Lineage for Protein: Cytochrome bc1 domain

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 1976409Class a: All alpha proteins [46456] (289 folds)
  3. 1980368Fold a.3: Cytochrome c [46625] (1 superfamily)
    core: 3 helices; folded leaf, opened
  4. 1980369Superfamily a.3.1: Cytochrome c [46626] (9 families) (S)
    covalently-bound heme completes the core
  5. 1980861Family a.3.1.3: Cytochrome bc1 domain [46676] (2 protein domains)
  6. 1980862Protein Cytochrome bc1 domain [46677] (3 species)

Species:

  1. 1980863Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [63462] (7 PDB entries)
    1. Domain for 1ezv:
    2. Domain for 1kb9:
    3. Domains for 1kyo:
      1. 1980872Domain d1kyod1: 1kyo D:62-260 [73254]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
        complexed with fes, hem, sma
      2. 1980873Domain d1kyoo1: 1kyo O:62-260 [73269]
        Other proteins in same PDB: d1kyoa1, d1kyoa2, d1kyob1, d1kyob2, d1kyoc2, d1kyoc3, d1kyod2, d1kyoe1, d1kyoe2, d1kyof_, d1kyog_, d1kyoh_, d1kyoi_, d1kyoj_, d1kyok_, d1kyol1, d1kyol2, d1kyom1, d1kyom2, d1kyon2, d1kyon3, d1kyoo2, d1kyop1, d1kyop2, d1kyoq_, d1kyor_, d1kyos_, d1kyot_, d1kyou_, d1kyov_, d1kyow_
        complexed with fes, hem, sma
    4. Domain for 1p84:
    5. Domain for 2ibz:
    6. Domains for 3cx5:
      1. 1980864Domain d3cx5d1: 3cx5 D:62-260 [157082]
        Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f_, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5k_, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q_, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5v_, d3cx5w_
        automated match to d1kyod1
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
      2. 1980865Domain d3cx5o1: 3cx5 O:62-260 [157098]
        Other proteins in same PDB: d3cx5a1, d3cx5a2, d3cx5b1, d3cx5b2, d3cx5c1, d3cx5c2, d3cx5d2, d3cx5e1, d3cx5e2, d3cx5f_, d3cx5g_, d3cx5h_, d3cx5i_, d3cx5j_, d3cx5k_, d3cx5l1, d3cx5l2, d3cx5m1, d3cx5m2, d3cx5n1, d3cx5n2, d3cx5o2, d3cx5p1, d3cx5p2, d3cx5q_, d3cx5r_, d3cx5s_, d3cx5t_, d3cx5u_, d3cx5v_, d3cx5w_
        automated match to d1kyod1
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn3, cn5, fes, hem, sma, suc, umq
    7. Domains for 3cxh:
      1. 1980869Domain d3cxhd1: 3cxh D:62-260 [157115]
        Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf_, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhk_, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq_, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhv_, d3cxhw_
        automated match to d1kyod1
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
      2. 1980870Domain d3cxho1: 3cxh O:62-260 [157131]
        Other proteins in same PDB: d3cxha1, d3cxha2, d3cxhb1, d3cxhb2, d3cxhc1, d3cxhc2, d3cxhd2, d3cxhe1, d3cxhe2, d3cxhf_, d3cxhg_, d3cxhh_, d3cxhi_, d3cxhj_, d3cxhk_, d3cxhl1, d3cxhl2, d3cxhm1, d3cxhm2, d3cxhn1, d3cxhn2, d3cxho2, d3cxhp1, d3cxhp2, d3cxhq_, d3cxhr_, d3cxhs_, d3cxht_, d3cxhu_, d3cxhv_, d3cxhw_
        automated match to d1kyod1
        complexed with 6ph, 7ph, 8pe, 9pe, cn6, fes, hem, sma, suc, umq
  2. 1980874Chicken (Gallus gallus) [TaxId:9031] [46679] (3 PDB entries)
    1. Domain for 1bcc:
    2. Domain for 2bcc:
    3. Domain for 3bcc:
