Lineage for Protein: Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains

  1. Root: SCOP 1.61
  2. 157351Class b: All beta proteins [48724] (111 folds)
  3. 157352Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (17 superfamilies)
  4. 157353Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (6 families) (S)
  5. 158799Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (9 proteins)
  6. 159086Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains [49132] (12 species)

Species:

  1. 159087Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [49133] (1 PDB entry)
  2. 159090Human (Homo sapiens), HLA-DQ8 [TaxId:9606] [63663] (1 PDB entry)
  3. 159093Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] [49134] (9 PDB entries)
    1. Domains for 1aqd:
      1. 159098Domain d1aqda1: 1aqd A:82-181 [21585]
        Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
      2. 159099Domain d1aqdb1: 1aqd B:93-190 [21586]
        Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
      3. 159100Domain d1aqdd1: 1aqd D:82-179 [21587]
        Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
      4. 159101Domain d1aqde1: 1aqd E:93-190 [21588]
        Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
      5. 159102Domain d1aqdg1: 1aqd G:82-179 [21589]
        Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
      6. 159103Domain d1aqdh1: 1aqd H:93-190 [21590]
        Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
      7. 159104Domain d1aqdj1: 1aqd J:82-179 [21591]
        Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
      8. 159105Domain d1aqdk1: 1aqd K:93-191 [21592]
        Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
    2. Domains for 1dlh:
      1. 159110Domain d1dlha1: 1dlh A:82-182 [21597]
        Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2
      2. 159111Domain d1dlhb1: 1dlh B:93-190 [21598]
        Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2
      3. 159112Domain d1dlhd1: 1dlh D:82-182 [21599]
        Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2
      4. 159113Domain d1dlhe1: 1dlh E:93-190 [21600]
        Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2
    3. Domains for 1fyt:
      1. 159114Domain d1fyta1: 1fyt A:82-181 [21595]
        Other proteins in same PDB: d1fyta2, d1fytb2, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
      2. 159115Domain d1fytb1: 1fyt B:93-190 [21596]
        Other proteins in same PDB: d1fyta2, d1fytb2, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
    4. Domains for 1hxy:
      1. 159106Domain d1hxya1: 1hxy A:82-182 [61386]
        Other proteins in same PDB: d1hxya2, d1hxyb2, d1hxyd1, d1hxyd2
      2. 159107Domain d1hxyb1: 1hxy B:93-190 [61388]
        Other proteins in same PDB: d1hxya2, d1hxyb2, d1hxyd1, d1hxyd2
    5. Domains for 1kg0:
      1. 159120Domain d1kg0a1: 1kg0 A:82-182 [72441]
        Other proteins in same PDB: d1kg0a2, d1kg0b2, d1kg0c_
      2. 159121Domain d1kg0b1: 1kg0 B:93-190 [72443]
        Other proteins in same PDB: d1kg0a2, d1kg0b2, d1kg0c_
    6. Domains for 1klg:
      1. 159096Domain d1klga1: 1klg A:82-180 [72714]
        Other proteins in same PDB: d1klga2, d1klgb2, d1klgd1, d1klgd2
      2. 159097Domain d1klgb1: 1klg B:93-190 [72716]
        Other proteins in same PDB: d1klga2, d1klgb2, d1klgd1, d1klgd2
    7. Domains for 1klu:
      1. 159094Domain d1klua1: 1klu A:82-182 [72724]
        Other proteins in same PDB: d1klua2, d1klub2, d1klud1, d1klud2
      2. 159095Domain d1klub1: 1klu B:93-190 [72726]
        Other proteins in same PDB: d1klua2, d1klub2, d1klud1, d1klud2
    8. Domains for 1seb:
      1. 159116Domain d1seba1: 1seb A:82-181 [21601]
        Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
      2. 159117Domain d1sebb1: 1seb B:93-192 [21602]
        Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
      3. 159118Domain d1sebe1: 1seb E:82-181 [21603]
        Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
      4. 159119Domain d1sebf1: 1seb F:93-192 [21604]
        Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
    9. Domains for 2seb:
      1. 159108Domain d2seba1: 2seb A:82-180 [21593]
        Other proteins in same PDB: d2seba2, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2
      2. 159109Domain d2sebb1: 2seb B:93-190 [21594]
        Other proteins in same PDB: d2seba2, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2
  4. 159122Human (Homo sapiens), HLA-DR2 [TaxId:9606] [49135] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1bx2:
      1. 159127Domain d1bx2a1: 1bx2 A:82-181 [21609]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2
      2. 159128Domain d1bx2b1: 1bx2 B:93-193 [21610]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2
