Lineage for Protein: T-cell antigen receptor

  1. Root: SCOP 1.71
  2. 546417Class b: All beta proteins [48724] (149 folds)
  3. 546418Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (25 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 546419Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (4 families) (S)
  5. 546420Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (28 proteins)
  6. 548189Protein T-cell antigen receptor [48933] (6 species)
    sequences may differ within each classified species

Species:

  1. 548190Human (Homo sapiens), alpha-chain [TaxId:9606] [48935] (10 PDB entries)
    1. Domain for 1ao7:
    2. Domain for 1bd2:
    3. Domain for 1fyt:
    4. Domain for 1j8h:
    5. Domain for 1kgc:
    6. Domain for 1mi5:
    7. Domain for 1oga:
    8. Domain for 1qrn:
    9. Domain for 1qse:
    10. Domain for 1qsf:
  2. 548201Human (Homo sapiens), beta-chain [TaxId:9606] [48937] (11 PDB entries)
    1. Domain for 1ao7:
    2. Domain for 1bd2:
    3. Domain for 1fyt:
    4. Domain for 1j8h:
    5. Domain for 1kgc:
    6. Domains for 1ktk:
      1. 548211Domain d1ktke1: 1ktk E:1-118 [72984]
        Other proteins in same PDB: d1ktka1, d1ktka2, d1ktkb1, d1ktkb2, d1ktkc1, d1ktkc2, d1ktkd1, d1ktkd2, d1ktke2, d1ktkf2
      2. 548212Domain d1ktkf1: 1ktk F:4-116 [72986]
        Other proteins in same PDB: d1ktka1, d1ktka2, d1ktkb1, d1ktkb2, d1ktkc1, d1ktkc2, d1ktkd1, d1ktkd2, d1ktke2, d1ktkf2
        vbeta2.1
        mutant
    7. Domain for 1mi5:
    8. Domain for 1oga:
    9. Domain for 1qrn:
    10. Domain for 1qse:
    11. Domain for 1qsf:
  3. 548214Human (Homo sapiens), delta-chain [TaxId:9606] [48938] (2 PDB entries)
    1. Domains for 1hxm:
      1. 548217Domain d1hxmb1: 1hxm B:1-123 [61369]
        Other proteins in same PDB: d1hxma2, d1hxmb2, d1hxmc2, d1hxmd2, d1hxme2, d1hxmf2, d1hxmg2, d1hxmh2
      2. 548218Domain d1hxmd1: 1hxm D:1-123 [61373]
        Other proteins in same PDB: d1hxma2, d1hxmb2, d1hxmc2, d1hxmd2, d1hxme2, d1hxmf2, d1hxmg2, d1hxmh2
      3. 548219Domain d1hxmf1: 1hxm F:1-123 [61377]
        Other proteins in same PDB: d1hxma2, d1hxmb2, d1hxmc2, d1hxmd2, d1hxme2, d1hxmf2, d1hxmg2, d1hxmh2
      4. 548220Domain d1hxmh1: 1hxm H:1-123 [61381]
        Other proteins in same PDB: d1hxma2, d1hxmb2, d1hxmc2, d1hxmd2, d1hxme2, d1hxmf2, d1hxmg2, d1hxmh2
        complexed with so4
    2. Domains for 1tvd:
      1. 548215Domain d1tvda_: 1tvd A: [20650]
      2. 548216Domain d1tvdb_: 1tvd B: [20651]
  4. 548221Human (Homo sapiens), gamma-chain [TaxId:9606] [63651] (1 PDB entry)
  5. 548226Mouse (Mus musculus), alpha-chain [TaxId:10090] [48934] (16 PDB entries)
    1. Domains for 1ac6:
      1. 548233Domain d1ac6a_: 1ac6 A: [20606]
      2. 548234Domain d1ac6b_: 1ac6 B: [20607]
        mutant
    2. Domains for 1b88:
      1. 548236Domain d1b88a_: 1b88 A: [20608]
      2. 548237Domain d1b88b_: 1b88 B: [20609]
    3. Domain for 1bwm:
      • 548254Domain d1bwma1: 1bwm A:301-417 [20620]
        single-chain construct of beta and alpha N-domains connected by a 27-residue linker
        mutant
    4. Domains for 1d9k:
      1. 548252Domain d1d9ka_: 1d9k A: [20618]
        Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
      2. 548253Domain d1d9ke_: 1d9k E: [20619]
        Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
    5. Domain for 1fo0:
    6. Domains for 1g6r:
      1. 548250Domain d1g6ra1: 1g6r A:1-117 [20616]
        Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
      2. 548251Domain d1g6rc1: 1g6r C:1-117 [20617]
        Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
    7. Domains for 1h5b:
      1. 548227Domain d1h5ba_: 1h5b A: [60638]
      2. 548228Domain d1h5bb_: 1h5b B: [60639]
      3. 548229Domain d1h5bc_: 1h5b C: [60640]
      4. 548230Domain d1h5bd_: 1h5b D: [60641]
        AV11S5-AJ17
        complexed with cl, gol
    8. Domain for 1i9e:
    9. Domain for 1kb5:
    10. Domains for 1kj2:
      1. 548240Domain d1kj2a_: 1kj2 A: [72559]
        Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
      2. 548241Domain d1kj2d_: 1kj2 D: [72561]
        Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
        complexed with gal, man, nag, sia
    11. Domains for 1lp9:
      1. 548231Domain d1lp9e1: 1lp9 E:0-117 [91086]
        Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
      2. 548232Domain d1lp9l1: 1lp9 L:0-117 [91093]
        Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
    12. Domains for 1mwa:
      1. 548243Domain d1mwaa1: 1mwa A:1-117 [79558]
        Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
      2. 548244Domain d1mwac1: 1mwa C:1-117 [79562]
        Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
        complexed with acy, gol, man, nag
    13. Domain for 1nam:
    14. Domains for 1nfd:
      1. 548246Domain d1nfda1: 1nfd A:1-117 [20612]
        Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
      2. 548247Domain d1nfdc1: 1nfd C:1-117 [20613]
        Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
        complexed with nag
    15. Domain for 1tcr:
    16. Domains for 2ckb:
      1. 548248Domain d2ckba1: 2ckb A:1-117 [20614]
        Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
      2. 548249Domain d2ckbc1: 2ckb C:1-117 [20615]
        Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
  6. 548255Mouse (Mus musculus), beta-chain [TaxId:10090] [48936] (17 PDB entries)
    1. Domain for 1bec:
    2. Domain for 1bwm:
      • 548283Domain d1bwma2: 1bwm A:3-116A [20643]
        single-chain construct of beta and alpha N-domains connected by a 27-residue linker
        mutant
    3. Domains for 1d9k:
      1. 548281Domain d1d9kb_: 1d9k B: [20641]
        Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
      2. 548282Domain d1d9kf_: 1d9k F: [20642]
        Other proteins in same PDB: d1d9kc1, d1d9kc2, d1d9kd1, d1d9kd2, d1d9kg1, d1d9kg2, d1d9kh1, d1d9kh2
    4. Domain for 1fo0:
    5. Domains for 1g6r:
      1. 548279Domain d1g6rb1: 1g6r B:1-117 [20639]
        Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
      2. 548280Domain d1g6rd1: 1g6r D:1-117 [20640]
        Other proteins in same PDB: d1g6ra2, d1g6rb2, d1g6rc2, d1g6rd2, d1g6rh1, d1g6rh2, d1g6ri1, d1g6ri2, d1g6rl_, d1g6rm_
    6. Domains for 1jck:
      1. 548273Domain d1jcka1: 1jck A:3-117 [20633]
        Other proteins in same PDB: d1jcka2, d1jckb1, d1jckb2, d1jckc2, d1jckd1, d1jckd2
      2. 548274Domain d1jckc1: 1jck C:3-117 [20634]
        Other proteins in same PDB: d1jcka2, d1jckb1, d1jckb2, d1jckc2, d1jckd1, d1jckd2
        mutant
    7. Domain for 1kb5:
    8. Domains for 1kj2:
      1. 548265Domain d1kj2b_: 1kj2 B: [72560]
        Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
      2. 548266Domain d1kj2e_: 1kj2 E: [72562]
        Other proteins in same PDB: d1kj2h1, d1kj2h2, d1kj2i1, d1kj2i2, d1kj2l_, d1kj2m_
        complexed with gal, man, nag, sia
    9. Domains for 1l0x:
      1. 548268Domain d1l0xa1: 1l0x A:3-117 [73432]
        Other proteins in same PDB: d1l0xa2, d1l0xb1, d1l0xb2, d1l0xc2, d1l0xd1, d1l0xd2
      2. 548269Domain d1l0xc1: 1l0x C:3-117 [73436]
        Other proteins in same PDB: d1l0xa2, d1l0xb1, d1l0xb2, d1l0xc2, d1l0xd1, d1l0xd2
        complexed with cry; mutant
    10. Domains for 1l0y:
      1. 548259Domain d1l0ya1: 1l0y A:3-117 [73440]
        Other proteins in same PDB: d1l0ya2, d1l0yb1, d1l0yb2, d1l0yc2, d1l0yd1, d1l0yd2
      2. 548260Domain d1l0yc1: 1l0y C:3-117 [73444]
        Other proteins in same PDB: d1l0ya2, d1l0yb1, d1l0yb2, d1l0yc2, d1l0yd1, d1l0yd2
        complexed with cry, zn; mutant
    11. Domains for 1lp9:
      1. 548257Domain d1lp9f1: 1lp9 F:1-117 [91088]
        Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
      2. 548258Domain d1lp9m1: 1lp9 M:1-117 [91095]
        Other proteins in same PDB: d1lp9a1, d1lp9a2, d1lp9b_, d1lp9e2, d1lp9f2, d1lp9h1, d1lp9h2, d1lp9i_, d1lp9l2, d1lp9m2
    12. Domains for 1mwa:
      1. 548270Domain d1mwab1: 1mwa B:1-117 [79560]
        Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
      2. 548271Domain d1mwad1: 1mwa D:1-117 [79564]
        Other proteins in same PDB: d1mwaa2, d1mwab2, d1mwac2, d1mwad2, d1mwah1, d1mwah2, d1mwai1, d1mwai2, d1mwal_, d1mwam_
        complexed with acy, gol, man, nag
    13. Domain for 1nam:
    14. Domains for 1nfd:
      1. 548275Domain d1nfdb1: 1nfd B:1-117 [20635]
        Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
      2. 548276Domain d1nfdd1: 1nfd D:1-117 [20636]
        Other proteins in same PDB: d1nfda2, d1nfdb2, d1nfdc2, d1nfdd2, d1nfde1, d1nfde2, d1nfdf1, d1nfdf2, d1nfdg1, d1nfdg2, d1nfdh1, d1nfdh2
        complexed with nag
    15. Domains for 1sbb:
      1. 548261Domain d1sbba1: 1sbb A:3-117 [20628]
        Other proteins in same PDB: d1sbba2, d1sbbb1, d1sbbb2, d1sbbc2, d1sbbd1, d1sbbd2
      2. 548262Domain d1sbbc1: 1sbb C:3-117 [20629]
        Other proteins in same PDB: d1sbba2, d1sbbb1, d1sbbb2, d1sbbc2, d1sbbd1, d1sbbd2
        mutant
    16. Domain for 1tcr:
    17. Domains for 2ckb:
      1. 548277Domain d2ckbb1: 2ckb B:1-117 [20637]
        Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_
      2. 548278Domain d2ckbd1: 2ckb D:1-117 [20638]
        Other proteins in same PDB: d2ckba2, d2ckbb2, d2ckbc2, d2ckbd2, d2ckbh1, d2ckbh2, d2ckbi1, d2ckbi2, d2ckbl_, d2ckbm_

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