SCOP 1.55: Protein: Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains

Lineage for Protein: Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains

Root: SCOP 1.55
Class b: All beta proteins [48724] (93 folds)
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (14 superfamilies)
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families)
Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (9 proteins)
Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains [49132] (9 species)

Species:

Human (Homo sapiens), HLA-DM [TaxId:9606] [49133] (1 PDB entry)
- Domains for 1hdm:
  1. Domain d1hdma1: 1hdm A:94-196 [21583]
    Other proteins in same PDB: d1hdma2, d1hdmb2
  2. Domain d1hdmb1: 1hdm B:88-185 [21584]
    Other proteins in same PDB: d1hdma2, d1hdmb2
Human (Homo sapiens), HLA-DR1 [TaxId:9606] [49134] (5 PDB entries)
1. Domains for 1aqd:
  1. Domain d1aqda1: 1aqd A:82-181 [21585]
    Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
  2. Domain d1aqdb1: 1aqd B:93-190 [21586]
    Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
  3. Domain d1aqdd1: 1aqd D:82-179 [21587]
    Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
  4. Domain d1aqde1: 1aqd E:93-190 [21588]
    Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
  5. Domain d1aqdg1: 1aqd G:82-179 [21589]
    Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
  6. Domain d1aqdh1: 1aqd H:93-190 [21590]
    Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
  7. Domain d1aqdj1: 1aqd J:82-179 [21591]
    Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
  8. Domain d1aqdk1: 1aqd K:93-191 [21592]
    Other proteins in same PDB: d1aqda2, d1aqdb2, d1aqdd2, d1aqde2, d1aqdg2, d1aqdh2, d1aqdj2, d1aqdk2
2. Domains for 1dlh:
  1. Domain d1dlha1: 1dlh A:82-182 [21597]
    Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2
  2. Domain d1dlhb1: 1dlh B:93-190 [21598]
    Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2
  3. Domain d1dlhd1: 1dlh D:82-182 [21599]
    Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2
  4. Domain d1dlhe1: 1dlh E:93-190 [21600]
    Other proteins in same PDB: d1dlha2, d1dlhb2, d1dlhd2, d1dlhe2
3. Domains for 1fyt:
  1. Domain d1fyta1: 1fyt A:82-181 [21595]
    Other proteins in same PDB: d1fyta2, d1fytb2, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
  2. Domain d1fytb1: 1fyt B:93-190 [21596]
    Other proteins in same PDB: d1fyta2, d1fytb2, d1fytd1, d1fytd2, d1fyte1, d1fyte2
4. Domains for 1seb:
  1. Domain d1seba1: 1seb A:82-181 [21601]
    Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
  2. Domain d1sebb1: 1seb B:93-192 [21602]
    Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
  3. Domain d1sebe1: 1seb E:82-181 [21603]
    Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
  4. Domain d1sebf1: 1seb F:93-192 [21604]
    Other proteins in same PDB: d1seba2, d1sebb2, d1sebd1, d1sebd2, d1sebe2, d1sebf2, d1sebh1, d1sebh2
5. Domains for 2seb:
  1. Domain d2seba1: 2seb A:82-180 [21593]
    Other proteins in same PDB: d2seba2, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2
  2. Domain d2sebb1: 2seb B:93-190 [21594]
    Other proteins in same PDB: d2seba2, d2sebb2, d2sebd1, d2sebd2
Human (Homo sapiens), HLA-DR2 [TaxId:9606] [49135] (3 PDB entries)
1. Domains for 1bx2:
  1. Domain d1bx2a1: 1bx2 A:82-181 [21609]
    Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2
  2. Domain d1bx2b1: 1bx2 B:93-193 [21610]
    Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2
  3. Domain d1bx2d1: 1bx2 D:82-181 [21611]
    Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2
  4. Domain d1bx2e1: 1bx2 E:93-191 [21612]
    Other proteins in same PDB: d1bx2a2, d1bx2b2, d1bx2d2, d1bx2e2
2. Domains for 1fv1:
  1. Domain d1fv1a1: 1fv1 A:82-181 [21605]
    Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2
  2. Domain d1fv1b1: 1fv1 B:93-190 [21606]
    Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2
  3. Domain d1fv1d1: 1fv1 D:82-181 [21607]
    Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2
  4. Domain d1fv1e1: 1fv1 E:93-190 [21608]
    Other proteins in same PDB: d1fv1a2, d1fv1b2, d1fv1d2, d1fv1e2
3. Domains for 1hqr:
  1. Domain d1hqra1: 1hqr A:82-181 [21613]
    Other proteins in same PDB: d1hqra2, d1hqrb2, d1hqrd1, d1hqrd2
  2. Domain d1hqrb1: 1hqr B:293-390 [21614]
    Other proteins in same PDB: d1hqra2, d1hqrb2, d1hqrd1, d1hqrd2
Human (Homo sapiens), HLA-DR3 [TaxId:9606] [49136] (1 PDB entry)
- Domains for 1a6a:
  1. Domain d1a6aa1: 1a6a A:82-180 [21615]
    Other proteins in same PDB: d1a6aa2, d1a6ab2
  2. Domain d1a6ab1: 1a6a B:93-191 [21616]
    Other proteins in same PDB: d1a6aa2, d1a6ab2
Human (Homo sapiens), HLA-DR4 [TaxId:9606] [49137] (4 PDB entries)
1. Domains for 1d5m:
  1. Domain d1d5ma1: 1d5m A:82-181 [21617]
    Other proteins in same PDB: d1d5ma2, d1d5mb2, d1d5mc1, d1d5mc2
  2. Domain d1d5mb1: 1d5m B:93-190 [21618]
    Other proteins in same PDB: d1d5ma2, d1d5mb2, d1d5mc1, d1d5mc2
2. Domains for 1d5x:
  1. Domain d1d5xa1: 1d5x A:82-181 [21623]
    Other proteins in same PDB: d1d5xa2, d1d5xb2, d1d5xc1, d1d5xc2
  2. Domain d1d5xb1: 1d5x B:93-190 [21624]
    Other proteins in same PDB: d1d5xa2, d1d5xb2, d1d5xc1, d1d5xc2
3. Domains for 1d5z:
  1. Domain d1d5za1: 1d5z A:82-180 [21619]
    Other proteins in same PDB: d1d5za2, d1d5zb2, d1d5zc1, d1d5zc2
  2. Domain d1d5zb1: 1d5z B:93-190 [21620]
    Other proteins in same PDB: d1d5za2, d1d5zb2, d1d5zc1, d1d5zc2
4. Domains for 1d6e:
  1. Domain d1d6ea1: 1d6e A:82-180 [21621]
    Other proteins in same PDB: d1d6ea2, d1d6eb2, d1d6ec1, d1d6ec2
  2. Domain d1d6eb1: 1d6e B:93-190 [21622]
    Other proteins in same PDB: d1d6ea2, d1d6eb2, d1d6ec1, d1d6ec2
Mouse (Mus musculus), I-A(G7) [TaxId:10090] [49141] (2 PDB entries)
1. Domains for 1es0:
  1. Domain d1es0a1: 1es0 A:83-180 [21643]
    Other proteins in same PDB: d1es0a2, d1es0b2
  2. Domain d1es0b1: 1es0 B:94-189 [21644]
    Other proteins in same PDB: d1es0a2, d1es0b2
2. Domains for 1f3j:
  1. Domain d1f3ja1: 1f3j A:83-181 [21645]
    Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2
  2. Domain d1f3jb1: 1f3j B:94-191 [21646]
    Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2
  3. Domain d1f3jd1: 1f3j D:83-181 [21647]
    Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2
  4. Domain d1f3je1: 1f3j E:94-191 [21648]
    Other proteins in same PDB: d1f3ja2, d1f3jb2, d1f3jd2, d1f3je2
Mouse (Mus musculus), I-AD [TaxId:10090] [49140] (2 PDB entries)
1. Domains for 1iao:
  1. Domain d1iaoa1: 1iao A:83-178 [21641]
    Other proteins in same PDB: d1iaoa2, d1iaob2
  2. Domain d1iaob1: 1iao B:94-188 [21642]
    Other proteins in same PDB: d1iaoa2, d1iaob2
2. Domains for 2iad:
  1. Domain d2iada1: 2iad A:83-186 [21639]
    Other proteins in same PDB: d2iada2, d2iadb2
  2. Domain d2iadb1: 2iad B:94-190 [21640]
    Other proteins in same PDB: d2iada2, d2iadb2
Mouse (Mus musculus), I-AK [TaxId:10090] [49138] (2 PDB entries)
1. Domains for 1d9k:
  1. Domain d1d9kc1: 1d9k C:82-182 [21627]
    Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2
  2. Domain d1d9kd1: 1d9k D:93-190 [21628]
    Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2
  3. Domain d1d9kg1: 1d9k G:82-182 [21629]
    Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2
  4. Domain d1d9kh1: 1d9k H:93-190 [21630]
    Other proteins in same PDB: d1d9ka_, d1d9kb_, d1d9kc2, d1d9kd2, d1d9ke_, d1d9kf_, d1d9kg2, d1d9kh2
2. Domains for 1iak:
  1. Domain d1iaka1: 1iak A:82-181 [21625]
    Other proteins in same PDB: d1iaka2, d1iakb2
  2. Domain d1iakb1: 1iak B:93-190 [21626]
    Other proteins in same PDB: d1iaka2, d1iakb2
Mouse (Mus musculus), I-EK [TaxId:10090] [49139] (2 PDB entries)
1. Domains for 1iea:
  1. Domain d1ieaa1: 1iea A:82-182 [21631]
    Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2
  2. Domain d1ieab1: 1iea B:93-188 [21632]
    Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2
  3. Domain d1ieac1: 1iea C:82-182 [21633]
    Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2
  4. Domain d1iead1: 1iea D:93-188 [21634]
    Other proteins in same PDB: d1ieaa2, d1ieab2, d1ieac2, d1iead2
2. Domains for 1ieb:
  1. Domain d1ieba1: 1ieb A:82-182 [21635]
    Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2
  2. Domain d1iebb1: 1ieb B:93-188 [21636]
    Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2
  3. Domain d1iebc1: 1ieb C:82-182 [21637]
    Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2
  4. Domain d1iebd1: 1ieb D:93-188 [21638]
    Other proteins in same PDB: d1ieba2, d1iebb2, d1iebc2, d1iebd2

More info for Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like)

Timeline for Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like):

Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in SCOP 1.57
Protein Class II MHC, C-terminal domains of alpha and beta chains from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) last appears in SCOP 1.63