SCOP 1.73: Protein: T-cell antigen receptor

Lineage for Protein: T-cell antigen receptor

Root: SCOP 1.73
Class b: All beta proteins [48724] (165 folds)
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (27 superfamilies)
sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
some members of the fold have additional strands
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families)
Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (23 proteins)
Protein T-cell antigen receptor [49125] (6 species)

Species:

Human (Homo sapiens), alpha-chain [TaxId:9606] [49127] (9 PDB entries)
1. Domain for 1bd2:
  - Domain d1bd2d2: 1bd2 D:118-203 [21557]
    Other proteins in same PDB: d1bd2a1, d1bd2a2, d1bd2b_, d1bd2d1, d1bd2e1
2. Domain for 1fyt:
  - Domain d1fytd2: 1fyt D:118-203 [21556]
    Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fyta2, d1fytb1, d1fytb2, d1fytd1, d1fyte1
    complexed with nag; mutant
3. Domain for 1j8h:
  - Domain d1j8hd2: 1j8h D:118-203 [71607]
    Other proteins in same PDB: d1j8ha1, d1j8ha2, d1j8hb1, d1j8hb2, d1j8hd1, d1j8he1
    complexed with nag; mutant
4. Domain for 1kgc:
  - Domain d1kgcd2: 1kgc D:118-206 [77385]
    Other proteins in same PDB: d1kgcd1, d1kgce1
    LC13 clone
5. Domain for 1mi5:
  - Domain d1mi5d2: 1mi5 D:118-206 [79146]
    Other proteins in same PDB: d1mi5a1, d1mi5a2, d1mi5b_, d1mi5d1, d1mi5e1
    LC13 clone
6. Domain for 1oga:
  - Domain d1ogad2: 1oga D:118-202 [86991]
    Other proteins in same PDB: d1ogaa1, d1ogaa2, d1ogab_, d1ogad1, d1ogae1
7. Domain for 1qrn:
  - Domain d1qrnd2: 1qrn D:118-206 [21558]
    Other proteins in same PDB: d1qrna1, d1qrna2, d1qrnb_, d1qrnd1, d1qrne1
8. Domain for 1qse:
  - Domain d1qsed2: 1qse D:118-206 [21559]
    Other proteins in same PDB: d1qsea1, d1qsea2, d1qseb_, d1qsed1, d1qsee1
9. Domain for 1qsf:
  - Domain d1qsfd2: 1qsf D:118-206 [21560]
    Other proteins in same PDB: d1qsfa1, d1qsfa2, d1qsfb_, d1qsfd1, d1qsfe1

Human (Homo sapiens), beta-chain [TaxId:9606] [49129] (16 PDB entries)

Domain for 1ao7:
- Domain d1ao7e2: 1ao7 E:119-246 [21575]
  Other proteins in same PDB: d1ao7a1, d1ao7a2, d1ao7b_, d1ao7d_, d1ao7e1
  complexed with emc; mutant
Domain for 1bd2:
- Domain d1bd2e2: 1bd2 E:119-247 [21574]
  Other proteins in same PDB: d1bd2a1, d1bd2a2, d1bd2b_, d1bd2d1, d1bd2e1
Domain for 1fyt:
- Domain d1fyte2: 1fyt E:119-246 [21573]
  Other proteins in same PDB: d1fyta1, d1fyta2, d1fytb1, d1fytb2, d1fytd1, d1fyte1
  complexed with nag; mutant
Domain for 1j8h:
- Domain d1j8he2: 1j8h E:119-246 [71609]
  Other proteins in same PDB: d1j8ha1, d1j8ha2, d1j8hb1, d1j8hb2, d1j8hd1, d1j8he1
  complexed with nag; mutant
Domain for 1kgc:
- Domain d1kgce2: 1kgc E:119-247 [77387]
  Other proteins in same PDB: d1kgcd1, d1kgce1
  LC13 clone
Domains for 1ktk:
1. Domain d1ktke2: 1ktk E:119-246 [72985]
  Other proteins in same PDB: d1ktka1, d1ktka2, d1ktkb1, d1ktkb2, d1ktkc1, d1ktkc2, d1ktkd1, d1ktkd2, d1ktke1, d1ktkf1
2. Domain d1ktkf2: 1ktk F:124-240 [72987]
  Other proteins in same PDB: d1ktka1, d1ktka2, d1ktkb1, d1ktkb2, d1ktkc1, d1ktkc2, d1ktkd1, d1ktkd2, d1ktke1, d1ktkf1
  mutant
Domain for 1mi5:
- Domain d1mi5e2: 1mi5 E:119-247 [79148]
  Other proteins in same PDB: d1mi5a1, d1mi5a2, d1mi5b_, d1mi5d1, d1mi5e1
  LC13 clone
Domain for 1oga:
- Domain d1ogae2: 1oga E:119-245 [86993]
  Other proteins in same PDB: d1ogaa1, d1ogaa2, d1ogab_, d1ogad1, d1ogae1
Domain for 1qrn:
- Domain d1qrne2: 1qrn E:119-246 [21576]
  Other proteins in same PDB: d1qrna1, d1qrna2, d1qrnb_, d1qrnd1, d1qrne1
Domain for 1qse:
- Domain d1qsee2: 1qse E:119-246 [21577]
  Other proteins in same PDB: d1qsea1, d1qsea2, d1qseb_, d1qsed1, d1qsee1
Domain for 1qsf:
- Domain d1qsfe2: 1qsf E:119-246 [21578]
  Other proteins in same PDB: d1qsfa1, d1qsfa2, d1qsfb_, d1qsfd1, d1qsfe1
Domain for 1ymm:
- Domain d1ymme2: 1ymm E:123-246 [123706]
  Other proteins in same PDB: d1ymma1, d1ymma2, d1ymmb1, d1ymmb2, d1ymme1
  automatically matched to d1ogae2
  complexed with nag; mutant

Domains for 1zgl:

Domain d1zglp2: 1zgl P:119-244 [125048]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglr1, d1zglt1, d1zglv1
automatically matched to d1bd2e2

Domain d1zglr2: 1zgl R:119-240 [125050]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglr1, d1zglt1, d1zglv1
automatically matched to d1bd2e2

Domain d1zglt2: 1zgl T:119-244 [125052]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglr1, d1zglt1, d1zglv1
automatically matched to d1bd2e2

Domain d1zglv2: 1zgl V:119-244 [125054]
Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp1, d1zglr1, d1zglt1, d1zglv1
automatically matched to d1bd2e2

Domains for 2axh:
1. Domain d2axha2: 2axh A:119-244 [127491]
  Other proteins in same PDB: d2axha1, d2axhb1
  automatically matched to d1ogae2
  mutant
2. Domain d2axhb2: 2axh B:119-244 [127493]
  Other proteins in same PDB: d2axha1, d2axhb1
  automatically matched to d1ogae2
  mutant
Domains for 2cde:
1. Domain d2cdeb2: 2cde B:117-245 [130265]
  Other proteins in same PDB: d2cdeb1, d2cded1, d2cdef1
  automatically matched to d1bd2e2
2. Domain d2cded2: 2cde D:117-245 [130267]
  Other proteins in same PDB: d2cdeb1, d2cded1, d2cdef1
  automatically matched to d1bd2e2
3. Domain d2cdef2: 2cde F:117-245 [130269]
  Other proteins in same PDB: d2cdeb1, d2cded1, d2cdef1
  automatically matched to d1bd2e2
Domain for 2gj6:
- Domain d2gj6e2: 2gj6 E:118-246 [135263]
  Other proteins in same PDB: d2gj6a1, d2gj6a2, d2gj6b1, d2gj6d1, d2gj6e1
  automatically matched to d1mi5e2
  complexed with 3ib, gol, so4; mutant

Human (Homo sapiens), delta-chain [TaxId:9606] [63662] (1 PDB entry)
- Domains for 1hxm:
  1. Domain d1hxmb2: 1hxm B:124-230 [61370]
    Other proteins in same PDB: d1hxma1, d1hxmb1, d1hxmc1, d1hxmd1, d1hxme1, d1hxmf1, d1hxmg1, d1hxmh1
  2. Domain d1hxmd2: 1hxm D:124-230 [61374]
    Other proteins in same PDB: d1hxma1, d1hxmb1, d1hxmc1, d1hxmd1, d1hxme1, d1hxmf1, d1hxmg1, d1hxmh1
  3. Domain d1hxmf2: 1hxm F:124-230 [61378]
    Other proteins in same PDB: d1hxma1, d1hxmb1, d1hxmc1, d1hxmd1, d1hxme1, d1hxmf1, d1hxmg1, d1hxmh1
  4. Domain d1hxmh2: 1hxm H:124-230 [61382]
    Other proteins in same PDB: d1hxma1, d1hxmb1, d1hxmc1, d1hxmd1, d1hxme1, d1hxmf1, d1hxmg1, d1hxmh1
    complexed with so4
Human (Homo sapiens), gamma-chain [TaxId:9606] [63661] (1 PDB entry)
- Domains for 1hxm:
  1. Domain d1hxma2: 1hxm A:121-206 [61368]
    Other proteins in same PDB: d1hxma1, d1hxmb1, d1hxmc1, d1hxmd1, d1hxme1, d1hxmf1, d1hxmg1, d1hxmh1
  2. Domain d1hxmc2: 1hxm C:121-206 [61372]
    Other proteins in same PDB: d1hxma1, d1hxmb1, d1hxmc1, d1hxmd1, d1hxme1, d1hxmf1, d1hxmg1, d1hxmh1
  3. Domain d1hxme2: 1hxm E:121-206 [61376]
    Other proteins in same PDB: d1hxma1, d1hxmb1, d1hxmc1, d1hxmd1, d1hxme1, d1hxmf1, d1hxmg1, d1hxmh1
  4. Domain d1hxmg2: 1hxm G:121-206 [61380]
    Other proteins in same PDB: d1hxma1, d1hxmb1, d1hxmc1, d1hxmd1, d1hxme1, d1hxmf1, d1hxmg1, d1hxmh1
    complexed with so4
Mouse (Mus musculus), alpha-chain [TaxId:10090] [49126] (7 PDB entries)
1. Domains for 1g6r:
  1. Domain d1g6ra2: 1g6r A:118-213 [21554]
    Other proteins in same PDB: d1g6ra1, d1g6rb1, d1g6rc1, d1g6rd1, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
  2. Domain d1g6rc2: 1g6r C:118-213 [21555]
    Other proteins in same PDB: d1g6ra1, d1g6rb1, d1g6rc1, d1g6rd1, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
2. Domains for 1lp9:
  1. Domain d1lp9e2: 1lp9 E:118-198 [91087]
    Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e1, d1lp9f1, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l1, d1lp9m1
  2. Domain d1lp9l2: 1lp9 L:118-198 [91094]
    Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e1, d1lp9f1, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l1, d1lp9m1
3. Domains for 1mwa:
  1. Domain d1mwaa2: 1mwa A:118-213 [79559]
    Other proteins in same PDB: d1mwaa1, d1mwab1, d1mwac1, d1mwad1, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
  2. Domain d1mwac2: 1mwa C:118-213 [79563]
    Other proteins in same PDB: d1mwaa1, d1mwab1, d1mwac1, d1mwad1, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
    complexed with acy, gol, man, nag
4. Domains for 1nfd:
  1. Domain d1nfda2: 1nfd A:118-213 [21550]
    Other proteins in same PDB: d1nfda1, d1nfdb1, d1nfdc1, d1nfdd1, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
  2. Domain d1nfdc2: 1nfd C:118-213 [21551]
    Other proteins in same PDB: d1nfda1, d1nfdb1, d1nfdc1, d1nfdd1, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
    complexed with nag
5. Domain for 1tcr:
  - Domain d1tcra2: 1tcr A:118-213 [21549]
    Other proteins in same PDB: d1tcra1, d1tcrb1
    complexed with fuc, man, nag, so4
6. Domains for 2ckb:
  1. Domain d2ckba2: 2ckb A:118-213 [21552]
    Other proteins in same PDB: d2ckba1, d2ckbb1, d2ckbc1, d2ckbd1, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
  2. Domain d2ckbc2: 2ckb C:118-213 [21553]
    Other proteins in same PDB: d2ckba1, d2ckbb1, d2ckbc1, d2ckbd1, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
7. Domain for 2gj6:
  - Domain d2gj6d2: 2gj6 D:118-196 [135261]
    Other proteins in same PDB: d2gj6a1, d2gj6a2, d2gj6b1, d2gj6d1, d2gj6e1
    automatically matched to d1g6ra2
    complexed with 3ib, gol, so4; mutant
Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId:10090] [49128] (11 PDB entries)
1. Domain for 1bec:
  - Domain d1beca2: 1bec A:118-246 [21561]
    Other proteins in same PDB: d1beca1
    mutant
2. Domains for 1g6r:
  1. Domain d1g6rb2: 1g6r B:118-247 [21571]
    Other proteins in same PDB: d1g6ra1, d1g6rb1, d1g6rc1, d1g6rd1, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
  2. Domain d1g6rd2: 1g6r D:118-247 [21572]
    Other proteins in same PDB: d1g6ra1, d1g6rb1, d1g6rc1, d1g6rd1, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
3. Domains for 1jck:
  1. Domain d1jcka2: 1jck A:118-246 [21565]
    Other proteins in same PDB: d1jcka1, d1jckb1, d1jckb2, d1jckc1, d1jckd1, d1jckd2
  2. Domain d1jckc2: 1jck C:118-246 [21566]
    Other proteins in same PDB: d1jcka1, d1jckb1, d1jckb2, d1jckc1, d1jckd1, d1jckd2
    mutant
4. Domains for 1l0x:
  1. Domain d1l0xa2: 1l0x A:118-244 [73433]
    Other proteins in same PDB: d1l0xa1, d1l0xb1, d1l0xb2, d1l0xc1, d1l0xd1, d1l0xd2
  2. Domain d1l0xc2: 1l0x C:118-244 [73437]
    Other proteins in same PDB: d1l0xa1, d1l0xb1, d1l0xb2, d1l0xc1, d1l0xd1, d1l0xd2
    complexed with cry; mutant
5. Domains for 1l0y:
  1. Domain d1l0ya2: 1l0y A:118-244 [73441]
    Other proteins in same PDB: d1l0ya1, d1l0yb1, d1l0yb2, d1l0yc1, d1l0yd1, d1l0yd2
  2. Domain d1l0yc2: 1l0y C:118-244 [73445]
    Other proteins in same PDB: d1l0ya1, d1l0yb1, d1l0yb2, d1l0yc1, d1l0yd1, d1l0yd2
    complexed with cry, zn; mutant
6. Domains for 1lp9:
  1. Domain d1lp9f2: 1lp9 F:118-245 [91089]
    Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e1, d1lp9f1, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l1, d1lp9m1
  2. Domain d1lp9m2: 1lp9 M:118-245 [91096]
    Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e1, d1lp9f1, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l1, d1lp9m1
7. Domains for 1mwa:
  1. Domain d1mwab2: 1mwa B:118-247 [79561]
    Other proteins in same PDB: d1mwaa1, d1mwab1, d1mwac1, d1mwad1, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
  2. Domain d1mwad2: 1mwa D:118-247 [79565]
    Other proteins in same PDB: d1mwaa1, d1mwab1, d1mwac1, d1mwad1, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
    complexed with acy, gol, man, nag
8. Domains for 1nfd:
  1. Domain d1nfdb2: 1nfd B:118-247 [21567]
    Other proteins in same PDB: d1nfda1, d1nfdb1, d1nfdc1, d1nfdd1, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
  2. Domain d1nfdd2: 1nfd D:118-247 [21568]
    Other proteins in same PDB: d1nfda1, d1nfdb1, d1nfdc1, d1nfdd1, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
    complexed with nag
9. Domains for 1sbb:
  1. Domain d1sbba2: 1sbb A:118-246 [21562]
    Other proteins in same PDB: d1sbba1, d1sbbb1, d1sbbb2, d1sbbc1, d1sbbd1, d1sbbd2
  2. Domain d1sbbc2: 1sbb C:118-246 [21563]
    Other proteins in same PDB: d1sbba1, d1sbbb1, d1sbbb2, d1sbbc1, d1sbbd1, d1sbbd2
    mutant
10. Domain for 1tcr:
  - Domain d1tcrb2: 1tcr B:118-247 [21564]
    Other proteins in same PDB: d1tcra1, d1tcrb1
    complexed with fuc, man, nag, so4
11. Domains for 2ckb:
  1. Domain d2ckbb2: 2ckb B:118-247 [21569]
    Other proteins in same PDB: d2ckba1, d2ckbb1, d2ckbc1, d2ckbd1, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
  2. Domain d2ckbd2: 2ckb D:118-247 [21570]
    Other proteins in same PDB: d2ckba1, d2ckbb1, d2ckbc1, d2ckbd1, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_

More info for Protein T-cell antigen receptor from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like)

Timeline for Protein T-cell antigen receptor from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like):

Protein T-cell antigen receptor from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein T-cell antigen receptor from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in SCOP 1.71
Protein T-cell antigen receptor from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in SCOP 1.75
Protein T-cell antigen receptor from b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) appears in the current release, SCOPe 2.08