Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2109203Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 2109204Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (26 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 2112131Family c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) [52670] (21 protein domains)
    core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 32451678; strand 7 is antiparallel to the rest
  6. 2112187Protein Central domain of alpha subunit of F1 ATP synthase [88774] (5 species)
  7. 2112190Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [310928] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

  1. Domain(s) for 2hld:
    1. 2112197Domain d2hlda2: 2hld A:97-376 [287587]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    2. 2112198Domain d2hldb2: 2hld B:97-376 [287590]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    3. 2112199Domain d2hldc2: 2hld C:97-376 [287593]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    4. 2112200Domain d2hldj2: 2hld J:97-376 [287599]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    5. 2112201Domain d2hldk2: 2hld K:97-376 [287602]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    6. 2112202Domain d2hldl2: 2hld L:97-376 [287605]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    7. 2112203Domain d2hlds2: 2hld S:97-376 [287611]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    8. 2112204Domain d2hldt2: 2hld T:97-376 [287614]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    9. 2112205Domain d2hldu2: 2hld U:97-376 [287617]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
  2. Domain(s) for 3zia:
    1. 2112191Domain d3ziaa2: 3zia A:97-376 [296201]
      Other proteins in same PDB: d3ziaa1, d3ziaa3, d3ziab1, d3ziab3, d3ziac1, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziag_, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak1, d3ziak3, d3zial1, d3zial3, d3ziam1, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziaq_, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
      automated match to d2hlda2
      complexed with adp, atp, edo, mg
    2. 2112192Domain d3ziab2: 3zia B:97-376 [296204]
      Other proteins in same PDB: d3ziaa1, d3ziaa3, d3ziab1, d3ziab3, d3ziac1, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziag_, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak1, d3ziak3, d3zial1, d3zial3, d3ziam1, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziaq_, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
      automated match to d2hldb2
      complexed with adp, atp, edo, mg
    3. 2112193Domain d3ziac2: 3zia C:97-376 [296207]
      Other proteins in same PDB: d3ziaa1, d3ziaa3, d3ziab1, d3ziab3, d3ziac1, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziag_, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak1, d3ziak3, d3zial1, d3zial3, d3ziam1, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziaq_, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
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    4. 2112194Domain d3ziak2: 3zia K:97-376 [296213]
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    5. 2112195Domain d3zial2: 3zia L:97-376 [296216]
      Other proteins in same PDB: d3ziaa1, d3ziaa3, d3ziab1, d3ziab3, d3ziac1, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziag_, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak1, d3ziak3, d3zial1, d3zial3, d3ziam1, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziaq_, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
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    6. 2112196Domain d3ziam2: 3zia M:97-376 [296219]
      Other proteins in same PDB: d3ziaa1, d3ziaa3, d3ziab1, d3ziab3, d3ziac1, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziag_, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak1, d3ziak3, d3zial1, d3zial3, d3ziam1, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziaq_, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
      automated match to d2hlda2
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Timeline for Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from c.37.1.11 Central domain of alpha subunit of F1 ATP synthase:

  • Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from c.37.1.11 Central domain of alpha subunit of F1 ATP synthase is new in SCOPe 2.06-stable