SCOP 1.75: Species: African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId: 8355]

Lineage for Species: African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId: 8355]

Root: SCOP 1.75
Class a: All alpha proteins [46456] (284 folds)
Fold a.22: Histone-fold [47112] (1 superfamily)
core: 3 helices; long middle helix is flanked at each end with shorter ones
Superfamily a.22.1: Histone-fold [47113] (4 families)
Family a.22.1.1: Nucleosome core histones [47114] (5 proteins)
form octamers composed of two copies of each of the four histones
Protein Histone H4 [47125] (5 species)
Species African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] [47127] (33 PDB entries)

PDB entries in Species: African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId: 8355]:

Domain(s) for 1aoi:
1. Domain d1aoib_: 1aoi B: [16470]
  Other proteins in same PDB: d1aoia_, d1aoic_, d1aoid_, d1aoie_, d1aoig_, d1aoih_
2. Domain d1aoif_: 1aoi F: [16471]
  Other proteins in same PDB: d1aoia_, d1aoic_, d1aoid_, d1aoie_, d1aoig_, d1aoih_
  protein/DNA complex; complexed with mn; mutant
Domain(s) for 1kx3:
1. Domain d1kx3b_: 1kx3 B: [77578]
  Other proteins in same PDB: d1kx3a_, d1kx3c_, d1kx3d_, d1kx3e_, d1kx3g_, d1kx3h_
2. Domain d1kx3f_: 1kx3 F: [77582]
  Other proteins in same PDB: d1kx3a_, d1kx3c_, d1kx3d_, d1kx3e_, d1kx3g_, d1kx3h_
  complexed with mn
Domain(s) for 1kx4:
1. Domain d1kx4b_: 1kx4 B: [77586]
  Other proteins in same PDB: d1kx4a_, d1kx4c_, d1kx4d_, d1kx4e_, d1kx4g_, d1kx4h_
2. Domain d1kx4f_: 1kx4 F: [77590]
  Other proteins in same PDB: d1kx4a_, d1kx4c_, d1kx4d_, d1kx4e_, d1kx4g_, d1kx4h_
  complexed with cl, mn
Domain(s) for 1kx5:
1. Domain d1kx5b_: 1kx5 B: [77594]
  Other proteins in same PDB: d1kx5a_, d1kx5c_, d1kx5d_, d1kx5e_, d1kx5g_, d1kx5h_
2. Domain d1kx5f_: 1kx5 F: [77598]
  Other proteins in same PDB: d1kx5a_, d1kx5c_, d1kx5d_, d1kx5e_, d1kx5g_, d1kx5h_
  complexed with cl, mn
Domain(s) for 1m18:
1. Domain d1m18b_: 1m18 B: [78372]
  Other proteins in same PDB: d1m18a_, d1m18c_, d1m18d_, d1m18e_, d1m18g_, d1m18h_
2. Domain d1m18f_: 1m18 F: [78376]
  Other proteins in same PDB: d1m18a_, d1m18c_, d1m18d_, d1m18e_, d1m18g_, d1m18h_
  complexed with abu, bal, dib, imt, mn, pyb
Domain(s) for 1m19:
1. Domain d1m19b_: 1m19 B: [78380]
  Other proteins in same PDB: d1m19a_, d1m19c_, d1m19d_, d1m19e_, d1m19g_, d1m19h_
2. Domain d1m19f_: 1m19 F: [78384]
  Other proteins in same PDB: d1m19a_, d1m19c_, d1m19d_, d1m19e_, d1m19g_, d1m19h_
  complexed with abu, bal, dib, imt, mn, pyb
Domain(s) for 1m1a:
1. Domain d1m1ab_: 1m1a B: [78388]
  Other proteins in same PDB: d1m1aa_, d1m1ac_, d1m1ad_, d1m1ae_, d1m1ag_, d1m1ah_
2. Domain d1m1af_: 1m1a F: [78392]
  Other proteins in same PDB: d1m1aa_, d1m1ac_, d1m1ad_, d1m1ae_, d1m1ag_, d1m1ah_
  complexed with abu, bal, dib, imt, mn, pyb
Domain(s) for 1p34:
1. Domain d1p34b_: 1p34 B: [93971]
  Other proteins in same PDB: d1p34a_, d1p34c_, d1p34d_, d1p34e_, d1p34g_, d1p34h_
2. Domain d1p34f_: 1p34 F: [93975]
  Other proteins in same PDB: d1p34a_, d1p34c_, d1p34d_, d1p34e_, d1p34g_, d1p34h_
  mutant
Domain(s) for 1p3a:
1. Domain d1p3ab_: 1p3a B: [93981]
  Other proteins in same PDB: d1p3aa_, d1p3ac_, d1p3ad_, d1p3ae_, d1p3ag_, d1p3ah_
2. Domain d1p3af_: 1p3a F: [93985]
  Other proteins in same PDB: d1p3aa_, d1p3ac_, d1p3ad_, d1p3ae_, d1p3ag_, d1p3ah_
  mutant
Domain(s) for 1p3b:
1. Domain d1p3bb_: 1p3b B: [93989]
  Other proteins in same PDB: d1p3ba_, d1p3bc_, d1p3bd_, d1p3be_, d1p3bg_, d1p3bh_
2. Domain d1p3bf_: 1p3b F: [93993]
  Other proteins in same PDB: d1p3ba_, d1p3bc_, d1p3bd_, d1p3be_, d1p3bg_, d1p3bh_
  mutant
Domain(s) for 1p3f:
1. Domain d1p3fb_: 1p3f B: [93999]
  Other proteins in same PDB: d1p3fa_, d1p3fc_, d1p3fd_, d1p3fe_, d1p3fg_, d1p3fh_
2. Domain d1p3ff_: 1p3f F: [94003]
  Other proteins in same PDB: d1p3fa_, d1p3fc_, d1p3fd_, d1p3fe_, d1p3fg_, d1p3fh_
  mutant
Domain(s) for 1p3g:
1. Domain d1p3gb_: 1p3g B: [94007]
  Other proteins in same PDB: d1p3ga_, d1p3gc_, d1p3gd_, d1p3ge_, d1p3gg_, d1p3gh_
2. Domain d1p3gf_: 1p3g F: [94011]
  Other proteins in same PDB: d1p3ga_, d1p3gc_, d1p3gd_, d1p3ge_, d1p3gg_, d1p3gh_
  mutant
Domain(s) for 1p3i:
1. Domain d1p3ib_: 1p3i B: [94015]
  Other proteins in same PDB: d1p3ia_, d1p3ic_, d1p3id_, d1p3ie_, d1p3ig_, d1p3ih_
2. Domain d1p3if_: 1p3i F: [94019]
  Other proteins in same PDB: d1p3ia_, d1p3ic_, d1p3id_, d1p3ie_, d1p3ig_, d1p3ih_
  mutant
Domain(s) for 1p3k:
1. Domain d1p3kb_: 1p3k B: [94025]
  Other proteins in same PDB: d1p3ka_, d1p3kc_, d1p3kd_, d1p3ke_, d1p3kg_, d1p3kh_
2. Domain d1p3kf_: 1p3k F: [94029]
  Other proteins in same PDB: d1p3ka_, d1p3kc_, d1p3kd_, d1p3ke_, d1p3kg_, d1p3kh_
  mutant
Domain(s) for 1p3l:
1. Domain d1p3lb_: 1p3l B: [94033]
  Other proteins in same PDB: d1p3la_, d1p3lc_, d1p3ld_, d1p3le_, d1p3lg_, d1p3lh_
2. Domain d1p3lf_: 1p3l F: [94037]
  Other proteins in same PDB: d1p3la_, d1p3lc_, d1p3ld_, d1p3le_, d1p3lg_, d1p3lh_
  mutant
Domain(s) for 1p3m:
1. Domain d1p3mb_: 1p3m B: [94041]
  Other proteins in same PDB: d1p3ma_, d1p3mc_, d1p3md_, d1p3me_, d1p3mg_, d1p3mh_
2. Domain d1p3mf_: 1p3m F: [94045]
  Other proteins in same PDB: d1p3ma_, d1p3mc_, d1p3md_, d1p3me_, d1p3mg_, d1p3mh_
  mutant
Domain(s) for 1p3o:
1. Domain d1p3ob_: 1p3o B: [94050]
  Other proteins in same PDB: d1p3oa_, d1p3oc_, d1p3od_, d1p3oe_, d1p3og_, d1p3oh_
2. Domain d1p3of_: 1p3o F: [94054]
  Other proteins in same PDB: d1p3oa_, d1p3oc_, d1p3od_, d1p3oe_, d1p3og_, d1p3oh_
  mutant
Domain(s) for 1p3p:
1. Domain d1p3pb_: 1p3p B: [94058]
  Other proteins in same PDB: d1p3pa_, d1p3pc_, d1p3pd_, d1p3pe_, d1p3pg_, d1p3ph_
2. Domain d1p3pf_: 1p3p F: [94062]
  Other proteins in same PDB: d1p3pa_, d1p3pc_, d1p3pd_, d1p3pe_, d1p3pg_, d1p3ph_
  mutant
Domain(s) for 1s32:
1. Domain d1s32b_: 1s32 B: [98413]
  Other proteins in same PDB: d1s32a_, d1s32c_, d1s32d_, d1s32e_, d1s32g_, d1s32h_
2. Domain d1s32f_: 1s32 F: [98417]
  Other proteins in same PDB: d1s32a_, d1s32c_, d1s32d_, d1s32e_, d1s32g_, d1s32h_
  complexed with abu, bal, cl, dib, imt, mn, ogg, pyb
Domain(s) for 1u35:
1. Domain d1u35b1: 1u35 B:24-102 [119494]
  Other proteins in same PDB: d1u35a1, d1u35c1, d1u35d1, d1u35e1, d1u35g1, d1u35h1
  automatically matched to d1p3ob_
2. Domain d1u35f1: 1u35 F:224-302 [119498]
  Other proteins in same PDB: d1u35a1, d1u35c1, d1u35d1, d1u35e1, d1u35g1, d1u35h1
  automatically matched to d1p3ob_
Domain(s) for 1zbb:
1. Domain d1zbbb1: 1zbb B:24-102 [145986]
  Other proteins in same PDB: d1zbba1, d1zbbd1, d1zbbe1
  automatically matched to d1p3ob_
2. Domain d1zbbf1: 1zbb F:24-102 [145989]
  Other proteins in same PDB: d1zbba1, d1zbbd1, d1zbbe1
  automatically matched to d1p3ob_
Domain(s) for 1zla:
1. Domain d1zlab1: 1zla B:24-102 [125241]
  Other proteins in same PDB: d1zlaa1, d1zlac1, d1zlad1, d1zlae1, d1zlag1, d1zlah1
  automatically matched to d1p3ob_
2. Domain d1zlaf1: 1zla F:224-302 [125245]
  Other proteins in same PDB: d1zlaa1, d1zlac1, d1zlad1, d1zlae1, d1zlag1, d1zlah1
  automatically matched to d1p3ob_
Domain(s) for 2aro:
1. Domain d2arod1: 2aro D:24-102 [127212]
  Other proteins in same PDB: d2aroa1, d2arob1, d2aroc1, d2aroe1, d2arof1, d2arog1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with cl, po4
2. Domain d2aroh1: 2aro H:24-102 [127216]
  Other proteins in same PDB: d2aroa1, d2arob1, d2aroc1, d2aroe1, d2arof1, d2arog1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with cl, po4
Domain(s) for 2cv5:
1. Domain d2cv5b1: 2cv5 B:25-102 [130848]
  Other proteins in same PDB: d2cv5a1, d2cv5c1, d2cv5d1, d2cv5e1, d2cv5g1, d2cv5h1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with cl, mn
2. Domain d2cv5f1: 2cv5 F:24-102 [130852]
  Other proteins in same PDB: d2cv5a1, d2cv5c1, d2cv5d1, d2cv5e1, d2cv5g1, d2cv5h1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with cl, mn
Domain(s) for 2f8n:
1. Domain d2f8nb1: 2f8n B:24-102 [133134]
  Other proteins in same PDB: d2f8na1, d2f8nd1, d2f8ne1, d2f8ng1, d2f8nh1, d2f8nk1
  automatically matched to d1p3ob_
2. Domain d2f8nf1: 2f8n F:224-302 [133137]
  Other proteins in same PDB: d2f8na1, d2f8nd1, d2f8ne1, d2f8ng1, d2f8nh1, d2f8nk1
  automatically matched to d1p3ob_
Domain(s) for 2fj7:
1. Domain d2fj7b1: 2fj7 B:24-102 [133549]
  Other proteins in same PDB: d2fj7a1, d2fj7d1, d2fj7e1, d2fj7h1
  automatically matched to d1p3ob_
2. Domain d2fj7f1: 2fj7 F:24-102 [133552]
  Other proteins in same PDB: d2fj7a1, d2fj7d1, d2fj7e1, d2fj7h1
  automatically matched to d1p3ob_
Domain(s) for 2hue:
- Domain d2huec1: 2hue C:20-101 [136776]
  Other proteins in same PDB: d2huea1
  automatically matched to d1p3gf_
  complexed with gol, so4, zn; mutant
Domain(s) for 2io5:
- Domain d2io5c1: 2io5 C:24-100 [137542]
  Other proteins in same PDB: d2io5a1
  automatically matched to d1p3ob_
Domain(s) for 2nzd:
1. Domain d2nzdb1: 2nzd B:24-102 [138849]
  Other proteins in same PDB: d2nzda1, d2nzdc1, d2nzde1, d2nzdg1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with mn
2. Domain d2nzdf1: 2nzd F:24-102 [138852]
  Other proteins in same PDB: d2nzda1, d2nzdc1, d2nzde1, d2nzdg1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with mn
Domain(s) for 3b6f:
1. Domain d3b6fb1: 3b6f B:24-102 [154885]
  Other proteins in same PDB: d3b6fa1, d3b6fc1, d3b6fd1, d3b6fe1, d3b6fg1, d3b6fh1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with mn
2. Domain d3b6ff1: 3b6f F:24-102 [154889]
  Other proteins in same PDB: d3b6fa1, d3b6fc1, d3b6fd1, d3b6fe1, d3b6fg1, d3b6fh1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with mn
Domain(s) for 3b6g:
1. Domain d3b6gb1: 3b6g B:24-102 [154893]
  Other proteins in same PDB: d3b6ga1, d3b6gc1, d3b6gd1, d3b6ge1, d3b6gg1, d3b6gh1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with mn
2. Domain d3b6gf1: 3b6g F:24-102 [154897]
  Other proteins in same PDB: d3b6ga1, d3b6gc1, d3b6gd1, d3b6ge1, d3b6gg1, d3b6gh1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with mn
Domain(s) for 3c1b:
1. Domain d3c1bb1: 3c1b B:23-102 [155852]
  Other proteins in same PDB: d3c1ba1, d3c1bc1, d3c1bd1, d3c1be1, d3c1bg1, d3c1bh1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with ml3
2. Domain d3c1bf1: 3c1b F:223-302 [155856]
  Other proteins in same PDB: d3c1ba1, d3c1bc1, d3c1bd1, d3c1be1, d3c1bg1, d3c1bh1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with ml3
Domain(s) for 3c1c:
1. Domain d3c1cb1: 3c1c B:25-102 [155859]
  Other proteins in same PDB: d3c1cc1, d3c1cd1, d3c1cg1, d3c1ch1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with m2l
2. Domain d3c1cf1: 3c1c F:224-302 [155862]
  Other proteins in same PDB: d3c1cc1, d3c1cd1, d3c1cg1, d3c1ch1
  automatically matched to d1p3ob_
  complexed with m2l

More info for Species African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] from a.22.1.1 Histone H4

Timeline for Species African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] from a.22.1.1 Histone H4:

Species African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] from a.22.1.1 Histone H4 first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Species African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] from a.22.1.1 Histone H4 appears in SCOP 1.73
Species African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] from a.22.1.1 Histone H4 appears in SCOPe 2.01
Species African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] from a.22.1.1 Histone H4 appears in the current release, SCOPe 2.08