SCOP 1.73: Protein: Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain

Lineage for Protein: Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain

Root: SCOP 1.73
Class a: All alpha proteins [46456] (258 folds)
Fold a.1: Globin-like [46457] (2 superfamilies)
core: 6 helices; folded leaf, partly opened
Superfamily a.1.2: alpha-helical ferredoxin [46548] (2 families)
contains two Fe4-S4 clusters
Family a.1.2.2: Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain [46553] (1 protein)
Protein Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain [46554] (1 species)
includes the N-terminal tail and the linker to domain 2

Species:

Pig (Sus scrofa) [TaxId:9823] [46555] (5 PDB entries)

Domains for 1gt8:

Domain d1gt8a1: 1gt8 A:2-183 [70418]
Other proteins in same PDB: d1gt8a2, d1gt8a3, d1gt8a4, d1gt8a5, d1gt8b2, d1gt8b3, d1gt8b4, d1gt8b5, d1gt8c2, d1gt8c3, d1gt8c4, d1gt8c5, d1gt8d2, d1gt8d3, d1gt8d4, d1gt8d5

Domain d1gt8b1: 1gt8 B:2-183 [70423]
Other proteins in same PDB: d1gt8a2, d1gt8a3, d1gt8a4, d1gt8a5, d1gt8b2, d1gt8b3, d1gt8b4, d1gt8b5, d1gt8c2, d1gt8c3, d1gt8c4, d1gt8c5, d1gt8d2, d1gt8d3, d1gt8d4, d1gt8d5

Domain d1gt8c1: 1gt8 C:2-183 [70428]
Other proteins in same PDB: d1gt8a2, d1gt8a3, d1gt8a4, d1gt8a5, d1gt8b2, d1gt8b3, d1gt8b4, d1gt8b5, d1gt8c2, d1gt8c3, d1gt8c4, d1gt8c5, d1gt8d2, d1gt8d3, d1gt8d4, d1gt8d5

Domain d1gt8d1: 1gt8 D:2-183 [70433]
Other proteins in same PDB: d1gt8a2, d1gt8a3, d1gt8a4, d1gt8a5, d1gt8b2, d1gt8b3, d1gt8b4, d1gt8b5, d1gt8c2, d1gt8c3, d1gt8c4, d1gt8c5, d1gt8d2, d1gt8d3, d1gt8d4, d1gt8d5
complexed with fad, fmn, fs4, ndp, uaa

Domains for 1gte:

Domain d1gtea1: 1gte A:2-183 [70440]
Other proteins in same PDB: d1gtea2, d1gtea3, d1gtea4, d1gtea5, d1gteb2, d1gteb3, d1gteb4, d1gteb5, d1gtec2, d1gtec3, d1gtec4, d1gtec5, d1gted2, d1gted3, d1gted4, d1gted5

Domain d1gteb1: 1gte B:2-183 [70445]
Other proteins in same PDB: d1gtea2, d1gtea3, d1gtea4, d1gtea5, d1gteb2, d1gteb3, d1gteb4, d1gteb5, d1gtec2, d1gtec3, d1gtec4, d1gtec5, d1gted2, d1gted3, d1gted4, d1gted5

Domain d1gtec1: 1gte C:2-183 [70450]
Other proteins in same PDB: d1gtea2, d1gtea3, d1gtea4, d1gtea5, d1gteb2, d1gteb3, d1gteb4, d1gteb5, d1gtec2, d1gtec3, d1gtec4, d1gtec5, d1gted2, d1gted3, d1gted4, d1gted5

Domain d1gted1: 1gte D:2-183 [70455]
Other proteins in same PDB: d1gtea2, d1gtea3, d1gtea4, d1gtea5, d1gteb2, d1gteb3, d1gteb4, d1gteb5, d1gtec2, d1gtec3, d1gtec4, d1gtec5, d1gted2, d1gted3, d1gted4, d1gted5
complexed with fad, fmn, fs4, iur

Domains for 1gth:

Domain d1gtha1: 1gth A:2-183 [70483]
Other proteins in same PDB: d1gtha2, d1gtha3, d1gtha4, d1gtha5, d1gthb2, d1gthb3, d1gthb4, d1gthb5, d1gthc2, d1gthc3, d1gthc4, d1gthc5, d1gthd2, d1gthd3, d1gthd4, d1gthd5

Domain d1gthb1: 1gth B:2-183 [70488]
Other proteins in same PDB: d1gtha2, d1gtha3, d1gtha4, d1gtha5, d1gthb2, d1gthb3, d1gthb4, d1gthb5, d1gthc2, d1gthc3, d1gthc4, d1gthc5, d1gthd2, d1gthd3, d1gthd4, d1gthd5

Domain d1gthc1: 1gth C:2-183 [70493]
Other proteins in same PDB: d1gtha2, d1gtha3, d1gtha4, d1gtha5, d1gthb2, d1gthb3, d1gthb4, d1gthb5, d1gthc2, d1gthc3, d1gthc4, d1gthc5, d1gthd2, d1gthd3, d1gthd4, d1gthd5

Domain d1gthd1: 1gth D:2-183 [70498]
Other proteins in same PDB: d1gtha2, d1gtha3, d1gtha4, d1gtha5, d1gthb2, d1gthb3, d1gthb4, d1gthb5, d1gthc2, d1gthc3, d1gthc4, d1gthc5, d1gthd2, d1gthd3, d1gthd4, d1gthd5
complexed with fad, fmn, fs4, idh, iur, ndp, ura

Domains for 1h7w:

Domain d1h7wa1: 1h7w A:2-183 [15683]
Other proteins in same PDB: d1h7wa2, d1h7wa3, d1h7wa4, d1h7wa5, d1h7wb2, d1h7wb3, d1h7wb4, d1h7wb5, d1h7wc2, d1h7wc3, d1h7wc4, d1h7wc5, d1h7wd2, d1h7wd3, d1h7wd4, d1h7wd5

Domain d1h7wb1: 1h7w B:2-183 [15684]
Other proteins in same PDB: d1h7wa2, d1h7wa3, d1h7wa4, d1h7wa5, d1h7wb2, d1h7wb3, d1h7wb4, d1h7wb5, d1h7wc2, d1h7wc3, d1h7wc4, d1h7wc5, d1h7wd2, d1h7wd3, d1h7wd4, d1h7wd5

Domain d1h7wc1: 1h7w C:2-183 [15685]
Other proteins in same PDB: d1h7wa2, d1h7wa3, d1h7wa4, d1h7wa5, d1h7wb2, d1h7wb3, d1h7wb4, d1h7wb5, d1h7wc2, d1h7wc3, d1h7wc4, d1h7wc5, d1h7wd2, d1h7wd3, d1h7wd4, d1h7wd5

Domain d1h7wd1: 1h7w D:2-183 [15686]
Other proteins in same PDB: d1h7wa2, d1h7wa3, d1h7wa4, d1h7wa5, d1h7wb2, d1h7wb3, d1h7wb4, d1h7wb5, d1h7wc2, d1h7wc3, d1h7wc4, d1h7wc5, d1h7wd2, d1h7wd3, d1h7wd4, d1h7wd5
complexed with fad, fmn, fs4

Domains for 1h7x:

Domain d1h7xa1: 1h7x A:2-183 [15687]
Other proteins in same PDB: d1h7xa2, d1h7xa3, d1h7xa4, d1h7xa5, d1h7xb2, d1h7xb3, d1h7xb4, d1h7xb5, d1h7xc2, d1h7xc3, d1h7xc4, d1h7xc5, d1h7xd2, d1h7xd3, d1h7xd4, d1h7xd5

Domain d1h7xb1: 1h7x B:2-183 [15688]
Other proteins in same PDB: d1h7xa2, d1h7xa3, d1h7xa4, d1h7xa5, d1h7xb2, d1h7xb3, d1h7xb4, d1h7xb5, d1h7xc2, d1h7xc3, d1h7xc4, d1h7xc5, d1h7xd2, d1h7xd3, d1h7xd4, d1h7xd5

Domain d1h7xc1: 1h7x C:2-183 [15689]
Other proteins in same PDB: d1h7xa2, d1h7xa3, d1h7xa4, d1h7xa5, d1h7xb2, d1h7xb3, d1h7xb4, d1h7xb5, d1h7xc2, d1h7xc3, d1h7xc4, d1h7xc5, d1h7xd2, d1h7xd3, d1h7xd4, d1h7xd5

Domain d1h7xd1: 1h7x D:2-183 [15690]
Other proteins in same PDB: d1h7xa2, d1h7xa3, d1h7xa4, d1h7xa5, d1h7xb2, d1h7xb3, d1h7xb4, d1h7xb5, d1h7xc2, d1h7xc3, d1h7xc4, d1h7xc5, d1h7xd2, d1h7xd3, d1h7xd4, d1h7xd5
complexed with fad, fmn, fs4, ndp, urf; mutant

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Timeline for Protein Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain from a.1.2.2: Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain:

Protein Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain from a.1.2.2: Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain first appeared (with stable ids) in SCOP 1.55
Protein Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain from a.1.2.2: Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain appears in SCOP 1.71
Protein Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain from a.1.2.2: Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain appears in SCOP 1.75
Protein Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain from a.1.2.2: Dihydropyrimidine dehydrogenase, N-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08