      3. 159129Domain d1bx2d1: 1bx2 D:82-181 [21611]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2
      4. 159130Domain d1bx2e1: 1bx2 E:93-191 [21612]
        Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2
    2. Domains for 1fv1:
      1. 159123Domain d1fv1a1: 1fv1 A:82-181 [21605]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2
      2. 159124Domain d1fv1b1: 1fv1 B:93-190 [21606]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2
      3. 159125Domain d1fv1d1: 1fv1 D:82-181 [21607]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2
      4. 159126Domain d1fv1e1: 1fv1 E:93-190 [21608]
        Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2
    3. Domains for 1hqr:
      1. 159131Domain d1hqra1: 1hqr A:82-181 [21613]
        Other proteins in same PDB: d1hqra2, d1hqrb2, d1hqrd1, d1hqrd2
      2. 159132Domain d1hqrb1: 1hqr B:293-390 [21614]
        Other proteins in same PDB: d1hqra2, d1hqrb2, d1hqrd1, d1hqrd2
  5. 159133Human (Homo sapiens), HLA-DR3 [TaxId:9606] [49136] (1 PDB entry)
  6. 159136Human (Homo sapiens), HLA-DR4 [TaxId:9606] [49137] (5 PDB entries)
    1. Domains for 1d5m:
      1. 159139Domain d1d5ma1: 1d5m A:82-181 [21617]
        Other proteins in same PDB: d1d5ma2, d1d5mb2, d1d5mc1, d1d5mc2
      2. 159140Domain d1d5mb1: 1d5m B:93-190 [21618]
        Other proteins in same PDB: d1d5ma2, d1d5mb2, d1d5mc1, d1d5mc2
    2. Domains for 1d5x:
      1. 159143Domain d1d5xa1: 1d5x A:82-181 [21623]
        Other proteins in same PDB: d1d5xa2, d1d5xb2, d1d5xc1, d1d5xc2
      2. 159144Domain d1d5xb1: 1d5x B:93-190 [21624]
        Other proteins in same PDB: d1d5xa2, d1d5xb2, d1d5xc1, d1d5xc2
    3. Domains for 1d5z:
      1. 159137Domain d1d5za1: 1d5z A:82-180 [21619]
        Other proteins in same PDB: d1d5za2, d1d5zb2, d1d5zc1, d1d5zc2
      2. 159138Domain d1d5zb1: 1d5z B:93-190 [21620]
        Other proteins in same PDB: d1d5za2, d1d5zb2, d1d5zc1, d1d5zc2
    4. Domains for 1d6e:
      1. 159141Domain d1d6ea1: 1d6e A:82-180 [21621]
        Other proteins in same PDB: d1d6ea2, d1d6eb2, d1d6ec1, d1d6ec2
      2. 159142Domain d1d6eb1: 1d6e B:93-190 [21622]
        Other proteins in same PDB: d1d6ea2, d1d6eb2, d1d6ec1, d1d6ec2
    5. Domains for 1j8h:
      1. 159145Domain d1j8ha1: 1j8h A:82-181 [71602]
        Other proteins in same PDB: d1j8ha2, d1j8hb2, d1j8hd1, d1j8hd2, d1j8he1, d1j8he2
      2. 159146Domain d1j8hb1: 1j8h B:93-190 [71604]
        Other proteins in same PDB: d1j8ha2, d1j8hb2, d1j8hd1, d1j8hd2, d1j8he1, d1j8he2
  7. 159147Mouse (Mus musculus), H2-DM [TaxId:10090] [69157] (1 PDB entry)
  8. 159150Mouse (Mus musculus), I-A(G7) [TaxId:10090] [49141] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1es0:
      1. 159151Domain d1es0a1: 1es0 A:83-180 [21643]
        Other proteins in same PDB: d1es0a2, d1es0b2
      2. 159152Domain d1es0b1: 1es0 B:94-189 [21644]
        Other proteins in same PDB: d1es0a2, d1es0b2
    2. Domains for 1f3j:
      1. 159153Domain d1f3ja1: 1f3j A:83-181 [21645]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2
      2. 159154Domain d1f3jb1: 1f3j B:94-191 [21646]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2
      3. 159155Domain d1f3jd1: 1f3j D:83-181 [21647]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2
      4. 159156Domain d1f3je1: 1f3j E:94-191 [21648]
        Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2
  9. 159157Mouse (Mus musculus), I-AB [TaxId:10090] [74839] (1 PDB entry)
  10. 159166Mouse (Mus musculus), I-AD [TaxId:10090] [49140] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1iao:
      1. 159169Domain d1iaoa1: 1iao A:83-178 [21641]
        Other proteins in same PDB: d1iaoa2, d1iaob2
      2. 159170Domain d1iaob1: 1iao B:94-188 [21642]
        Other proteins in same PDB: d1iaoa2, d1iaob2
    2. Domains for 2iad:
      1. 159167Domain d2iada1: 2iad A:83-186 [21639]
        Other proteins in same PDB: d2iada2, d2iadb2
      2. 159168Domain d2iadb1: 2iad B:94-190 [21640]
        Other proteins in same PDB: d2iada2, d2iadb2
  11. 159171Mouse (Mus musculus), I-AK [TaxId:10090] [49138] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1d9k:
      1. 159174Domain d1d9kc1: 1d9k C:82-182 [21627]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2
      2. 159175Domain d1d9kd1: 1d9k D:93-190 [21628]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2
      3. 159176Domain d1d9kg1: 1d9k G:82-182 [21629]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2
      4. 159177Domain d1d9kh1: 1d9k H:93-190 [21630]
        Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2
    2. Domains for 1iak:
      1. 159172Domain d1iaka1: 1iak A:82-181 [21625]
        Other proteins in same PDB: d1iaka2, d1iakb2
      2. 159173Domain d1iakb1: 1iak B:93-190 [21626]
        Other proteins in same PDB: d1iaka2, d1iakb2
    3. Domains for 1jl4:
      1. 159178Domain d1jl4a1: 1jl4 A:82-181 [63157]
        Other proteins in same PDB: d1jl4a2, d1jl4b2, d1jl4d1, d1jl4d2
      2. 159179Domain d1jl4b1: 1jl4 B:93-190 [63159]
        Other proteins in same PDB: d1jl4a2, d1jl4b2, d1jl4d1, d1jl4d2
  12. 159180Mouse (Mus musculus), I-EK [TaxId:10090] [49139] (7 PDB entries)
    1. Domains for 1fne:
      1. 159185Domain d1fnea1: 1fne A:82-182 [59896]
        Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb2, d1fnec2, d1fned2
      2. 159186Domain d1fneb1: 1fne B:93-188 [59898]
        Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb2, d1fnec2, d1fned2
      3. 159187Domain d1fnec1: 1fne C:82-182 [59900]
        Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb2, d1fnec2, d1fned2
      4. 159188Domain d1fned1: 1fne D:93-188 [59902]
        Other proteins in same PDB: d1fnea2, d1fneb2, d1fnec2, d1fned2
    2. Domains for 1fng:
      1. 159181Domain d1fnga1: 1fng A:82-182 [59904]
        Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd2
      2. 159182Domain d1fngb1: 1fng B:93-188 [59906]
        Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd2
      3. 159183Domain d1fngc1: 1fng C:82-182 [59908]
        Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd2
      4. 159184Domain d1fngd1: 1fng D:93-188 [59910]
        Other proteins in same PDB: d1fnga2, d1fngb2, d1fngc2, d1fngd2
    3. Domains for 1i3r:
      1. 159197Domain d1i3ra1: 1i3r A:82-182 [61620]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2
      2. 159198Domain d1i3rb1: 1i3r B:121-216 [61622]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2
      3. 159199Domain d1i3rc1: 1i3r C:82-182 [61624]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2
      4. 159200Domain d1i3rd1: 1i3r D:121-216 [61626]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2
      5. 159201Domain d1i3re1: 1i3r E:82-182 [61628]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2
      6. 159202Domain d1i3rf1: 1i3r F:121-216 [61630]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2
      7. 159203Domain d1i3rg1: 1i3r G:82-182 [61632]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2
      8. 159204Domain d1i3rh1: 1i3r H:121-216 [61634]
        Other proteins in same PDB: d1i3ra2, d1i3rb2, d1i3rc2, d1i3rd2, d1i3re2, d1i3rf2, d1i3rg2, d1i3rh2
    4. Domains for 1iea:
      1. 159189Domain d1ieaa1: 1iea A:82-182 [21631]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2
      2. 159190Domain d1ieab1: 1iea B:93-188 [21632]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2
      3. 159191Domain d1ieac1: 1iea C:82-182 [21633]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2
      4. 159192Domain d1iead1: 1iea D:93-188 [21634]
        Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2
    5. Domains for 1ieb:
      1. 159205Domain d1ieba1: 1ieb A:82-182 [21635]
        Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2
      2. 159206Domain d1iebb1: 1ieb B:93-188 [21636]
        Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2
      3. 159207Domain d1iebc1: 1ieb C:82-182 [21637]
        Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2
      4. 159208Domain d1iebd1: 1ieb D:93-188 [21638]
        Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2
    6. Domains for 1kt2:
      1. 159209Domain d1kt2a1: 1kt2 A:82-182 [72951]
        Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d2
      2. 159210Domain d1kt2b1: 1kt2 B:121-215 [72953]
        Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d2
      3. 159211Domain d1kt2c1: 1kt2 C:82-182 [72955]
        Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d2
      4. 159212Domain d1kt2d1: 1kt2 D:121-215 [72957]
        Other proteins in same PDB: d1kt2a2, d1kt2b2, d1kt2c2, d1kt2d2
    7. Domains for 1ktd:
      1. 159193Domain d1ktda1: 1ktd A:82-182 [72964]
        Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd2
      2. 159194Domain d1ktdb1: 1ktd B:121-215 [72966]
        Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd2
      3. 159195Domain d1ktdc1: 1ktd C:82-182 [72968]
        Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd2
      4. 159196Domain d1ktdd1: 1ktd D:121-215 [72970]
        Other proteins in same PDB: d1ktda2, d1ktdb2, d1ktdc2, d1ktdd2

More info for Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like)

Timeline for Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like):

  • Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
  • Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in SCOP 1.59
  • Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) last appears in SCOP 1.63