Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2017114Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
  3. 2058388Fold b.49: Domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase-like [50614] (3 superfamilies)
    barrel, closed; n=6, S=8; greek-key
  4. 2058389Superfamily b.49.1: N-terminal domain of alpha and beta (or A/B) subunits of rotary ATPases [50615] (3 families) (S)
    automatically mapped to Pfam PF02874
  5. 2058390Family b.49.1.1: N-terminal domain of alpha and beta subunits of F1 ATP synthase [50616] (2 protein domains)
    6 domains form a ring structure which contains a barrel, closed; n=24, S=24(?)
  6. 2058391Protein F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1 [88672] (5 species)
  7. 2058394Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [310923] (2 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

  1. Domain(s) for 2hld:
    1. 2058401Domain d2hlda1: 2hld A:26-96 [287586]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    2. 2058402Domain d2hldb1: 2hld B:25-96 [287589]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    3. 2058403Domain d2hldc1: 2hld C:26-96 [287592]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    4. 2058404Domain d2hldj1: 2hld J:26-96 [287598]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    5. 2058405Domain d2hldk1: 2hld K:21-96 [287601]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    6. 2058406Domain d2hldl1: 2hld L:26-96 [287604]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    7. 2058407Domain d2hlds1: 2hld S:27-96 [287610]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    8. 2058408Domain d2hldt1: 2hld T:26-96 [287613]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
      complexed with anp, mg, po4
    9. 2058409Domain d2hldu1: 2hld U:26-96 [287616]
      Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
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  2. Domain(s) for 3zia:
    1. 2058395Domain d3ziaa1: 3zia A:26-96 [296200]
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      automated match to d2hlda1
      complexed with adp, atp, edo, mg
    2. 2058396Domain d3ziab1: 3zia B:25-96 [296203]
      Other proteins in same PDB: d3ziaa2, d3ziaa3, d3ziab2, d3ziab3, d3ziac2, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziag_, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak2, d3ziak3, d3zial2, d3zial3, d3ziam2, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziaq_, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
      automated match to d2hldb1
      complexed with adp, atp, edo, mg
    3. 2058397Domain d3ziac1: 3zia C:26-96 [296206]
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    4. 2058398Domain d3ziak1: 3zia K:26-96 [296212]
      Other proteins in same PDB: d3ziaa2, d3ziaa3, d3ziab2, d3ziab3, d3ziac2, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziag_, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak2, d3ziak3, d3zial2, d3zial3, d3ziam2, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziaq_, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
      automated match to d2hlda1
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    5. 2058399Domain d3zial1: 3zia L:25-96 [296215]
      Other proteins in same PDB: d3ziaa2, d3ziaa3, d3ziab2, d3ziab3, d3ziac2, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziag_, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak2, d3ziak3, d3zial2, d3zial3, d3ziam2, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziaq_, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
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    6. 2058400Domain d3ziam1: 3zia M:26-96 [296218]
      Other proteins in same PDB: d3ziaa2, d3ziaa3, d3ziab2, d3ziab3, d3ziac2, d3ziac3, d3ziad1, d3ziad2, d3ziad3, d3ziae1, d3ziae2, d3ziae3, d3ziaf1, d3ziaf2, d3ziaf3, d3ziag_, d3ziah1, d3ziah2, d3ziai_, d3ziak2, d3ziak3, d3zial2, d3zial3, d3ziam2, d3ziam3, d3zian1, d3zian2, d3zian3, d3ziao1, d3ziao2, d3ziao3, d3ziap1, d3ziap2, d3ziap3, d3ziaq_, d3ziar1, d3ziar2, d3zias_
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More info for Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from b.49.1.1 F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1

Timeline for Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from b.49.1.1 F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1:

  • Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] from b.49.1.1 F1 ATP synthase alpha subunit, domain 1 is new in SCOPe 2.06-stable