SCOP 1.73: Protein: Histone H3

Lineage for Protein: Histone H3

Root: SCOP 1.73
Class a: All alpha proteins [46456] (258 folds)
Fold a.22: Histone-fold [47112] (1 superfamily)
core: 3 helices; long middle helix is flanked at each end with shorter ones
Superfamily a.22.1: Histone-fold [47113] (4 families)
Family a.22.1.1: Nucleosome core histones [47114] (5 proteins)
form octamers composed of two copies of each of the four histones
Protein Histone H3 [47122] (4 species)

Species:

African clawed frog (Xenopus laevis) [TaxId:8355] [47124] (23 PDB entries)
1. Domains for 1aoi:
  1. Domain d1aoia_: 1aoi A: [16462]
    Other proteins in same PDB: d1aoib_, d1aoic_, d1aoid_, d1aoif_, d1aoig_, d1aoih_
  2. Domain d1aoie_: 1aoi E: [16463]
    Other proteins in same PDB: d1aoib_, d1aoic_, d1aoid_, d1aoif_, d1aoig_, d1aoih_
    protein/DNA complex; complexed with mn; mutant
2. Domains for 1f66:
  1. Domain d1f66a_: 1f66 A: [16460]
    Other proteins in same PDB: d1f66b_, d1f66c_, d1f66d_, d1f66f_, d1f66g_, d1f66h_
  2. Domain d1f66e_: 1f66 E: [16461]
    Other proteins in same PDB: d1f66b_, d1f66c_, d1f66d_, d1f66f_, d1f66g_, d1f66h_
    protein/DNA complex; complexed with mn
3. Domains for 1kx3:
  1. Domain d1kx3a_: 1kx3 A: [77577]
    Other proteins in same PDB: d1kx3b_, d1kx3c_, d1kx3d_, d1kx3f_, d1kx3g_, d1kx3h_
  2. Domain d1kx3e_: 1kx3 E: [77581]
    Other proteins in same PDB: d1kx3b_, d1kx3c_, d1kx3d_, d1kx3f_, d1kx3g_, d1kx3h_
    complexed with mn
4. Domains for 1kx4:
  1. Domain d1kx4a_: 1kx4 A: [77585]
    Other proteins in same PDB: d1kx4b_, d1kx4c_, d1kx4d_, d1kx4f_, d1kx4g_, d1kx4h_
  2. Domain d1kx4e_: 1kx4 E: [77589]
    Other proteins in same PDB: d1kx4b_, d1kx4c_, d1kx4d_, d1kx4f_, d1kx4g_, d1kx4h_
    complexed with cl, mn
5. Domains for 1kx5:
  1. Domain d1kx5a_: 1kx5 A: [77593]
    Other proteins in same PDB: d1kx5b_, d1kx5c_, d1kx5d_, d1kx5f_, d1kx5g_, d1kx5h_
  2. Domain d1kx5e_: 1kx5 E: [77597]
    Other proteins in same PDB: d1kx5b_, d1kx5c_, d1kx5d_, d1kx5f_, d1kx5g_, d1kx5h_
    complexed with cl, mn
6. Domains for 1m18:
  1. Domain d1m18a_: 1m18 A: [78371]
    Other proteins in same PDB: d1m18b_, d1m18c_, d1m18d_, d1m18f_, d1m18g_, d1m18h_
  2. Domain d1m18e_: 1m18 E: [78375]
    Other proteins in same PDB: d1m18b_, d1m18c_, d1m18d_, d1m18f_, d1m18g_, d1m18h_
    complexed with abu, bal, dib, imt, mn, pyb
7. Domains for 1m19:
  1. Domain d1m19a_: 1m19 A: [78379]
    Other proteins in same PDB: d1m19b_, d1m19c_, d1m19d_, d1m19f_, d1m19g_, d1m19h_
  2. Domain d1m19e_: 1m19 E: [78383]
    Other proteins in same PDB: d1m19b_, d1m19c_, d1m19d_, d1m19f_, d1m19g_, d1m19h_
    complexed with abu, bal, dib, imt, mn, pyb
8. Domains for 1m1a:
  1. Domain d1m1aa_: 1m1a A: [78387]
    Other proteins in same PDB: d1m1ab_, d1m1ac_, d1m1ad_, d1m1af_, d1m1ag_, d1m1ah_
  2. Domain d1m1ae_: 1m1a E: [78391]
    Other proteins in same PDB: d1m1ab_, d1m1ac_, d1m1ad_, d1m1af_, d1m1ag_, d1m1ah_
    complexed with abu, bal, dib, imt, mn, pyb
9. Domains for 1p34:
  1. Domain d1p34a_: 1p34 A: [93970]
    Other proteins in same PDB: d1p34b_, d1p34c_, d1p34d_, d1p34f_, d1p34g_, d1p34h_
  2. Domain d1p34e_: 1p34 E: [93974]
    Other proteins in same PDB: d1p34b_, d1p34c_, d1p34d_, d1p34f_, d1p34g_, d1p34h_
    mutant
10. Domains for 1p3a:
  1. Domain d1p3aa_: 1p3a A: [93980]
    Other proteins in same PDB: d1p3ab_, d1p3ac_, d1p3ad_, d1p3af_, d1p3ag_, d1p3ah_
  2. Domain d1p3ae_: 1p3a E: [93984]
    Other proteins in same PDB: d1p3ab_, d1p3ac_, d1p3ad_, d1p3af_, d1p3ag_, d1p3ah_
    mutant
11. Domains for 1p3b:
  1. Domain d1p3ba_: 1p3b A: [93988]
    Other proteins in same PDB: d1p3bb_, d1p3bc_, d1p3bd_, d1p3bf_, d1p3bg_, d1p3bh_
  2. Domain d1p3be_: 1p3b E: [93992]
    Other proteins in same PDB: d1p3bb_, d1p3bc_, d1p3bd_, d1p3bf_, d1p3bg_, d1p3bh_
    mutant
12. Domains for 1p3f:
  1. Domain d1p3fa_: 1p3f A: [93998]
    Other proteins in same PDB: d1p3fb_, d1p3fc_, d1p3fd_, d1p3ff_, d1p3fg_, d1p3fh_
  2. Domain d1p3fe_: 1p3f E: [94002]
    Other proteins in same PDB: d1p3fb_, d1p3fc_, d1p3fd_, d1p3ff_, d1p3fg_, d1p3fh_
    mutant
13. Domains for 1p3g:
  1. Domain d1p3ga_: 1p3g A: [94006]
    Other proteins in same PDB: d1p3gb_, d1p3gc_, d1p3gd_, d1p3gf_, d1p3gg_, d1p3gh_
  2. Domain d1p3ge_: 1p3g E: [94010]
    Other proteins in same PDB: d1p3gb_, d1p3gc_, d1p3gd_, d1p3gf_, d1p3gg_, d1p3gh_
    mutant
14. Domains for 1p3i:
  1. Domain d1p3ia_: 1p3i A: [94014]
    Other proteins in same PDB: d1p3ib_, d1p3ic_, d1p3id_, d1p3if_, d1p3ig_, d1p3ih_
  2. Domain d1p3ie_: 1p3i E: [94018]
    Other proteins in same PDB: d1p3ib_, d1p3ic_, d1p3id_, d1p3if_, d1p3ig_, d1p3ih_
    mutant
15. Domains for 1p3k:
  1. Domain d1p3ka_: 1p3k A: [94024]
    Other proteins in same PDB: d1p3kb_, d1p3kc_, d1p3kd_, d1p3kf_, d1p3kg_, d1p3kh_
  2. Domain d1p3ke_: 1p3k E: [94028]
    Other proteins in same PDB: d1p3kb_, d1p3kc_, d1p3kd_, d1p3kf_, d1p3kg_, d1p3kh_
    mutant
16. Domains for 1p3l:
  1. Domain d1p3la_: 1p3l A: [94032]
    Other proteins in same PDB: d1p3lb_, d1p3lc_, d1p3ld_, d1p3lf_, d1p3lg_, d1p3lh_
  2. Domain d1p3le_: 1p3l E: [94036]
    Other proteins in same PDB: d1p3lb_, d1p3lc_, d1p3ld_, d1p3lf_, d1p3lg_, d1p3lh_
    mutant
17. Domains for 1p3m:
  1. Domain d1p3ma_: 1p3m A: [94040]
    Other proteins in same PDB: d1p3mb_, d1p3mc_, d1p3md_, d1p3mf_, d1p3mg_, d1p3mh_
  2. Domain d1p3me_: 1p3m E: [94044]
    Other proteins in same PDB: d1p3mb_, d1p3mc_, d1p3md_, d1p3mf_, d1p3mg_, d1p3mh_
    mutant
18. Domains for 1p3o:
  1. Domain d1p3oa_: 1p3o A: [94049]
