SCOPe 2.08: Species: Thale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId: 3702]

Lineage for Species: Thale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId: 3702]

Root: SCOPe 2.08
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (396 folds)
Fold d.14: Ribosomal protein S5 domain 2-like [54210] (1 superfamily)
core: beta(3)-alpha-beta-alpha; 2 layers: alpha/beta; left-handed crossover
Superfamily d.14.1: Ribosomal protein S5 domain 2-like [54211] (13 families)
Family d.14.1.0: automated matches [191504] (1 protein)
not a true family
Protein automated matches [190826] (23 species)
not a true protein
Species Thale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId:3702] [259809] (11 PDB entries)

PDB entries in Species: Thale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId: 3702]:

Domain(s) for 4mu0:
- Domain d4mu0a1: 4mu0 A:9-95 [259814]
  Other proteins in same PDB: d4mu0a2
  automated match to d2f1da1
  complexed with cl, edo, mn, tri, trs
Domain(s) for 4mu1:
- Domain d4mu1a1: 4mu1 A:9-95 [259816]
  Other proteins in same PDB: d4mu1a2
  automated match to d2f1da1
  complexed with edo, imd, mn, so4
Domain(s) for 4mu3:
- Domain d4mu3a1: 4mu3 A:9-95 [259810]
  Other proteins in same PDB: d4mu3a2
  automated match to d2f1da1
  complexed with edo, ig2, iyp, mn; mutant
Domain(s) for 4mu4:
- Domain d4mu4a1: 4mu4 A:9-95 [266779]
  Other proteins in same PDB: d4mu4a2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with edo, iyp, mn; mutant
Domain(s) for 4qnj:
- Domain d4qnja1: 4qnj A:10-95 [274251]
  Other proteins in same PDB: d4qnja2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with cl, fmt, mn, trs
Domain(s) for 4qnk:
1. Domain d4qnka1: 4qnk A:9-95 [274247]
  Other proteins in same PDB: d4qnka2, d4qnkb2, d4qnkc2, d4qnkd2, d4qnke2, d4qnkf2, d4qnkg2, d4qnkh2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with edo, mn, na, po4
2. Domain d4qnkb1: 4qnk B:9-95 [274259]
  Other proteins in same PDB: d4qnka2, d4qnkb2, d4qnkc2, d4qnkd2, d4qnke2, d4qnkf2, d4qnkg2, d4qnkh2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with edo, mn, na, po4
3. Domain d4qnkc1: 4qnk C:9-95 [274257]
  Other proteins in same PDB: d4qnka2, d4qnkb2, d4qnkc2, d4qnkd2, d4qnke2, d4qnkf2, d4qnkg2, d4qnkh2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with edo, mn, na, po4
4. Domain d4qnkd1: 4qnk D:9-95 [274253]
  Other proteins in same PDB: d4qnka2, d4qnkb2, d4qnkc2, d4qnkd2, d4qnke2, d4qnkf2, d4qnkg2, d4qnkh2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with edo, mn, na, po4
5. Domain d4qnke1: 4qnk E:9-95 [274255]
  Other proteins in same PDB: d4qnka2, d4qnkb2, d4qnkc2, d4qnkd2, d4qnke2, d4qnkf2, d4qnkg2, d4qnkh2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with edo, mn, na, po4
6. Domain d4qnkf1: 4qnk F:10-95 [274249]
  Other proteins in same PDB: d4qnka2, d4qnkb2, d4qnkc2, d4qnkd2, d4qnke2, d4qnkf2, d4qnkg2, d4qnkh2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with edo, mn, na, po4
7. Domain d4qnkg1: 4qnk G:9-95 [274243]
  Other proteins in same PDB: d4qnka2, d4qnkb2, d4qnkc2, d4qnkd2, d4qnke2, d4qnkf2, d4qnkg2, d4qnkh2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with edo, mn, na, po4
8. Domain d4qnkh1: 4qnk H:9-95 [274245]
  Other proteins in same PDB: d4qnka2, d4qnkb2, d4qnkc2, d4qnkd2, d4qnke2, d4qnkf2, d4qnkg2, d4qnkh2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with edo, mn, na, po4
Domain(s) for 5ekw:
- Domain d5ekwa1: 5ekw A:9-95 [323543]
  Other proteins in same PDB: d5ekwa2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with 5dl, 5ld, cl, edo, mn, trs
Domain(s) for 5el9:
- Domain d5el9a1: 5el9 A:9-95 [323600]
  Other proteins in same PDB: d5el9a2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with 5dl, edo, mn, trs
Domain(s) for 5elw:
- Domain d5elwa1: 5elw A:9-95 [323557]
  Other proteins in same PDB: d5elwa2
  automated match to d4mu3a1
  complexed with 5ld, cl, edo, mn, trs

Domain(s) for 6ezj:

Domain d6ezja1: 6ezj A:11-95 [350380]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjb1: 6ezj B:11-95 [350388]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjc1: 6ezj C:11-95 [350385]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjd1: 6ezj D:11-95 [350639]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezje1: 6ezj E:11-95 [350390]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjf1: 6ezj F:11-95 [350418]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjg1: 6ezj G:11-95 [350487]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjh1: 6ezj H:11-95 [350362]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezji1: 6ezj I:11-95 [350625]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjj1: 6ezj J:11-95 [350806]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjk1: 6ezj K:11-95 [350367]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjl1: 6ezj L:11-95 [350787]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjm1: 6ezj M:11-95 [350489]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjn1: 6ezj N:11-95 [350769]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjo1: 6ezj O:11-95 [350369]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjp1: 6ezj P:11-95 [350371]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjq1: 6ezj Q:11-95 [350603]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjr1: 6ezj R:11-95 [350612]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjs1: 6ezj S:11-95 [350784]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjt1: 6ezj T:11-95 [350803]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezju1: 6ezj U:11-95 [350630]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjv1: 6ezj V:11-95 [350503]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjw1: 6ezj W:11-95 [350632]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain d6ezjx1: 6ezj X:11-95 [350373]
Other proteins in same PDB: d6ezja2, d6ezjb2, d6ezjc2, d6ezjd2, d6ezje2, d6ezjf2, d6ezjg2, d6ezjh2, d6ezji2, d6ezjj2, d6ezjk2, d6ezjl2, d6ezjm2, d6ezjn2, d6ezjo2, d6ezjp2, d6ezjq2, d6ezjr2, d6ezjs2, d6ezjt2, d6ezju2, d6ezjv2, d6ezjw2, d6ezjx2
automated match to d4mu3a1
complexed with 5ld, mn

Domain(s) for 6n10:
- Domain d6n10a1: 6n10 A:3-198 [370648]
  Other proteins in same PDB: d6n10a2
  automated match to d3d4ja1
  complexed with dp6, so4

More info for Species Thale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId:3702] from d.14.1.0 automated matches

Timeline for Species Thale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId:3702] from d.14.1.0 automated matches:

Species Thale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId:3702] from d.14.1.0 automated matches first appeared in SCOPe 2.04, called Species Arabidopsis thaliana [TaxId:3702] from d.14.1.0 automated matches
Species Thale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId:3702] from d.14.1.0 automated matches appears in SCOPe 2.07