Lineage for d2hldh2 (2hld H:92-136)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 1976409Class a: All alpha proteins [46456] (289 folds)
  3. 1979497Fold a.2: Long alpha-hairpin [46556] (20 superfamilies)
    2 helices; antiparallel hairpin, left-handed twist
  4. 1979757Superfamily a.2.10: Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain [46604] (2 families) (S)
  5. 1979758Family a.2.10.1: Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain [46605] (1 protein)
  6. 1979759Protein Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain [46606] (3 species)
    delta subunit in mitochondria
    this domain unfolds when bound to the gamma subunit
  7. 1979760Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [310955] (3 PDB entries)
  8. 1979763Domain d2hldh2: 2hld H:92-136 [287596]
    Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_
    complexed with anp, mg, po4

Details for d2hldh2

PDB Entry: 2hld (more details), 2.8 Å

PDB Description: Crystal structure of yeast mitochondrial F1-ATPase
PDB Compounds: (H:) ATP synthase delta chain, mitochondrial

SCOPe Domain Sequences for d2hldh2:

Sequence, based on SEQRES records: (download)

>d2hldh2 a.2.10.1 (H:92-136) Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain {Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]}
plesfsqeniknllaeakknvsssdareaaeaaiqvevlenlqsv

Sequence, based on observed residues (ATOM records): (download)

>d2hldh2 a.2.10.1 (H:92-136) Epsilon subunit of F1F0-ATP synthase C-terminal domain {Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]}
plesfseniknllaeakknvsssreaaeaaiqvevlenlqsv

SCOPe Domain Coordinates for d2hldh2:

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Timeline for d2hldh2:

  • d2hldh2 is new in SCOPe 2.06-stable

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d2hldh1
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d2hld1_, d2hlda1, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv2, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1