Lineage for Species: Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId: 10090]

  1. Root: SCOP 1.75
  2. 781541Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
  3. 781542Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (28 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 781543Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 781544Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (32 proteins)
  6. 783727Protein T-cell antigen receptor [48933] (6 species)
    sequences may differ within each classified species
  7. 783866Species Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId:10090] [48936] (27 PDB entries)

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId: 10090]:

  1. Domain(s) for 1bec:
  2. Domain(s) for 1bwm:
    • 783913Domain d1bwma2: 1bwm A:3-116A [20643]
      single-chain construct of beta and alpha N-domains connected by a 27-residue linker
      mutant
  3. Domain(s) for 1d9k:
    1. 783911Domain d1d9kb_: 1d9k B: [20641]
      Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
    2. 783912Domain d1d9kf_: 1d9k F: [20642]
      Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
  4. Domain(s) for 1fo0:
  5. Domain(s) for 1g6r:
    1. 783905Domain d1g6rb1: 1g6r B:1-117 [20639]
      Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
    2. 783906Domain d1g6rd1: 1g6r D:1-117 [20640]
      Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
  6. Domain(s) for 1jck:
    1. 783903Domain d1jcka1: 1jck A:3-117 [20633]
      Other proteins in same PDB: d1jcka2, d1jckb1, d1jckb2, d1jckc2, d1jckd1, d1jckd2
    2. 783904Domain d1jckc1: 1jck C:3-117 [20634]
      Other proteins in same PDB: d1jcka2, d1jckb1, d1jckb2, d1jckc2, d1jckd1, d1jckd2
      mutant
  7. Domain(s) for 1kb5:
  8. Domain(s) for 1kj2:
    1. 783888Domain d1kj2b_: 1kj2 B: [72560]
      Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
    2. 783889Domain d1kj2e_: 1kj2 E: [72562]
      Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
      complexed with gal, man, nag, sia
  9. Domain(s) for 1l0x:
    1. 783892Domain d1l0xa1: 1l0x A:3-117 [73432]
      Other proteins in same PDB: d1l0xa2, d1l0xb1, d1l0xb2, d1l0xc2, d1l0xd1, d1l0xd2
    2. 783893Domain d1l0xc1: 1l0x C:3-117 [73436]
      Other proteins in same PDB: d1l0xa2, d1l0xb1, d1l0xb2, d1l0xc2, d1l0xd1, d1l0xd2
      complexed with cry; mutant
  10. Domain(s) for 1l0y:
    1. 783877Domain d1l0ya1: 1l0y A:3-117 [73440]
      Other proteins in same PDB: d1l0ya2, d1l0yb1, d1l0yb2, d1l0yc2, d1l0yd1, d1l0yd2
    2. 783878Domain d1l0yc1: 1l0y C:3-117 [73444]
      Other proteins in same PDB: d1l0ya2, d1l0yb1, d1l0yb2, d1l0yc2, d1l0yd1, d1l0yd2
      complexed with cry, zn; mutant
  11. Domain(s) for 1lp9:
    1. 783871Domain d1lp9f1: 1lp9 F:1-117 [91088]
      Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
    2. 783872Domain d1lp9m1: 1lp9 M:1-117 [91095]
      Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
  12. Domain(s) for 1mwa:
    1. 783899Domain d1mwab1: 1mwa B:1-117 [79560]
      Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
    2. 783900Domain d1mwad1: 1mwa D:1-117 [79564]
      Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
      complexed with acy, gol, man, nag
  13. Domain(s) for 1nam:
  14. Domain(s) for 1nfd:
    1. 783909Domain d1nfdb1: 1nfd B:1-117 [20635]
      Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
    2. 783910Domain d1nfdd1: 1nfd D:1-117 [20636]
      Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
      complexed with nag
  15. Domain(s) for 1sbb:
    1. 783875Domain d1sbba1: 1sbb A:3-117 [20628]
      Other proteins in same PDB: d1sbba2, d1sbbb1, d1sbbb2, d1sbbc2, d1sbbd1, d1sbbd2
    2. 783876Domain d1sbbc1: 1sbb C:3-117 [20629]
      Other proteins in same PDB: d1sbba2, d1sbbb1, d1sbbb2, d1sbbc2, d1sbbd1, d1sbbd2
      mutant
  16. Domain(s) for 1tcr:
  17. Domain(s) for 1u3h:
    1. 783879Domain d1u3hb1: 1u3h B:3-117 [144384]
      Other proteins in same PDB: d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2
      mutant
    2. 783880Domain d1u3hf1: 1u3h F:3-117 [144386]
      Other proteins in same PDB: d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2
      automatically matched to 1U3H B:3-117
      mutant
  18. Domain(s) for 2aq2:
  19. Domain(s) for 2aq3:
    1. 783895Domain d2aq3a1: 2aq3 A:2-117 [144825]
      Other proteins in same PDB: d2aq3b1, d2aq3b2, d2aq3d1, d2aq3d2, d2aq3f1, d2aq3f2, d2aq3h1, d2aq3h2
      mutant
    2. 783896Domain d2aq3c1: 2aq3 C:2-117 [144826]
      Other proteins in same PDB: d2aq3b1, d2aq3b2, d2aq3d1, d2aq3d2, d2aq3f1, d2aq3f2, d2aq3h1, d2aq3h2
      automatically matched to 2AQ3 A:2-117
      mutant
    3. 783897Domain d2aq3e1: 2aq3 E:2-117 [144827]
      Other proteins in same PDB: d2aq3b1, d2aq3b2, d2aq3d1, d2aq3d2, d2aq3f1, d2aq3f2, d2aq3h1, d2aq3h2
      automatically matched to 2AQ3 A:2-117
      mutant
    4. 783898Domain d2aq3g1: 2aq3 G:2-117 [144828]
      Other proteins in same PDB: d2aq3b1, d2aq3b2, d2aq3d1, d2aq3d2, d2aq3f1, d2aq3f2, d2aq3h1, d2aq3h2
      automatically matched to 2AQ3 A:2-117
      mutant
  20. Domain(s) for 2ckb:
    1. 783907Domain d2ckbb1: 2ckb B:1-117 [20637]
      Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
    2. 783908Domain d2ckbd1: 2ckb D:1-117 [20638]
      Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
  21. Domain(s) for 2gj6:
  22. Domain(s) for 2icw:
    1. 783883Domain d2icwj1: 2icw J:1-113 [145521]
      Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg1, d2icwh1
      mutant
    2. 783884Domain d2icwl1: 2icw L:3-113 [145522]
      Other proteins in same PDB: d2icwa1, d2icwa2, d2icwb1, d2icwb2, d2icwd1, d2icwd2, d2icwe1, d2icwe2, d2icwg1, d2icwh1
      automatically matched to 2ICW J:1-113
      mutant
  23. Domain(s) for 2j8u:
    1. 783890Domain d2j8uf1: 2j8u F:1-117 [147922]
      Other proteins in same PDB: d2j8ua1, d2j8ua2, d2j8ub1, d2j8ue2, d2j8uf2, d2j8uh1, d2j8uh2, d2j8ui1, d2j8ul2, d2j8um2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant
    2. 783891Domain d2j8um1: 2j8u M:1-117 [147929]
      Other proteins in same PDB: d2j8ua1, d2j8ua2, d2j8ub1, d2j8ue2, d2j8uf2, d2j8uh1, d2j8uh2, d2j8ui1, d2j8ul2, d2j8um2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant
  24. Domain(s) for 2jcc:
    1. 783881Domain d2jccf1: 2jcc F:1-117 [147968]
      Other proteins in same PDB: d2jcca1, d2jcca2, d2jccb1, d2jcce2, d2jccf2, d2jcch1, d2jcch2, d2jcci1, d2jccl2, d2jccm2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant
    2. 783882Domain d2jccm1: 2jcc M:1-117 [147975]
      Other proteins in same PDB: d2jcca1, d2jcca2, d2jccb1, d2jcce2, d2jccf2, d2jcch1, d2jcch2, d2jcci1, d2jccl2, d2jccm2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant
  25. Domain(s) for 2ol3:
  26. Domain(s) for 2q86:
    1. 783868Domain d2q86b1: 2q86 B:3-111 [150120]
      Other proteins in same PDB: d2q86b2, d2q86d2
      automatically matched to d1g6rb1
      complexed with bma, fuc, man, nag; mutant
    2. 783869Domain d2q86d1: 2q86 D:3-111 [150122]
      Other proteins in same PDB: d2q86b2, d2q86d2
      automatically matched to d1g6rb1
      complexed with bma, fuc, man, nag; mutant
  27. Domain(s) for 2uwe:
    1. 783873Domain d2uwef1: 2uwe F:1-117 [152211]
      Other proteins in same PDB: d2uwea1, d2uwea2, d2uweb1, d2uwee2, d2uwef2, d2uweh1, d2uweh2, d2uwei1, d2uwel2, d2uwem2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant
    2. 783874Domain d2uwem1: 2uwe M:1-117 [152218]
      Other proteins in same PDB: d2uwea1, d2uwea2, d2uweb1, d2uwee2, d2uwef2, d2uweh1, d2uweh2, d2uwei1, d2uwel2, d2uwem2
      automatically matched to d1lp9f1
      mutant

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Timeline for Species Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId:10090] from b.1.1.1 T-cell antigen receptor: