Lineage for d2hldv2 (2hld V:83-357)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2109203Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 2109204Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (26 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 2112131Family c.37.1.11: RecA protein-like (ATPase-domain) [52670] (21 protein domains)
    core: mixed beta-sheet of 8 strands, order 32451678; strand 7 is antiparallel to the rest
  6. 2112257Protein Central domain of beta subunit of F1 ATP synthase [88779] (5 species)
  7. 2112260Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [310897] (6 PDB entries)
  8. 2112273Domain d2hldv2: 2hld V:83-357 [238672]
    Other proteins in same PDB: d2hld1_, d2hlda1, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu2, d2hldu3, d2hldv1, d2hldv3, d2hldw1, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1
    automated match to d2jdid3
    complexed with anp, mg, po4

Details for d2hldv2

PDB Entry: 2hld (more details), 2.8 Å

PDB Description: Crystal structure of yeast mitochondrial F1-ATPase
PDB Compounds: (V:) ATP synthase beta chain, mitochondrial

SCOPe Domain Sequences for d2hldv2:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2hldv2 c.37.1.11 (V:83-357) Central domain of beta subunit of F1 ATP synthase {Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]}
isvpvgretlgriinvigepidergpiksklrkpihadppsfaeqstsaeiletgikvvd
llapyarggkiglfggagvgktvfiqelinniakahggfsvftgvgertregndlyremk
etgvinlegeskvalvfgqmneppgararvaltgltiaeyfrdeegqdvllfidnifrft
qagsevsallgripsavgyqptlatdmgllqeritttkkgsvtsvqavyvpaddltdpap
attfahldattvlsrgiselgiypavdpldsksrl

SCOPe Domain Coordinates for d2hldv2:

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Timeline for d2hldv2:

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Domains from other chains:
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d2hld1_, d2hlda1, d2hlda2, d2hlda3, d2hldb1, d2hldb2, d2hldb3, d2hldc1, d2hldc2, d2hldc3, d2hldd1, d2hldd2, d2hldd3, d2hlde1, d2hlde2, d2hlde3, d2hldf1, d2hldf2, d2hldf3, d2hldg_, d2hldh1, d2hldh2, d2hldi_, d2hldj1, d2hldj2, d2hldj3, d2hldk1, d2hldk2, d2hldk3, d2hldl1, d2hldl2, d2hldl3, d2hldm1, d2hldm2, d2hldm3, d2hldn1, d2hldn2, d2hldn3, d2hldo1, d2hldo2, d2hldo3, d2hldp_, d2hldq1, d2hldq2, d2hldr_, d2hlds1, d2hlds2, d2hlds3, d2hldt1, d2hldt2, d2hldt3, d2hldu1, d2hldu2, d2hldu3, d2hldw1, d2hldw2, d2hldw3, d2hldx1, d2hldx2, d2hldx3, d2hldy_, d2hldz1