SCOPe 2.08: Protein: Radixin

Lineage for Protein: Radixin

Root: SCOPe 2.08
Class a: All alpha proteins [46456] (290 folds)
Fold a.11: Acyl-CoA binding protein-like [47026] (2 superfamilies)
core: 3 helices; bundle, closed, left-handed twist; up-and-down
Superfamily a.11.2: Second domain of FERM [47031] (2 families)
automatically mapped to Pfam PF00373
Family a.11.2.1: Second domain of FERM [47032] (9 proteins)
Protein Radixin [47035] (1 species)

Species:

Mouse (Mus musculus) [TaxId:10090] [47036] (9 PDB entries)
1. Domain for 1gc6:
  - Domain d1gc6a1: 1gc6 A:88-198 [16371]
    Other proteins in same PDB: d1gc6a2, d1gc6a3
    complexed with i3p
2. Domain for 1gc7:
  - Domain d1gc7a1: 1gc7 A:88-198 [16370]
    Other proteins in same PDB: d1gc7a2, d1gc7a3
3. Domain for 1j19:
  - Domain d1j19a1: 1j19 A:88-198 [83958]
    Other proteins in same PDB: d1j19a2, d1j19a3, d1j19a4
    complexed with the icam-2 cytoplasmic peptide, chain B
4. Domains for 2d10:
  1. Domain d2d10a1: 2d10 A:88-198 [131097]
    Other proteins in same PDB: d2d10a2, d2d10a3, d2d10b2, d2d10b3, d2d10c2, d2d10c3, d2d10d2, d2d10d3
    automatically matched to d1gc6a1
  2. Domain d2d10b1: 2d10 B:88-198 [131100]
    Other proteins in same PDB: d2d10a2, d2d10a3, d2d10b2, d2d10b3, d2d10c2, d2d10c3, d2d10d2, d2d10d3
    automatically matched to d1gc6a1
  3. Domain d2d10c1: 2d10 C:88-198 [131103]
    Other proteins in same PDB: d2d10a2, d2d10a3, d2d10b2, d2d10b3, d2d10c2, d2d10c3, d2d10d2, d2d10d3
    automatically matched to d1gc6a1
  4. Domain d2d10d1: 2d10 D:88-198 [131106]
    Other proteins in same PDB: d2d10a2, d2d10a3, d2d10b2, d2d10b3, d2d10c2, d2d10c3, d2d10d2, d2d10d3
    automatically matched to d1gc6a1
5. Domains for 2d11:
  1. Domain d2d11a1: 2d11 A:88-198 [131109]
    Other proteins in same PDB: d2d11a2, d2d11a3, d2d11b2, d2d11b3, d2d11c2, d2d11c3, d2d11d2, d2d11d3
    automatically matched to d1gc6a1
  2. Domain d2d11b1: 2d11 B:88-198 [131112]
    Other proteins in same PDB: d2d11a2, d2d11a3, d2d11b2, d2d11b3, d2d11c2, d2d11c3, d2d11d2, d2d11d3
    automatically matched to d1gc6a1
  3. Domain d2d11c1: 2d11 C:88-198 [131115]
    Other proteins in same PDB: d2d11a2, d2d11a3, d2d11b2, d2d11b3, d2d11c2, d2d11c3, d2d11d2, d2d11d3
    automatically matched to d1gc6a1
  4. Domain d2d11d1: 2d11 D:88-198 [131118]
    Other proteins in same PDB: d2d11a2, d2d11a3, d2d11b2, d2d11b3, d2d11c2, d2d11c3, d2d11d2, d2d11d3
    automatically matched to d1gc6a1
6. Domain for 2ems:
  - Domain d2emsa1: 2ems A:88-198 [146925]
    Other proteins in same PDB: d2emsa2, d2emsa3, d2emsa4
    automatically matched to d1gc6a1
7. Domains for 2emt:
  1. Domain d2emta1: 2emt A:88-198 [146928]
    Other proteins in same PDB: d2emta2, d2emta3, d2emta4, d2emtb2, d2emtb3, d2emtb4
    automatically matched to d1gc6a1
  2. Domain d2emtb1: 2emt B:88-198 [146931]
    Other proteins in same PDB: d2emta2, d2emta3, d2emta4, d2emtb2, d2emtb3, d2emtb4
    automatically matched to d1gc6a1
8. Domains for 2yvc:
  1. Domain d2yvca1: 2yvc A:88-198 [140078]
    Other proteins in same PDB: d2yvca2, d2yvca3, d2yvcb2, d2yvcb3, d2yvcb4, d2yvcc2, d2yvcc3
    automatically matched to d1gc6a1
  2. Domain d2yvcb1: 2yvc B:88-198 [140081]
    Other proteins in same PDB: d2yvca2, d2yvca3, d2yvcb2, d2yvcb3, d2yvcb4, d2yvcc2, d2yvcc3
    automatically matched to d1gc6a1
  3. Domain d2yvcc1: 2yvc C:88-198 [140084]
    Other proteins in same PDB: d2yvca2, d2yvca3, d2yvcb2, d2yvcb3, d2yvcb4, d2yvcc2, d2yvcc3
    automatically matched to d1gc6a1
9. Domain for 2zpy:
  - Domain d2zpya1: 2zpy A:88-198 [154758]
    Other proteins in same PDB: d2zpya2, d2zpya3
    automatically matched to d1gc6a1

More info for Protein Radixin from a.11.2.1: Second domain of FERM

Timeline for Protein Radixin from a.11.2.1: Second domain of FERM:

Protein Radixin from a.11.2.1: Second domain of FERM first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein Radixin from a.11.2.1: Second domain of FERM appears in SCOPe 2.07