  3. 1980878Cow (Bos taurus) [TaxId:9913] [46678] (18 PDB entries)
    Uniprot P00125
    1. Domain for 1be3:
    2. Domains for 1bgy:
      1. 1980897Domain d1bgyd2: 1bgy D:1-195 [15957]
        Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_
        complexed with fes, hec, hem
      2. 1980898Domain d1bgyp2: 1bgy P:1-195 [15958]
        Other proteins in same PDB: d1bgya1, d1bgya2, d1bgyb1, d1bgyb2, d1bgyc2, d1bgyc3, d1bgyd3, d1bgye_, d1bgyf_, d1bgyg_, d1bgyh_, d1bgyi_, d1bgyj_, d1bgyk_, d1bgym1, d1bgym2, d1bgyn1, d1bgyn2, d1bgyo2, d1bgyo3, d1bgyp3, d1bgyq1, d1bgyq2, d1bgyr_, d1bgys_, d1bgyt_, d1bgyu_, d1bgyv_, d1bgyw_
        complexed with fes, hec, hem
    3. Domain for 1l0l:
    4. Domain for 1l0n:
    5. Domain for 1ntk:
    6. Domain for 1ntm:
    7. Domain for 1ntz:
    8. Domain for 1nu1:
    9. Domains for 1pp9:
      1. 1980884Domain d1pp9d1: 1pp9 D:1-195 [104228]
        Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
        complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, uq
      2. 1980885Domain d1pp9q1: 1pp9 Q:1-195 [104243]
        Other proteins in same PDB: d1pp9a1, d1pp9a2, d1pp9b1, d1pp9b2, d1pp9c1, d1pp9c2, d1pp9d2, d1pp9e1, d1pp9e2, d1pp9f_, d1pp9g_, d1pp9h_, d1pp9i_, d1pp9j_, d1pp9n1, d1pp9n2, d1pp9o1, d1pp9o2, d1pp9p1, d1pp9p2, d1pp9q2, d1pp9r1, d1pp9r2, d1pp9s_, d1pp9t_, d1pp9u_, d1pp9v_, d1pp9w_
        complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, uq
    10. Domains for 1ppj:
      1. 1980881Domain d1ppjd1: 1ppj D:1-195 [104258]
        Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
        complexed with any, azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma
      2. 1980882Domain d1ppjq1: 1ppj Q:1-195 [104273]
        Other proteins in same PDB: d1ppja1, d1ppja2, d1ppjb1, d1ppjb2, d1ppjc1, d1ppjc2, d1ppjd2, d1ppje1, d1ppje2, d1ppjf_, d1ppjg_, d1ppjh_, d1ppji_, d1ppjj_, d1ppjn1, d1ppjn2, d1ppjo1, d1ppjo2, d1ppjp1, d1ppjp2, d1ppjq2, d1ppjr1, d1ppjr2, d1ppjs_, d1ppjt_, d1ppju_, d1ppjv_, d1ppjw_
        complexed with any, azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma
    11. Domain for 1qcr:
    12. Domain for 1sqb:
    13. Domain for 1sqp:
    14. Domain for 1sqv:
    15. Domain for 1sqx:
    16. Domains for 2a06:
      1. 1980879Domain d2a06d1: 2a06 D:1-195 [125923]
        Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06b1, d2a06b2, d2a06c1, d2a06c2, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06o1, d2a06o2, d2a06p1, d2a06p2, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_
        automated match to d1ppjd1
        complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, unl, uq
      2. 1980880Domain d2a06q1: 2a06 Q:1-195 [125932]
        Other proteins in same PDB: d2a06a1, d2a06a2, d2a06b1, d2a06b2, d2a06c1, d2a06c2, d2a06d2, d2a06e1, d2a06e2, d2a06f_, d2a06g_, d2a06h_, d2a06i_, d2a06j_, d2a06n1, d2a06n2, d2a06o1, d2a06o2, d2a06p1, d2a06p2, d2a06q2, d2a06r1, d2a06r2, d2a06s_, d2a06t_, d2a06u_, d2a06v_, d2a06w_
        automated match to d1ppjd1
        complexed with azi, bhg, cdl, fes, gol, hec, hem, pee, po4, sma, unl, uq
    17. Domain for 2fyu:
    18. Domain for 5klv:

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