Lineage for Species: Escherichia coli [TaxId: 562]

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2299346Class a: All alpha proteins [46456] (289 folds)
  3. 2322501Fold a.35: lambda repressor-like DNA-binding domains [47412] (1 superfamily)
    core: 4 helices; folded leaf, closed
  4. 2322502Superfamily a.35.1: lambda repressor-like DNA-binding domains [47413] (14 families) (S)
  5. 2322693Family a.35.1.4: Cyanase N-terminal domain [47435] (2 proteins)
    probably does not bind to DNA
  6. 2322716Protein automated matches [230792] (1 species)
    not a true protein
  7. 2322717Species Escherichia coli [TaxId:562] [230793] (6 PDB entries)

PDB entries in Species: Escherichia coli [TaxId: 562]:

  1. Domain(s) for 2iu7:
    1. 2322728Domain d2iu7a1: 2iu7 A:1-86 [137649]
      Other proteins in same PDB: d2iu7a2, d2iu7b2, d2iu7c2, d2iu7d2, d2iu7e2, d2iu7f2, d2iu7g2, d2iu7h2, d2iu7i2, d2iu7j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with oxl, so4
    2. 2322729Domain d2iu7b1: 2iu7 B:1-86 [137651]
      Other proteins in same PDB: d2iu7a2, d2iu7b2, d2iu7c2, d2iu7d2, d2iu7e2, d2iu7f2, d2iu7g2, d2iu7h2, d2iu7i2, d2iu7j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with oxl, so4
    3. 2322730Domain d2iu7c1: 2iu7 C:1-86 [137653]
      Other proteins in same PDB: d2iu7a2, d2iu7b2, d2iu7c2, d2iu7d2, d2iu7e2, d2iu7f2, d2iu7g2, d2iu7h2, d2iu7i2, d2iu7j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with oxl, so4
    4. 2322731Domain d2iu7d1: 2iu7 D:1-86 [137655]
      Other proteins in same PDB: d2iu7a2, d2iu7b2, d2iu7c2, d2iu7d2, d2iu7e2, d2iu7f2, d2iu7g2, d2iu7h2, d2iu7i2, d2iu7j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with oxl, so4
    5. 2322732Domain d2iu7e1: 2iu7 E:1-86 [137657]
      Other proteins in same PDB: d2iu7a2, d2iu7b2, d2iu7c2, d2iu7d2, d2iu7e2, d2iu7f2, d2iu7g2, d2iu7h2, d2iu7i2, d2iu7j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with oxl, so4
    6. 2322733Domain d2iu7f1: 2iu7 F:1-86 [137659]
      Other proteins in same PDB: d2iu7a2, d2iu7b2, d2iu7c2, d2iu7d2, d2iu7e2, d2iu7f2, d2iu7g2, d2iu7h2, d2iu7i2, d2iu7j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with oxl, so4
    7. 2322734Domain d2iu7g1: 2iu7 G:1-86 [137661]
      Other proteins in same PDB: d2iu7a2, d2iu7b2, d2iu7c2, d2iu7d2, d2iu7e2, d2iu7f2, d2iu7g2, d2iu7h2, d2iu7i2, d2iu7j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with oxl, so4
    8. 2322735Domain d2iu7h1: 2iu7 H:1-86 [137663]
      Other proteins in same PDB: d2iu7a2, d2iu7b2, d2iu7c2, d2iu7d2, d2iu7e2, d2iu7f2, d2iu7g2, d2iu7h2, d2iu7i2, d2iu7j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with oxl, so4
    9. 2322736Domain d2iu7i1: 2iu7 I:1-86 [137665]
      Other proteins in same PDB: d2iu7a2, d2iu7b2, d2iu7c2, d2iu7d2, d2iu7e2, d2iu7f2, d2iu7g2, d2iu7h2, d2iu7i2, d2iu7j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with oxl, so4
    10. 2322737Domain d2iu7j1: 2iu7 J:1-86 [137667]
      Other proteins in same PDB: d2iu7a2, d2iu7b2, d2iu7c2, d2iu7d2, d2iu7e2, d2iu7f2, d2iu7g2, d2iu7h2, d2iu7i2, d2iu7j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with oxl, so4
  2. Domain(s) for 2iuo:
    1. 2322758Domain d2iuoa1: 2iuo A:1-86 [137689]
      Other proteins in same PDB: d2iuoa2, d2iuob2, d2iuoc2, d2iuod2, d2iuoe2, d2iuof2, d2iuog2, d2iuoh2, d2iuoi2, d2iuoj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, br, cl, so4
    2. 2322759Domain d2iuob1: 2iuo B:1-86 [137691]
      Other proteins in same PDB: d2iuoa2, d2iuob2, d2iuoc2, d2iuod2, d2iuoe2, d2iuof2, d2iuog2, d2iuoh2, d2iuoi2, d2iuoj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, br, cl, so4
    3. 2322760Domain d2iuoc1: 2iuo C:1-86 [137693]
      Other proteins in same PDB: d2iuoa2, d2iuob2, d2iuoc2, d2iuod2, d2iuoe2, d2iuof2, d2iuog2, d2iuoh2, d2iuoi2, d2iuoj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, br, cl, so4
    4. 2322761Domain d2iuod1: 2iuo D:1-86 [137695]
      Other proteins in same PDB: d2iuoa2, d2iuob2, d2iuoc2, d2iuod2, d2iuoe2, d2iuof2, d2iuog2, d2iuoh2, d2iuoi2, d2iuoj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, br, cl, so4
    5. 2322762Domain d2iuoe1: 2iuo E:1-86 [137697]
      Other proteins in same PDB: d2iuoa2, d2iuob2, d2iuoc2, d2iuod2, d2iuoe2, d2iuof2, d2iuog2, d2iuoh2, d2iuoi2, d2iuoj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, br, cl, so4
    6. 2322763Domain d2iuof1: 2iuo F:1-86 [137699]
      Other proteins in same PDB: d2iuoa2, d2iuob2, d2iuoc2, d2iuod2, d2iuoe2, d2iuof2, d2iuog2, d2iuoh2, d2iuoi2, d2iuoj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, br, cl, so4
    7. 2322764Domain d2iuog1: 2iuo G:1-86 [137701]
      Other proteins in same PDB: d2iuoa2, d2iuob2, d2iuoc2, d2iuod2, d2iuoe2, d2iuof2, d2iuog2, d2iuoh2, d2iuoi2, d2iuoj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, br, cl, so4
    8. 2322765Domain d2iuoh1: 2iuo H:1-86 [137703]
      Other proteins in same PDB: d2iuoa2, d2iuob2, d2iuoc2, d2iuod2, d2iuoe2, d2iuof2, d2iuog2, d2iuoh2, d2iuoi2, d2iuoj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, br, cl, so4
    9. 2322766Domain d2iuoi1: 2iuo I:1-86 [137705]
      Other proteins in same PDB: d2iuoa2, d2iuob2, d2iuoc2, d2iuod2, d2iuoe2, d2iuof2, d2iuog2, d2iuoh2, d2iuoi2, d2iuoj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, br, cl, so4
    10. 2322767Domain d2iuoj1: 2iuo J:1-86 [137707]
      Other proteins in same PDB: d2iuoa2, d2iuob2, d2iuoc2, d2iuod2, d2iuoe2, d2iuof2, d2iuog2, d2iuoh2, d2iuoi2, d2iuoj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, br, cl, so4
  3. Domain(s) for 2iv1:
    1. 2322718Domain d2iv1a1: 2iv1 A:1-86 [230798]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    2. 2322719Domain d2iv1b1: 2iv1 B:1-86 [230794]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    3. 2322720Domain d2iv1c1: 2iv1 C:1-86 [230800]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    4. 2322721Domain d2iv1d1: 2iv1 D:1-86 [230802]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    5. 2322722Domain d2iv1e1: 2iv1 E:1-86 [230807]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    6. 2322723Domain d2iv1f1: 2iv1 F:1-86 [230804]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    7. 2322724Domain d2iv1g1: 2iv1 G:1-86 [230806]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    8. 2322725Domain d2iv1h1: 2iv1 H:1-86 [230810]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    9. 2322726Domain d2iv1i1: 2iv1 I:1-86 [230812]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    10. 2322727Domain d2iv1j1: 2iv1 J:1-86 [230814]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
  4. Domain(s) for 2ivb:
    1. 2322748Domain d2ivba1: 2ivb A:1-86 [230818]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2, d2ivbg2, d2ivbh2, d2ivbi2, d2ivbj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    2. 2322749Domain d2ivbb1: 2ivb B:1-86 [230820]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2, d2ivbg2, d2ivbh2, d2ivbi2, d2ivbj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    3. 2322750Domain d2ivbc1: 2ivb C:1-86 [230816]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2, d2ivbg2, d2ivbh2, d2ivbi2, d2ivbj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    4. 2322751Domain d2ivbd1: 2ivb D:1-86 [230824]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2, d2ivbg2, d2ivbh2, d2ivbi2, d2ivbj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    5. 2322752Domain d2ivbe1: 2ivb E:1-86 [230826]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2, d2ivbg2, d2ivbh2, d2ivbi2, d2ivbj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    6. 2322753Domain d2ivbf1: 2ivb F:1-86 [230822]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2, d2ivbg2, d2ivbh2, d2ivbi2, d2ivbj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    7. 2322754Domain d2ivbg1: 2ivb G:1-86 [238688]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2, d2ivbg2, d2ivbh2, d2ivbi2, d2ivbj2
      automated match to d2ivbc1
      complexed with azi, cl, so4
    8. 2322755Domain d2ivbh1: 2ivb H:1-86 [238690]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2, d2ivbg2, d2ivbh2, d2ivbi2, d2ivbj2
      automated match to d2ivbc1
      complexed with azi, cl, so4
    9. 2322756Domain d2ivbi1: 2ivb I:1-86 [238692]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2, d2ivbg2, d2ivbh2, d2ivbi2, d2ivbj2
      automated match to d2ivbc1
      complexed with azi, cl, so4
    10. 2322757Domain d2ivbj1: 2ivb J:1-86 [238694]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2, d2ivbg2, d2ivbh2, d2ivbi2, d2ivbj2
      automated match to d2ivbc1
      complexed with azi, cl, so4
  5. Domain(s) for 2ivg:
    1. 2322738Domain d2ivga1: 2ivg A:1-86 [230832]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    2. 2322739Domain d2ivgb1: 2ivg B:1-86 [230828]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    3. 2322740Domain d2ivgc1: 2ivg C:1-86 [230830]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    4. 2322741Domain d2ivgd1: 2ivg D:1-86 [230836]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    5. 2322742Domain d2ivge1: 2ivg E:1-86 [230840]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    6. 2322743Domain d2ivgf1: 2ivg F:1-86 [230842]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    7. 2322744Domain d2ivgg1: 2ivg G:1-86 [230834]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    8. 2322745Domain d2ivgh1: 2ivg H:1-86 [230838]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    9. 2322746Domain d2ivgi1: 2ivg I:1-86 [230845]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    10. 2322747Domain d2ivgj1: 2ivg J:1-86 [230844]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
  6. Domain(s) for 2ivq:
    1. 2322768Domain d2ivqa1: 2ivq A:1-86 [230850]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    2. 2322769Domain d2ivqb1: 2ivq B:1-86 [230848]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    3. 2322770Domain d2ivqc1: 2ivq C:1-86 [230856]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    4. 2322771Domain d2ivqd1: 2ivq D:1-86 [230852]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    5. 2322772Domain d2ivqe1: 2ivq E:1-86 [230854]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    6. 2322773Domain d2ivqf1: 2ivq F:1-86 [230858]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    7. 2322774Domain d2ivqg1: 2ivq G:1-86 [230860]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    8. 2322775Domain d2ivqh1: 2ivq H:1-86 [230862]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    9. 2322776Domain d2ivqi1: 2ivq I:1-86 [230864]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    10. 2322777Domain d2ivqj1: 2ivq J:1-86 [230866]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4

More info for Species Escherichia coli [TaxId:562] from a.35.1.4 automated matches

Timeline for Species Escherichia coli [TaxId:562] from a.35.1.4 automated matches: