SCOPe 2.08: Protein: DNA helicase RuvA subunit, middle domain

Lineage for Protein: DNA helicase RuvA subunit, middle domain

Root: SCOPe 2.08
Class a: All alpha proteins [46456] (290 folds)
Fold a.60: SAM domain-like [47768] (17 superfamilies)
4-5 helices; bundle of two orthogonally packed alpha-hairpins; involved in the interactions with DNA and proteins
Superfamily a.60.2: RuvA domain 2-like [47781] (7 families)
duplication: contains two helix-hairpin-helix (HhH) motifs
Family a.60.2.1: DNA helicase RuvA subunit, middle domain [47782] (1 protein)
Protein DNA helicase RuvA subunit, middle domain [47783] (3 species)
tetramer; binds Holliday junction

Species:

Escherichia coli [TaxId:562] [47784] (5 PDB entries)
1. Domains for 1bdx:
  1. Domain d1bdxa2: 1bdx A:65-142 [17951]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa1, d1bdxa3, d1bdxb1, d1bdxb3, d1bdxc1, d1bdxc3, d1bdxd1, d1bdxd3
    protein/DNA complex
  2. Domain d1bdxb2: 1bdx B:65-142 [17952]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa1, d1bdxa3, d1bdxb1, d1bdxb3, d1bdxc1, d1bdxc3, d1bdxd1, d1bdxd3
    protein/DNA complex
  3. Domain d1bdxc2: 1bdx C:65-142 [17953]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa1, d1bdxa3, d1bdxb1, d1bdxb3, d1bdxc1, d1bdxc3, d1bdxd1, d1bdxd3
    protein/DNA complex
  4. Domain d1bdxd2: 1bdx D:65-142 [17954]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa1, d1bdxa3, d1bdxb1, d1bdxb3, d1bdxc1, d1bdxc3, d1bdxd1, d1bdxd3
    protein/DNA complex
2. Domain for 1c7y:
  - Domain d1c7ya2: 1c7y A:65-150 [17950]
    Other proteins in same PDB: d1c7ya1, d1c7ya3
    protein/DNA complex
3. Domain for 1cuk:
  - Domain d1cuka2: 1cuk A:65-142 [17946]
    Other proteins in same PDB: d1cuka1, d1cuka3
4. Domains for 1d8l:
  1. Domain d1d8la1: 1d8l A:65-140 [17948]
    Other proteins in same PDB: d1d8la2, d1d8lb2
  2. Domain d1d8lb1: 1d8l B:65-140 [17949]
    Other proteins in same PDB: d1d8la2, d1d8lb2
5. Domain for 1hjp:
  - Domain d1hjpa2: 1hjp A:65-140 [17947]
    Other proteins in same PDB: d1hjpa1, d1hjpa3

Mycobacterium leprae [TaxId:1769] [47785] (1 PDB entry)

Domains for 1bvs:

Domain d1bvsa2: 1bvs A:64-134 [17955]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa3, d1bvsb1, d1bvsb3, d1bvsc1, d1bvsc3, d1bvsd1, d1bvsd3, d1bvse1, d1bvse3, d1bvsf1, d1bvsf3, d1bvsg1, d1bvsg3, d1bvsh1, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsb2: 1bvs B:64-133 [17956]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa3, d1bvsb1, d1bvsb3, d1bvsc1, d1bvsc3, d1bvsd1, d1bvsd3, d1bvse1, d1bvse3, d1bvsf1, d1bvsf3, d1bvsg1, d1bvsg3, d1bvsh1, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsc2: 1bvs C:64-134 [17957]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa3, d1bvsb1, d1bvsb3, d1bvsc1, d1bvsc3, d1bvsd1, d1bvsd3, d1bvse1, d1bvse3, d1bvsf1, d1bvsf3, d1bvsg1, d1bvsg3, d1bvsh1, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsd2: 1bvs D:64-133 [17958]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa3, d1bvsb1, d1bvsb3, d1bvsc1, d1bvsc3, d1bvsd1, d1bvsd3, d1bvse1, d1bvse3, d1bvsf1, d1bvsf3, d1bvsg1, d1bvsg3, d1bvsh1, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvse2: 1bvs E:64-134 [17959]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa3, d1bvsb1, d1bvsb3, d1bvsc1, d1bvsc3, d1bvsd1, d1bvsd3, d1bvse1, d1bvse3, d1bvsf1, d1bvsf3, d1bvsg1, d1bvsg3, d1bvsh1, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsf2: 1bvs F:64-133 [17960]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa3, d1bvsb1, d1bvsb3, d1bvsc1, d1bvsc3, d1bvsd1, d1bvsd3, d1bvse1, d1bvse3, d1bvsf1, d1bvsf3, d1bvsg1, d1bvsg3, d1bvsh1, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsg2: 1bvs G:64-134 [17961]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa3, d1bvsb1, d1bvsb3, d1bvsc1, d1bvsc3, d1bvsd1, d1bvsd3, d1bvse1, d1bvse3, d1bvsf1, d1bvsf3, d1bvsg1, d1bvsg3, d1bvsh1, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsh2: 1bvs H:64-133 [17962]
Other proteins in same PDB: d1bvsa1, d1bvsa3, d1bvsb1, d1bvsb3, d1bvsc1, d1bvsc3, d1bvsd1, d1bvsd3, d1bvse1, d1bvse3, d1bvsf1, d1bvsf3, d1bvsg1, d1bvsg3, d1bvsh1, d1bvsh3
protein/DNA complex

Thermus thermophilus [TaxId:274] [81794] (1 PDB entry)
- Domains for 1ixr:
  1. Domain d1ixra1: 1ixr A:63-135 [76925]
    Other proteins in same PDB: d1ixra2, d1ixrb1, d1ixrb3, d1ixrc1, d1ixrc2
    complexed with anp
  2. Domain d1ixrb2: 1ixr B:63-138 [76928]
    Other proteins in same PDB: d1ixra2, d1ixrb1, d1ixrb3, d1ixrc1, d1ixrc2
    complexed with anp

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Protein DNA helicase RuvA subunit, middle domain from a.60.2.1: DNA helicase RuvA subunit, middle domain first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein DNA helicase RuvA subunit, middle domain from a.60.2.1: DNA helicase RuvA subunit, middle domain appears in SCOPe 2.07