Lineage for Species: Human (Homo sapiens), beta-chain [TaxId: 9606]

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2344607Class b: All beta proteins [48724] (178 folds)
  3. 2344608Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (33 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 2344609Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families) (S)
  5. 2344610Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (33 protein domains)
  6. 2346965Protein T-cell antigen receptor [48933] (6 species)
    sequences may differ within each classified species
  7. 2346993Species Human (Homo sapiens), beta-chain [TaxId:9606] [48937] (29 PDB entries)

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens), beta-chain [TaxId: 9606]:

  1. Domain(s) for 1ao7:
  2. Domain(s) for 1bd2:
  3. Domain(s) for 1fyt:
  4. Domain(s) for 1j8h:
  5. Domain(s) for 1kgc:
  6. Domain(s) for 1ktk:
    1. 2347033Domain d1ktke1: 1ktk E:1-118 [72984]
      Other proteins in same PDB: d1ktka1, d1ktka2, d1ktkb1, d1ktkb2, d1ktkc1, d1ktkc2, d1ktkd1, d1ktkd2, d1ktke2, d1ktkf2
      vbeta2.1
    2. 2347034Domain d1ktkf1: 1ktk F:4-116 [72986]
      Other proteins in same PDB: d1ktka1, d1ktka2, d1ktkb1, d1ktkb2, d1ktkc1, d1ktkc2, d1ktkd1, d1ktkd2, d1ktke2, d1ktkf2
      vbeta2.1
  7. Domain(s) for 1mi5:
  8. Domain(s) for 1oga:
  9. Domain(s) for 1qrn:
  10. Domain(s) for 1qse:
  11. Domain(s) for 1qsf:
  12. Domain(s) for 1ymm:
  13. Domain(s) for 1zgl:
    1. 2347024Domain d1zglp1: 1zgl P:4-118 [125047]
      Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1bd2e1
    2. 2347025Domain d1zglr1: 1zgl R:4-118 [125049]
      Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1bd2e1
    3. 2347026Domain d1zglt1: 1zgl T:4-118 [125051]
      Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1bd2e1
    4. 2347027Domain d1zglv1: 1zgl V:4-118 [125053]
      Other proteins in same PDB: d1zgla1, d1zgla2, d1zglb1, d1zglb2, d1zgld1, d1zgld2, d1zgle1, d1zgle2, d1zglg1, d1zglg2, d1zglh1, d1zglh2, d1zglj1, d1zglj2, d1zglk1, d1zglk2, d1zglp2, d1zglp3, d1zglr2, d1zglr3, d1zglt2, d1zglt3, d1zglv2, d1zglv3
      automatically matched to d1bd2e1
  14. Domain(s) for 2ak4:
    1. 2347013Domain d2ak4e1: 2ak4 E:3-118 [144810]
      Other proteins in same PDB: d2ak4a1, d2ak4a2, d2ak4b_, d2ak4d2, d2ak4e2, d2ak4f1, d2ak4f2, d2ak4g_, d2ak4i2, d2ak4j2, d2ak4k1, d2ak4k2, d2ak4l_, d2ak4n2, d2ak4p2, d2ak4q1, d2ak4q2, d2ak4r_, d2ak4t2, d2ak4u2
      complexed with iod
    2. 2347014Domain d2ak4j1: 2ak4 J:3-118 [144814]
      Other proteins in same PDB: d2ak4a1, d2ak4a2, d2ak4b_, d2ak4d2, d2ak4e2, d2ak4f1, d2ak4f2, d2ak4g_, d2ak4i2, d2ak4j2, d2ak4k1, d2ak4k2, d2ak4l_, d2ak4n2, d2ak4p2, d2ak4q1, d2ak4q2, d2ak4r_, d2ak4t2, d2ak4u2
      automatically matched to 2AK4 E:3-118
      complexed with iod
    3. 2347015Domain d2ak4p1: 2ak4 P:3-118 [144818]
      Other proteins in same PDB: d2ak4a1, d2ak4a2, d2ak4b_, d2ak4d2, d2ak4e2, d2ak4f1, d2ak4f2, d2ak4g_, d2ak4i2, d2ak4j2, d2ak4k1, d2ak4k2, d2ak4l_, d2ak4n2, d2ak4p2, d2ak4q1, d2ak4q2, d2ak4r_, d2ak4t2, d2ak4u2
      automatically matched to 2AK4 E:3-118
      complexed with iod
    4. 2347016Domain d2ak4u1: 2ak4 U:3-118 [144822]
      Other proteins in same PDB: d2ak4a1, d2ak4a2, d2ak4b_, d2ak4d2, d2ak4e2, d2ak4f1, d2ak4f2, d2ak4g_, d2ak4i2, d2ak4j2, d2ak4k1, d2ak4k2, d2ak4l_, d2ak4n2, d2ak4p2, d2ak4q1, d2ak4q2, d2ak4r_, d2ak4t2, d2ak4u2
      automatically matched to 2AK4 E:3-118
      complexed with iod
  15. Domain(s) for 2bnq:
  16. Domain(s) for 2bnr:
  17. Domain(s) for 2bnu:
  18. Domain(s) for 2cde:
    1. 2347028Domain d2cdea1: 2cde A:2-115 [145027]
      Other proteins in same PDB: d2cdea2, d2cdeb2, d2cdec1, d2cdec2, d2cded2, d2cdee1, d2cdee2, d2cdef2
    2. 2347029Domain d2cdeb1: 2cde B:5-116 [130264]
      Other proteins in same PDB: d2cdea2, d2cdeb2, d2cdec1, d2cdec2, d2cded2, d2cdee1, d2cdee2, d2cdef2
      automatically matched to d1bd2e1
    3. 2347030Domain d2cded1: 2cde D:5-116 [130266]
      Other proteins in same PDB: d2cdea2, d2cdeb2, d2cdec1, d2cdec2, d2cded2, d2cdee1, d2cdee2, d2cdef2
      automatically matched to d1bd2e1
    4. 2347031Domain d2cdef1: 2cde F:5-116 [130268]
      Other proteins in same PDB: d2cdea2, d2cdeb2, d2cdec1, d2cdec2, d2cded2, d2cdee1, d2cdee2, d2cdef2
      automatically matched to d1bd2e1
  19. Domain(s) for 2esv:
  20. Domain(s) for 2f53:
  21. Domain(s) for 2f54:
    1. 2347011Domain d2f54e1: 2f54 E:1-112 [145144]
      Other proteins in same PDB: d2f54a1, d2f54a2, d2f54b2, d2f54b3, d2f54d2, d2f54e2, d2f54f1, d2f54f2, d2f54g2, d2f54g3, d2f54k2, d2f54l2
      automatically matched to 2BNQ E:2-113
    2. 2347012Domain d2f54l1: 2f54 L:1-112 [145148]
      Other proteins in same PDB: d2f54a1, d2f54a2, d2f54b2, d2f54b3, d2f54d2, d2f54e2, d2f54f1, d2f54f2, d2f54g2, d2f54g3, d2f54k2, d2f54l2
      automatically matched to 2BNQ E:2-113
  22. Domain(s) for 2gj6:
  23. Domain(s) for 2ij0:
    1. 2347004Domain d2ij0c1: 2ij0 C:1-117 [145525]
      Other proteins in same PDB: d2ij0a1, d2ij0a2, d2ij0b1, d2ij0b2
    2. 2347005Domain d2ij0e_: 2ij0 E: [145526]
      Other proteins in same PDB: d2ij0a1, d2ij0a2, d2ij0b1, d2ij0b2
      automated match to d2ij0c1
  24. Domain(s) for 2rcj:
    1. 2347035Domain d2rcja1: 2rcj A:11-116 [151890]
      Other proteins in same PDB: d2rcja2, d2rcjb2, d2rcje2, d2rcjf2, d2rcji2, d2rcjj2, d2rcjm2, d2rcjn2, d2rcjq2, d2rcjr2, d2rcju1
      automatically matched to d1ymme1
    2. 2347036Domain d2rcjb1: 2rcj B:11-116 [151892]
      Other proteins in same PDB: d2rcja2, d2rcjb2, d2rcje2, d2rcjf2, d2rcji2, d2rcjj2, d2rcjm2, d2rcjn2, d2rcjq2, d2rcjr2, d2rcju1
      automatically matched to d1ymme1
    3. 2347037Domain d2rcje1: 2rcj E:11-116 [151894]
      Other proteins in same PDB: d2rcja2, d2rcjb2, d2rcje2, d2rcjf2, d2rcji2, d2rcjj2, d2rcjm2, d2rcjn2, d2rcjq2, d2rcjr2, d2rcju1
      automatically matched to d1ymme1
    4. 2347038Domain d2rcjf1: 2rcj F:11-116 [151896]
      Other proteins in same PDB: d2rcja2, d2rcjb2, d2rcje2, d2rcjf2, d2rcji2, d2rcjj2, d2rcjm2, d2rcjn2, d2rcjq2, d2rcjr2, d2rcju1
      automatically matched to d1ymme1
    5. 2347039Domain d2rcji1: 2rcj I:11-116 [151898]
      Other proteins in same PDB: d2rcja2, d2rcjb2, d2rcje2, d2rcjf2, d2rcji2, d2rcjj2, d2rcjm2, d2rcjn2, d2rcjq2, d2rcjr2, d2rcju1
      automatically matched to d1ymme1
    6. 2347040Domain d2rcjj1: 2rcj J:11-116 [151900]
      Other proteins in same PDB: d2rcja2, d2rcjb2, d2rcje2, d2rcjf2, d2rcji2, d2rcjj2, d2rcjm2, d2rcjn2, d2rcjq2, d2rcjr2, d2rcju1
      automatically matched to d1ymme1
    7. 2347041Domain d2rcjm1: 2rcj M:11-116 [151902]
      Other proteins in same PDB: d2rcja2, d2rcjb2, d2rcje2, d2rcjf2, d2rcji2, d2rcjj2, d2rcjm2, d2rcjn2, d2rcjq2, d2rcjr2, d2rcju1
      automatically matched to d1ymme1
    8. 2347042Domain d2rcjn1: 2rcj N:11-116 [151904]
      Other proteins in same PDB: d2rcja2, d2rcjb2, d2rcje2, d2rcjf2, d2rcji2, d2rcjj2, d2rcjm2, d2rcjn2, d2rcjq2, d2rcjr2, d2rcju1
      automatically matched to d1ymme1
    9. 2347043Domain d2rcjq1: 2rcj Q:11-116 [151906]
      Other proteins in same PDB: d2rcja2, d2rcjb2, d2rcje2, d2rcjf2, d2rcji2, d2rcjj2, d2rcjm2, d2rcjn2, d2rcjq2, d2rcjr2, d2rcju1
      automatically matched to d1ymme1
    10. 2347044Domain d2rcjr1: 2rcj R:11-116 [151908]
      Other proteins in same PDB: d2rcja2, d2rcjb2, d2rcje2, d2rcjf2, d2rcji2, d2rcjj2, d2rcjm2, d2rcjn2, d2rcjq2, d2rcjr2, d2rcju1
      automatically matched to d1ymme1
  25. Domain(s) for 2vlj:
  26. Domain(s) for 2vlk:
  27. Domain(s) for 2vlr:
    1. 2347001Domain d2vlre1: 2vlr E:5-118 [153302]
      Other proteins in same PDB: d2vlra1, d2vlra2, d2vlrb2, d2vlrb3, d2vlre2, d2vlrf1, d2vlrf2, d2vlrg2, d2vlrg3, d2vlrj2
      automatically matched to d1ogae1
    2. 2347002Domain d2vlrj1: 2vlr J:5-118 [153307]
      Other proteins in same PDB: d2vlra1, d2vlra2, d2vlrb2, d2vlrb3, d2vlre2, d2vlrf1, d2vlrf2, d2vlrg2, d2vlrg3, d2vlrj2
      automatically matched to d1ogae1
  28. Domain(s) for 3kpr:
    1. 2347021Domain d3kpre1: 3kpr E:3-118 [199647]
      Other proteins in same PDB: d3kpra1, d3kpra2, d3kprb_, d3kprd2, d3kpre2, d3kprf1, d3kprf2, d3kprg_, d3kpri2, d3kprj2
      automated match to d1mi5e1
    2. 2347022Domain d3kprj1: 3kpr J:3-118 [199653]
      Other proteins in same PDB: d3kpra1, d3kpra2, d3kprb_, d3kprd2, d3kpre2, d3kprf1, d3kprf2, d3kprg_, d3kpri2, d3kprj2
      automated match to d1mi5e1
  29. Domain(s) for 3kps:

More info for Species Human (Homo sapiens), beta-chain [TaxId:9606] from b.1.1.1 T-cell antigen receptor

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