    Other proteins in same PDB: d1p3ob_, d1p3oc_, d1p3od_, d1p3of_, d1p3og_, d1p3oh_
  2. Domain d1p3oe_: 1p3o E: [94053]
    Other proteins in same PDB: d1p3ob_, d1p3oc_, d1p3od_, d1p3of_, d1p3og_, d1p3oh_
    mutant
19. Domains for 1p3p:
  1. Domain d1p3pa_: 1p3p A: [94057]
    Other proteins in same PDB: d1p3pb_, d1p3pc_, d1p3pd_, d1p3pf_, d1p3pg_, d1p3ph_
  2. Domain d1p3pe_: 1p3p E: [94061]
    Other proteins in same PDB: d1p3pb_, d1p3pc_, d1p3pd_, d1p3pf_, d1p3pg_, d1p3ph_
    mutant
20. Domains for 1s32:
  1. Domain d1s32a_: 1s32 A: [98412]
    Other proteins in same PDB: d1s32b_, d1s32c_, d1s32d_, d1s32f_, d1s32g_, d1s32h_
  2. Domain d1s32e_: 1s32 E: [98416]
    Other proteins in same PDB: d1s32b_, d1s32c_, d1s32d_, d1s32f_, d1s32g_, d1s32h_
    complexed with abu, bal, cl, dib, imt, mn, ogg, pyb
21. Domains for 1zla:
  1. Domain d1zlaa1: 1zla A:438-535 [125240]
    Other proteins in same PDB: d1zlab1, d1zlac1, d1zlad1, d1zlaf1, d1zlag1, d1zlah1
    automatically matched to d1p3le_
  2. Domain d1zlae1: 1zla E:638-735 [125244]
    Other proteins in same PDB: d1zlab1, d1zlac1, d1zlad1, d1zlaf1, d1zlag1, d1zlah1
    automatically matched to d1p3le_
22. Domains for 2fj7:
  1. Domain d2fj7a1: 2fj7 A:38-135 [133548]
    Other proteins in same PDB: d2fj7b1, d2fj7d1, d2fj7f1, d2fj7h1
    automatically matched to d1p3ie_
  2. Domain d2fj7e1: 2fj7 E:38-135 [133551]
    Other proteins in same PDB: d2fj7b1, d2fj7d1, d2fj7f1, d2fj7h1
    automatically matched to d1p3ie_
23. Domains for 2nzd:
  1. Domain d2nzda1: 2nzd A:39-134 [138848]
    Other proteins in same PDB: d2nzdb1, d2nzdc1, d2nzdf1, d2nzdg1
    automatically matched to d1p3ie_
    complexed with mn
  2. Domain d2nzde1: 2nzd E:39-134 [138851]
    Other proteins in same PDB: d2nzdb1, d2nzdc1, d2nzdf1, d2nzdg1
    automatically matched to d1p3ie_
    complexed with mn
Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [68986] (1 PDB entry)
- Domains for 1id3:
  1. Domain d1id3a_: 1id3 A: [66112]
    Other proteins in same PDB: d1id3b_, d1id3c_, d1id3d_, d1id3f_, d1id3g_, d1id3h_
  2. Domain d1id3e_: 1id3 E: [66116]
    Other proteins in same PDB: d1id3b_, d1id3c_, d1id3d_, d1id3f_, d1id3g_, d1id3h_
    complexed with mn
Chicken (Gallus gallus), erythrocytes [TaxId:9031] [47123] (7 PDB entries)
1. Domains for 1eqz:
  1. Domain d1eqzc_: 1eqz C: [16456]
    Other proteins in same PDB: d1eqza_, d1eqzb_, d1eqzd_, d1eqze_, d1eqzf_, d1eqzh_
  2. Domain d1eqzg_: 1eqz G: [16457]
    Other proteins in same PDB: d1eqza_, d1eqzb_, d1eqzd_, d1eqze_, d1eqzf_, d1eqzh_
    protein/DNA complex; complexed with cac, cl, k, mn; mutant
2. Domain for 1hio:
  - Domain d1hioc_: 1hio C: [16459]
    Other proteins in same PDB: d1hioa_, d1hiob_, d1hiod_
3. Domains for 1hq3:
  1. Domain d1hq3c_: 1hq3 C: [16454]
    Other proteins in same PDB: d1hq3a_, d1hq3b_, d1hq3d_, d1hq3e_, d1hq3f_, d1hq3h_
  2. Domain d1hq3g_: 1hq3 G: [16455]
    Other proteins in same PDB: d1hq3a_, d1hq3b_, d1hq3d_, d1hq3e_, d1hq3f_, d1hq3h_
    complexed with cl, po4
4. Domains for 1tzy:
  1. Domain d1tzyc_: 1tzy C: [107532]
    Other proteins in same PDB: d1tzya_, d1tzyb_, d1tzyd_, d1tzye_, d1tzyf_, d1tzyh_
  2. Domain d1tzyg_: 1tzy G: [107536]
    Other proteins in same PDB: d1tzya_, d1tzyb_, d1tzyd_, d1tzye_, d1tzyf_, d1tzyh_
    complexed with cl, po4
5. Domains for 2aro:
  1. Domain d2aroc1: 2aro C:41-135 [127211]
    Other proteins in same PDB: d2aroa1, d2arob1, d2arod1, d2aroe1, d2arof1, d2aroh1
    automatically matched to d1eqzc_
    complexed with cl, po4
  2. Domain d2arog1: 2aro G:41-135 [127215]
    Other proteins in same PDB: d2aroa1, d2arob1, d2arod1, d2aroe1, d2arof1, d2aroh1
    automatically matched to d1eqzc_
    complexed with cl, po4
6. Domains for 2f8n:
  1. Domain d2f8na1: 2f8n A:438-535 [133133]
    Other proteins in same PDB: d2f8nb1, d2f8nd1, d2f8nf1, d2f8ng1, d2f8nh1
    automatically matched to d1eqzc_
  2. Domain d2f8ne1: 2f8n E:641-735 [133136]
    Other proteins in same PDB: d2f8nb1, d2f8nd1, d2f8nf1, d2f8ng1, d2f8nh1
    automatically matched to d1eqzc_
7. Domain for 2hio:
  - Domain d2hioc_: 2hio C: [16458]
    Other proteins in same PDB: d2hioa_, d2hiob_, d2hiod_
Mouse(Mus musculus), H3.1 [TaxId:10090] [140395] (2 PDB entries)
1. Domains for 1u35:
  1. Domain d1u35a1: 1u35 A:438-535 [119493]
    Other proteins in same PDB: d1u35b1, d1u35c1, d1u35d1, d1u35f1, d1u35g1, d1u35h1
  2. Domain d1u35e1: 1u35 E:638-735 [119497]
    Other proteins in same PDB: d1u35b1, d1u35c1, d1u35d1, d1u35f1, d1u35g1, d1u35h1
    automatically matched to 1U35 A:438-535
2. Domains for 2cv5:
  1. Domain d2cv5a1: 2cv5 A:38-134 [130847]
    Other proteins in same PDB: d2cv5b1, d2cv5c1, d2cv5d1, d2cv5f1, d2cv5g1, d2cv5h1
    automatically matched to 1U35 A:438-535
    complexed with cl, mn
  2. Domain d2cv5e1: 2cv5 E:38-135 [130851]
    Other proteins in same PDB: d2cv5b1, d2cv5c1, d2cv5d1, d2cv5f1, d2cv5g1, d2cv5h1
    automatically matched to 1U35 A:438-535
    complexed with cl, mn

More info for Protein Histone H3 from a.22.1.1: Nucleosome core histones

Timeline for Protein Histone H3 from a.22.1.1: Nucleosome core histones:

Protein Histone H3 from a.22.1.1: Nucleosome core histones first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein Histone H3 from a.22.1.1: Nucleosome core histones appears in SCOP 1.71
Protein Histone H3 from a.22.1.1: Nucleosome core histones appears in SCOP 1.75
Protein Histone H3 from a.22.1.1: Nucleosome core histones appears in the current release, SCOPe 2.08