Lineage for Protein: automated matches

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2923792Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (396 folds)
  3. 2949054Fold d.58: Ferredoxin-like [54861] (62 superfamilies)
    alpha+beta sandwich with antiparallel beta-sheet; (beta-alpha-beta)x2
  4. 2955800Superfamily d.58.53: Ferredoxin-like domains from CRISPR-associated proteins [117987] (8 families) (S)
  5. 2955886Family d.58.53.0: automated matches [231597] (1 protein)
    not a true family
  6. 2955887Protein automated matches [231598] (4 species)
    not a true protein

Species:

  1. 2955888Pyrococcus furiosus [TaxId:186497] [419924] (1 PDB entry)
  2. 2955890Thermococcus onnurineus [TaxId:342948] [420034] (2 PDB entries)
    1. Domains for 6mua:
      1. 2955891Domain d6muaa2: 6mua A:225-379 [416348]
        Other proteins in same PDB: d6muaa1, d6muaa3, d6muaa5
        automated match to d4uw2a2
      2. 2955892Domain d6muaa4: 6mua A:498-669 [416350]
        Other proteins in same PDB: d6muaa1, d6muaa3, d6muaa5
        automated match to d4uw2a3
    2. Domains for 6o73:
      1. 2955893Domain d6o73a2: 6o73 A:225-379 [416403]
        Other proteins in same PDB: d6o73a1, d6o73a3, d6o73a5
        automated match to d4uw2a2
        complexed with ni
      2. 2955894Domain d6o73a4: 6o73 A:498-669 [416405]
        Other proteins in same PDB: d6o73a1, d6o73a3, d6o73a5
        automated match to d4uw2a3
        complexed with ni
  3. 2955895Thermococcus onnurineus [TaxId:523850] [420042] (1 PDB entry)
  4. 2955898Thermus thermophilus HB8 [TaxId:300852] [231599] (3 PDB entries)
    1. Domain for 2y8w:
    2. Domain for 2y8y:
    3. Domains for 2y9h:
      1. 2955901Domain d2y9ha1: 2y9h A:1-87 [231602]
        Other proteins in same PDB: d2y9ha2, d2y9ha3, d2y9hc2, d2y9he2, d2y9he3, d2y9hg2, d2y9hg3, d2y9hi2, d2y9hi3, d2y9hk2, d2y9hk3, d2y9hm2, d2y9hm3, d2y9ho2, d2y9ho3
        automated match to d1wj9a1
        protein/RNA complex
      2. 2955902Domain d2y9hc1: 2y9h C:1-87 [231604]
        Other proteins in same PDB: d2y9ha2, d2y9ha3, d2y9hc2, d2y9he2, d2y9he3, d2y9hg2, d2y9hg3, d2y9hi2, d2y9hi3, d2y9hk2, d2y9hk3, d2y9hm2, d2y9hm3, d2y9ho2, d2y9ho3
        automated match to d1wj9a1
        protein/RNA complex
      3. 2955903Domain d2y9he1: 2y9h E:1-87 [231600]
        Other proteins in same PDB: d2y9ha2, d2y9ha3, d2y9hc2, d2y9he2, d2y9he3, d2y9hg2, d2y9hg3, d2y9hi2, d2y9hi3, d2y9hk2, d2y9hk3, d2y9hm2, d2y9hm3, d2y9ho2, d2y9ho3
        automated match to d1wj9a1
        protein/RNA complex
      4. 2955904Domain d2y9hg1: 2y9h G:1-87 [231601]
        Other proteins in same PDB: d2y9ha2, d2y9ha3, d2y9hc2, d2y9he2, d2y9he3, d2y9hg2, d2y9hg3, d2y9hi2, d2y9hi3, d2y9hk2, d2y9hk3, d2y9hm2, d2y9hm3, d2y9ho2, d2y9ho3
        automated match to d1wj9a1
        protein/RNA complex
      5. 2955905Domain d2y9hi1: 2y9h I:1-87 [231603]
        Other proteins in same PDB: d2y9ha2, d2y9ha3, d2y9hc2, d2y9he2, d2y9he3, d2y9hg2, d2y9hg3, d2y9hi2, d2y9hi3, d2y9hk2, d2y9hk3, d2y9hm2, d2y9hm3, d2y9ho2, d2y9ho3
        automated match to d1wj9a1
        protein/RNA complex
      6. 2955906Domain d2y9hk1: 2y9h K:1-87 [231606]
        Other proteins in same PDB: d2y9ha2, d2y9ha3, d2y9hc2, d2y9he2, d2y9he3, d2y9hg2, d2y9hg3, d2y9hi2, d2y9hi3, d2y9hk2, d2y9hk3, d2y9hm2, d2y9hm3, d2y9ho2, d2y9ho3
        automated match to d1wj9a1
        protein/RNA complex
      7. 2955907Domain d2y9hm1: 2y9h M:1-87 [231605]
        Other proteins in same PDB: d2y9ha2, d2y9ha3, d2y9hc2, d2y9he2, d2y9he3, d2y9hg2, d2y9hg3, d2y9hi2, d2y9hi3, d2y9hk2, d2y9hk3, d2y9hm2, d2y9hm3, d2y9ho2, d2y9ho3
        automated match to d1wj9a1
        protein/RNA complex
      8. 2955908Domain d2y9ho1: 2y9h O:1-87 [231607]
        Other proteins in same PDB: d2y9ha2, d2y9ha3, d2y9hc2, d2y9he2, d2y9he3, d2y9hg2, d2y9hg3, d2y9hi2, d2y9hi3, d2y9hk2, d2y9hk3, d2y9hm2, d2y9hm3, d2y9ho2, d2y9ho3
        automated match to d1wj9a1
        protein/RNA complex

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