Lineage for Species: Mouse (Mus musculus), alpha-chain [TaxId: 10090]

  1. Root: SCOP 1.75
  2. 781541Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
  3. 781542Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (28 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 781543Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 781544Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (32 proteins)
  6. 783727Protein T-cell antigen receptor [48933] (6 species)
    sequences may differ within each classified species
  7. 783828Species Mouse (Mus musculus), alpha-chain [TaxId:10090] [48934] (21 PDB entries)

PDB entries in Species: Mouse (Mus musculus), alpha-chain [TaxId: 10090]:

  1. Domain(s) for 1ac6:
    1. 783835Domain d1ac6a_: 1ac6 A: [20606]
    2. 783836Domain d1ac6b_: 1ac6 B: [20607]
      mutant
  2. Domain(s) for 1b88:
    1. 783845Domain d1b88a_: 1b88 A: [20608]
    2. 783846Domain d1b88b_: 1b88 B: [20609]
  3. Domain(s) for 1bwm:
    • 783865Domain d1bwma1: 1bwm A:301-417 [20620]
      single-chain construct of beta and alpha N-domains connected by a 27-residue linker
      mutant
  4. Domain(s) for 1d9k:
    1. 783863Domain d1d9ka_: 1d9k A: [20618]
      Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
    2. 783864Domain d1d9ke_: 1d9k E: [20619]
      Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
  5. Domain(s) for 1fo0:
  6. Domain(s) for 1g6r:
    1. 783857Domain d1g6ra1: 1g6r A:1-117 [20616]
      Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
    2. 783858Domain d1g6rc1: 1g6r C:1-117 [20617]
      Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
  7. Domain(s) for 1h5b:
    1. 783829Domain d1h5ba_: 1h5b A: [60638]
      AV11S5-AJ17
    2. 783830Domain d1h5bb_: 1h5b B: [60639]
      AV11S5-AJ17
    3. 783831Domain d1h5bc_: 1h5b C: [60640]
      AV11S5-AJ17
    4. 783832Domain d1h5bd_: 1h5b D: [60641]
      AV11S5-AJ17
      complexed with cl, gol
  8. Domain(s) for 1i9e:
  9. Domain(s) for 1kb5:
  10. Domain(s) for 1kj2:
    1. 783848Domain d1kj2a_: 1kj2 A: [72559]
      Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
    2. 783849Domain d1kj2d_: 1kj2 D: [72561]
      Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
      complexed with gal, man, nag, sia
  11. Domain(s) for 1lp9:
    1. 783833Domain d1lp9e1: 1lp9 E:0-117 [91086]
      Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
    2. 783834Domain d1lp9l1: 1lp9 L:0-117 [91093]
      Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
  12. Domain(s) for 1mwa:
    1. 783853Domain d1mwaa1: 1mwa A:1-117 [79558]
      Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
    2. 783854Domain d1mwac1: 1mwa C:1-117 [79562]
      Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
      complexed with acy, gol, man, nag
  13. Domain(s) for 1nam:
  14. Domain(s) for 1nfd:
    1. 783861Domain d1nfda1: 1nfd A:1-117 [20612]
      Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
    2. 783862Domain d1nfdc1: 1nfd C:1-117 [20613]
      Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
      complexed with nag
  15. Domain(s) for 1tcr:
  16. Domain(s) for 1u3h:
    1. 783839Domain d1u3ha1: 1u3h A:2-116 [144383]
      Other proteins in same PDB: d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2
      mutant
    2. 783840Domain d1u3he1: 1u3h E:2-116 [144385]
      Other proteins in same PDB: d1u3hc1, d1u3hc2, d1u3hd1, d1u3hd2, d1u3hg1, d1u3hg2, d1u3hh1, d1u3hh2
      automatically matched to 1U3H A:2-116
      mutant
  17. Domain(s) for 2ckb:
    1. 783859Domain d2ckba1: 2ckb A:1-117 [20614]
      Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
    2. 783860Domain d2ckbc1: 2ckb C:1-117 [20615]
      Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
  18. Domain(s) for 2j8u:
    1. 783850Domain d2j8ue1: 2j8u E:0-117 [147920]
      Other proteins in same PDB: d2j8ua1, d2j8ua2, d2j8ub1, d2j8ue2, d2j8uf2, d2j8uh1, d2j8uh2, d2j8ui1, d2j8ul2, d2j8um2
      automatically matched to d1lp9e1
      mutant
    2. 783851Domain d2j8ul1: 2j8u L:0-117 [147927]
      Other proteins in same PDB: d2j8ua1, d2j8ua2, d2j8ub1, d2j8ue2, d2j8uf2, d2j8uh1, d2j8uh2, d2j8ui1, d2j8ul2, d2j8um2
      automatically matched to d1lp9e1
      mutant
  19. Domain(s) for 2jcc:
    1. 783841Domain d2jcce1: 2jcc E:0-117 [147966]
      Other proteins in same PDB: d2jcca1, d2jcca2, d2jccb1, d2jcce2, d2jccf2, d2jcch1, d2jcch2, d2jcci1, d2jccl2, d2jccm2
      automatically matched to d1lp9e1
      mutant
    2. 783842Domain d2jccl1: 2jcc L:0-117 [147973]
      Other proteins in same PDB: d2jcca1, d2jcca2, d2jccb1, d2jcce2, d2jccf2, d2jcch1, d2jcch2, d2jcci1, d2jccl2, d2jccm2
      automatically matched to d1lp9e1
      mutant
  20. Domain(s) for 2ol3:
  21. Domain(s) for 2uwe:
    1. 783837Domain d2uwee1: 2uwe E:0-117 [152209]
      Other proteins in same PDB: d2uwea1, d2uwea2, d2uweb1, d2uwee2, d2uwef2, d2uweh1, d2uweh2, d2uwei1, d2uwel2, d2uwem2
      automatically matched to d1lp9e1
      mutant
    2. 783838Domain d2uwel1: 2uwe L:0-117 [152216]
      Other proteins in same PDB: d2uwea1, d2uwea2, d2uweb1, d2uwee2, d2uwef2, d2uweh1, d2uweh2, d2uwei1, d2uwel2, d2uwem2
      automatically matched to d1lp9e1
      mutant

More info for Species Mouse (Mus musculus), alpha-chain [TaxId:10090] from b.1.1.1 T-cell antigen receptor

Timeline for Species Mouse (Mus musculus), alpha-chain [TaxId:10090] from b.1.1.1 T-cell antigen receptor: