Lineage for Species: Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId: 10090]

  1. Root: SCOPe 2.02
  2. 1103260Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
  3. 1103261Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (28 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 1103262Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families) (S)
  5. 1103263Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (33 proteins)
  6. 1105447Protein T-cell antigen receptor [48933] (6 species)
    sequences may differ within each classified species
  7. 1105586Species Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId:10090] [48936] (27 PDB entries)

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId: 10090]:

  1. Domain(s) for 1bec:
  2. Domain(s) for 1bwm:
    • 1105629Domain d1bwma2: 1bwm A:3-116A [20643]
      single-chain construct of beta and alpha N-domains connected by a 27-residue linker
  3. Domain(s) for 1d9k:
    1. 1105627Domain d1d9kb_: 1d9k B: [20641]
      Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
      complexed with ndg
    2. 1105628Domain d1d9kf_: 1d9k F: [20642]
      Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
      complexed with ndg
  4. Domain(s) for 1fo0:
  5. Domain(s) for 1g6r:
    1. 1105625Domain d1g6rb1: 1g6r B:1-117 [20639]
      Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
    2. 1105626Domain d1g6rd1: 1g6r D:1-117 [20640]
      Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
  6. Domain(s) for 1jck:
    1. 1105621Domain d1jcka1: 1jck A:3-117 [20633]
      Other proteins in same PDB: d1jcka2, d1jckb1, d1jckb2, d1jckc2, d1jckd1, d1jckd2
    2. 1105622Domain d1jckc1: 1jck C:3-117 [20634]
      Other proteins in same PDB: d1jcka2, d1jckb1, d1jckb2, d1jckc2, d1jckd1, d1jckd2
  7. Domain(s) for 1kb5:
  8. Domain(s) for 1kj2:
    1. 1105608Domain d1kj2b_: 1kj2 B: [72560]
      Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
      complexed with nag
    2. 1105609Domain d1kj2e_: 1kj2 E: [72562]
      Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
      complexed with nag
  9. Domain(s) for 1l0x:
    1. 1105611Domain d1l0xa1: 1l0x A:3-117 [73432]
      Other proteins in same PDB: d1l0xa2, d1l0xb1, d1l0xb2, d1l0xc2, d1l0xd1, d1l0xd2
      complexed with gol
    2. 1105612Domain d1l0xc1: 1l0x C:3-117 [73436]
      Other proteins in same PDB: d1l0xa2, d1l0xb1, d1l0xb2, d1l0xc2, d1l0xd1, d1l0xd2
      complexed with gol
  10. Domain(s) for 1l0y:
    1. 1105595Domain d1l0ya1: 1l0y A:3-117 [73440]
      Other proteins in same PDB: d1l0ya2, d1l0yb1, d1l0yb2, d1l0yc2, d1l0yd1, d1l0yd2
      complexed with gol, zn
    2. 1105596Domain d1l0yc1: 1l0y C:3-117 [73444]
      Other proteins in same PDB: d1l0ya2, d1l0yb1, d1l0yb2, d1l0yc2, d1l0yd1, d1l0yd2
      complexed with gol, zn
  11. Domain(s) for 1lp9:
    1. 1105591Domain d1lp9f1: 1lp9 F:1-117 [91088]
      Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
    2. 1105592Domain d1lp9m1: 1lp9 M:1-117 [91095]
      Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
  12. Domain(s) for 1mwa:
    1. 1105617Domain d1mwab1: 1mwa B:1-117 [79560]
      Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
      complexed with acy, gol, nag
    2. 1105618Domain d1mwad1: 1mwa D:1-117 [79564]
      Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
      complexed with acy, gol, nag
  13. Domain(s) for 1nam:
  14. Domain(s) for 1nfd:
    1. 1105623Domain d1nfdb1: 1nfd B:1-117 [20635]
      Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
      complexed with nag, ndg
    2. 1105624Domain d1nfdd1: 1nfd D:1-117 [20636]
      Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
      complexed with nag, ndg
  15. Domain(s) for 1sbb:
    1. 1105598Domain d1sbba1: 1sbb A:3-117 [20628]
      Other proteins in same PDB: d1sbba2, d1sbbb1, d1sbbb2, d1sbbc2, d1sbbd1, d1sbbd2
    2. 1105599Domain d1sbbc1: 1sbb C:3-117 [20629]
      Other proteins in same PDB: d1sbba2, d1sbbb1, d1sbbb2, d1sbbc2, d1sbbd1, d1sbbd2
  16. Domain(s) for 1tcr:
  17. Domain(s) for 1u3h:
    1. 1105600Domain d1u3hb1: 1u3h B:3-117 [144384]
      Other proteins in same PDB: d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2
    2. 1105601Domain d1u3hf_: 1u3h F: [144386]
      Other proteins in same PDB: d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2
      automated match to d1u3hb1
  18. Domain(s) for 2aq2:
  19. Domain(s) for 2aq3:
  20. Domain(s) for 2ckb:
    1. 1105619Domain d2ckbb1: 2ckb B:1-117 [20637]
      Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
    2. 1105620Domain d2ckbd1: 2ckb D:1-117 [20638]
      Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
  21. Domain(s) for 2gj6:
  22. Domain(s) for 2icw:
  23. Domain(s) for 2j8u:
    1. 1105614Domain d2j8uf1: 2j8u F:1-117 [147922]
      Other proteins in same PDB: d2j8ua1, d2j8ua2, d2j8ub_, d2j8ue2, d2j8uf2, d2j8uh1, d2j8uh2, d2j8ui_, d2j8ul2, d2j8um2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant
    2. 1105615Domain d2j8um1: 2j8u M:1-117 [147929]
      Other proteins in same PDB: d2j8ua1, d2j8ua2, d2j8ub_, d2j8ue2, d2j8uf2, d2j8uh1, d2j8uh2, d2j8ui_, d2j8ul2, d2j8um2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant
  24. Domain(s) for 2jcc:
    1. 1105604Domain d2jccf1: 2jcc F:1-117 [147968]
      Other proteins in same PDB: d2jcca1, d2jcca2, d2jccb_, d2jcce2, d2jccf2, d2jcch1, d2jcch2, d2jcci_, d2jccl2, d2jccm2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant
    2. 1105605Domain d2jccm1: 2jcc M:1-117 [147975]
      Other proteins in same PDB: d2jcca1, d2jcca2, d2jccb_, d2jcce2, d2jccf2, d2jcch1, d2jcch2, d2jcci_, d2jccl2, d2jccm2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant
  25. Domain(s) for 2ol3:
  26. Domain(s) for 2q86:
    1. 1105589Domain d2q86b1: 2q86 B:3-111 [150120]
      Other proteins in same PDB: d2q86b2, d2q86d2
      automatically matched to d1g6rb1
      complexed with nag
    2. 1105590Domain d2q86d1: 2q86 D:3-111 [150122]
      Other proteins in same PDB: d2q86b2, d2q86d2
      automatically matched to d1g6rb1
      complexed with nag
  27. Domain(s) for 2uwe:
    1. 1105593Domain d2uwef1: 2uwe F:1-117 [152211]
      Other proteins in same PDB: d2uwea1, d2uwea2, d2uweb_, d2uwee2, d2uwef2, d2uweh1, d2uweh2, d2uwei_, d2uwel2, d2uwem2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant
    2. 1105594Domain d2uwem1: 2uwe M:1-117 [152218]
      Other proteins in same PDB: d2uwea1, d2uwea2, d2uweb_, d2uwee2, d2uwef2, d2uweh1, d2uweh2, d2uwei_, d2uwel2, d2uwem2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant

More info for Species Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId:10090] from b.1.1.1 T-cell antigen receptor

Timeline for Species Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId:10090] from b.1.1.1 T-cell antigen receptor: