SCOPe 2.08: Protein: DNA helicase RuvA subunit, C-terminal domain

Lineage for Protein: DNA helicase RuvA subunit, C-terminal domain

Root: SCOPe 2.08
Class a: All alpha proteins [46456] (290 folds)
Fold a.5: RuvA C-terminal domain-like [46928] (9 superfamilies)
3 helices; bundle, right-handed twist
Superfamily a.5.1: DNA helicase RuvA subunit, C-terminal domain [46929] (1 family)
possibly related to UBA-like domains
Family a.5.1.1: DNA helicase RuvA subunit, C-terminal domain [46930] (1 protein)
Protein DNA helicase RuvA subunit, C-terminal domain [46931] (3 species)
tetramer; binds Holliday junction

Species:

Escherichia coli [TaxId:562] [46932] (4 PDB entries)
1. Domains for 1bdx:
  1. Domain d1bdxa1: 1bdx A:156-203 [16276]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa2, d1bdxa3, d1bdxb2, d1bdxb3, d1bdxc2, d1bdxc3, d1bdxd2, d1bdxd3
    protein/DNA complex
  2. Domain d1bdxb1: 1bdx B:156-203 [16277]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa2, d1bdxa3, d1bdxb2, d1bdxb3, d1bdxc2, d1bdxc3, d1bdxd2, d1bdxd3
    protein/DNA complex
  3. Domain d1bdxc1: 1bdx C:156-203 [16278]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa2, d1bdxa3, d1bdxb2, d1bdxb3, d1bdxc2, d1bdxc3, d1bdxd2, d1bdxd3
    protein/DNA complex
  4. Domain d1bdxd1: 1bdx D:156-203 [16279]
    Other proteins in same PDB: d1bdxa2, d1bdxa3, d1bdxb2, d1bdxb3, d1bdxc2, d1bdxc3, d1bdxd2, d1bdxd3
    protein/DNA complex
2. Domain for 1c7y:
  - Domain d1c7ya1: 1c7y A:155-203 [16275]
    Other proteins in same PDB: d1c7ya2, d1c7ya3
    protein/DNA complex
3. Domain for 1cuk:
  - Domain d1cuka1: 1cuk A:156-203 [16273]
    Other proteins in same PDB: d1cuka2, d1cuka3
4. Domain for 1hjp:
  - Domain d1hjpa1: 1hjp A:158-203 [16274]
    Other proteins in same PDB: d1hjpa2, d1hjpa3

Mycobacterium leprae [TaxId:1769] [46933] (1 PDB entry)

Domains for 1bvs:

Domain d1bvsa1: 1bvs A:148-203 [16280]
Other proteins in same PDB: d1bvsa2, d1bvsa3, d1bvsb2, d1bvsb3, d1bvsc2, d1bvsc3, d1bvsd2, d1bvsd3, d1bvse2, d1bvse3, d1bvsf2, d1bvsf3, d1bvsg2, d1bvsg3, d1bvsh2, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsb1: 1bvs B:147-203 [16281]
Other proteins in same PDB: d1bvsa2, d1bvsa3, d1bvsb2, d1bvsb3, d1bvsc2, d1bvsc3, d1bvsd2, d1bvsd3, d1bvse2, d1bvse3, d1bvsf2, d1bvsf3, d1bvsg2, d1bvsg3, d1bvsh2, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsc1: 1bvs C:148-203 [16282]
Other proteins in same PDB: d1bvsa2, d1bvsa3, d1bvsb2, d1bvsb3, d1bvsc2, d1bvsc3, d1bvsd2, d1bvsd3, d1bvse2, d1bvse3, d1bvsf2, d1bvsf3, d1bvsg2, d1bvsg3, d1bvsh2, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsd1: 1bvs D:147-203 [16283]
Other proteins in same PDB: d1bvsa2, d1bvsa3, d1bvsb2, d1bvsb3, d1bvsc2, d1bvsc3, d1bvsd2, d1bvsd3, d1bvse2, d1bvse3, d1bvsf2, d1bvsf3, d1bvsg2, d1bvsg3, d1bvsh2, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvse1: 1bvs E:148-203 [16284]
Other proteins in same PDB: d1bvsa2, d1bvsa3, d1bvsb2, d1bvsb3, d1bvsc2, d1bvsc3, d1bvsd2, d1bvsd3, d1bvse2, d1bvse3, d1bvsf2, d1bvsf3, d1bvsg2, d1bvsg3, d1bvsh2, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsf1: 1bvs F:147-203 [16285]
Other proteins in same PDB: d1bvsa2, d1bvsa3, d1bvsb2, d1bvsb3, d1bvsc2, d1bvsc3, d1bvsd2, d1bvsd3, d1bvse2, d1bvse3, d1bvsf2, d1bvsf3, d1bvsg2, d1bvsg3, d1bvsh2, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsg1: 1bvs G:148-203 [16286]
Other proteins in same PDB: d1bvsa2, d1bvsa3, d1bvsb2, d1bvsb3, d1bvsc2, d1bvsc3, d1bvsd2, d1bvsd3, d1bvse2, d1bvse3, d1bvsf2, d1bvsf3, d1bvsg2, d1bvsg3, d1bvsh2, d1bvsh3
protein/DNA complex

Domain d1bvsh1: 1bvs H:147-203 [16287]
Other proteins in same PDB: d1bvsa2, d1bvsa3, d1bvsb2, d1bvsb3, d1bvsc2, d1bvsc3, d1bvsd2, d1bvsd3, d1bvse2, d1bvse3, d1bvsf2, d1bvsf3, d1bvsg2, d1bvsg3, d1bvsh2, d1bvsh3
protein/DNA complex

Thermus thermophilus [TaxId:274] [81702] (2 PDB entries)
1. Domain for 1ixr:
  - Domain d1ixrb1: 1ixr B:139-191 [76927]
    Other proteins in same PDB: d1ixra1, d1ixra2, d1ixrb2, d1ixrb3, d1ixrc1, d1ixrc2
    complexed with anp
2. Domain for 1ixs:
  - Domain d1ixsa_: 1ixs A: [76932]
    Other proteins in same PDB: d1ixsb1, d1ixsb2
    complexed with anp

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Protein DNA helicase RuvA subunit, C-terminal domain from a.5.1.1: DNA helicase RuvA subunit, C-terminal domain first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein DNA helicase RuvA subunit, C-terminal domain from a.5.1.1: DNA helicase RuvA subunit, C-terminal domain appears in SCOPe 2.07