2gc4j_, d2gc4l_, d2gc4m1, d2gc4n_, d2gc4p_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu, hem, na
    16. Domains for 2gc7:
      1. 1302679Domain d2gc7c_: 2gc7 C: [134956]
        Other proteins in same PDB: d2gc7a1, d2gc7b_, d2gc7d_, d2gc7e1, d2gc7f_, d2gc7h_, d2gc7i1, d2gc7j_, d2gc7l_, d2gc7m1, d2gc7n_, d2gc7p_
        automated match to d1aac__
        complexed with hem, na
      2. 1302680Domain d2gc7g_: 2gc7 G: [134960]
        Other proteins in same PDB: d2gc7a1, d2gc7b_, d2gc7d_, d2gc7e1, d2gc7f_, d2gc7h_, d2gc7i1, d2gc7j_, d2gc7l_, d2gc7m1, d2gc7n_, d2gc7p_
        automated match to d1aac__
        complexed with hem, na
      3. 1302681Domain d2gc7k_: 2gc7 K: [134964]
        Other proteins in same PDB: d2gc7a1, d2gc7b_, d2gc7d_, d2gc7e1, d2gc7f_, d2gc7h_, d2gc7i1, d2gc7j_, d2gc7l_, d2gc7m1, d2gc7n_, d2gc7p_
        automated match to d1aac__
        complexed with hem, na
      4. 1302682Domain d2gc7o_: 2gc7 O: [134968]
        Other proteins in same PDB: d2gc7a1, d2gc7b_, d2gc7d_, d2gc7e1, d2gc7f_, d2gc7h_, d2gc7i1, d2gc7j_, d2gc7l_, d2gc7m1, d2gc7n_, d2gc7p_
        automated match to d1aac__
        complexed with hem, na
    17. Domain for 2idq:
    18. Domain for 2ids:
    19. Domain for 2idt:
    20. Domain for 2idu:
    21. Domains for 2j55:
      1. 1302700Domain d2j55a_: 2j55 A: [138013]
        Other proteins in same PDB: d2j55h1, d2j55j1, d2j55l1, d2j55m_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu, gol
      2. 1302701Domain d2j55b_: 2j55 B: [138014]
        Other proteins in same PDB: d2j55h1, d2j55j1, d2j55l1, d2j55m_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu, gol
    22. Domains for 2j56:
      1. 1302688Domain d2j56a_: 2j56 A: [138017]
        Other proteins in same PDB: d2j56h1, d2j56j1, d2j56l_, d2j56m_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu, gol, na
      2. 1302689Domain d2j56b_: 2j56 B: [138018]
        Other proteins in same PDB: d2j56h1, d2j56j1, d2j56l_, d2j56m_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu, gol, na
    23. Domains for 2j57:
      1. 1302696Domain d2j57a_: 2j57 A: [138021]
        Other proteins in same PDB: d2j57g1, d2j57h1, d2j57i1, d2j57j1, d2j57k_, d2j57l_, d2j57m_, d2j57n_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu
      2. 1302697Domain d2j57b_: 2j57 B: [138022]
        Other proteins in same PDB: d2j57g1, d2j57h1, d2j57i1, d2j57j1, d2j57k_, d2j57l_, d2j57m_, d2j57n_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu
      3. 1302698Domain d2j57c_: 2j57 C: [138023]
        Other proteins in same PDB: d2j57g1, d2j57h1, d2j57i1, d2j57j1, d2j57k_, d2j57l_, d2j57m_, d2j57n_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu
      4. 1302699Domain d2j57d_: 2j57 D: [138024]
        Other proteins in same PDB: d2j57g1, d2j57h1, d2j57i1, d2j57j1, d2j57k_, d2j57l_, d2j57m_, d2j57n_
        automated match to d1aac__
        complexed with cu
    24. Domain for 2mta:
    25. Domain for 2ov0:
    26. Domain for 2qdv:
    27. Domain for 2qdw:
    28. Domain for 2rac:
    29. Domain for 3ie9:
    30. Domain for 3iea:
    31. Domain for 3l45:
    32. Domains for 3ply:
      1. 1302707Domain d3plya_: 3ply A: [183838]
        automated match to d1aaca_
        complexed with cu, k, na, po4; mutant
      2. 1302708Domain d3plyb_: 3ply B: [183839]
        automated match to d1aaca_
        complexed with cu, k, na, po4; mutant
      3. 1302709Domain d3plyc_: 3ply C: [183840]
        automated match to d1aaca_
        complexed with cu, k, na, po4; mutant
      4. 1302710Domain d3plyd_: 3ply D: [183841]
        automated match to d1aaca_
        complexed with cu, k, na, po4; mutant
    33. Domains for 3rym:
      1. 1302674Domain d3ryma_: 3rym A: [185210]
        automated match to d1aaca_
        complexed with zn; mutant
      2. 1302675Domain d3rymb_: 3rym B: [185211]
        automated match to d1aaca_
        complexed with zn; mutant
      3. 1302676Domain d3rymc_: 3rym C: [185212]
        automated match to d1aaca_
        complexed with zn; mutant
      4. 1302677Domain d3rymd_: 3rym D: [185213]
        automated match to d1aaca_
        complexed with zn; mutant
  2. 1302713Paracoccus versutus (Thiobacillus versutus) [TaxId:34007] [63685] (1 PDB entry)

More info for Protein Amicyanin from b.6.1.1: Plastocyanin/azurin-like

Timeline for Protein Amicyanin from b.6.1.1: Plastocyanin/azurin-like: