Lineage for Species: Escherichia coli [TaxId: 562]

  1. Root: SCOPe 2.03
  2. 1253684Class a: All alpha proteins [46456] (284 folds)
  3. 1268060Fold a.35: lambda repressor-like DNA-binding domains [47412] (1 superfamily)
    core: 4 helices; folded leaf, closed
  4. 1268061Superfamily a.35.1: lambda repressor-like DNA-binding domains [47413] (14 families) (S)
  5. 1268232Family a.35.1.4: Cyanase N-terminal domain [47435] (2 proteins)
    probably does not bind to DNA
  6. 1268275Protein automated matches [230792] (1 species)
    not a true protein
  7. 1268276Species Escherichia coli [TaxId:562] [230793] (4 PDB entries)

PDB entries in Species: Escherichia coli [TaxId: 562]:

  1. Domain(s) for 2iv1:
    1. 1268277Domain d2iv1a1: 2iv1 A:1-86 [230798]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    2. 1268278Domain d2iv1b1: 2iv1 B:1-86 [230794]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    3. 1268279Domain d2iv1c1: 2iv1 C:1-86 [230800]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    4. 1268280Domain d2iv1d1: 2iv1 D:1-86 [230802]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    5. 1268281Domain d2iv1e1: 2iv1 E:1-86 [230807]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    6. 1268282Domain d2iv1f1: 2iv1 F:1-86 [230804]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    7. 1268283Domain d2iv1g1: 2iv1 G:1-86 [230806]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
    8. 1268284Domain d2iv1h1: 2iv1 H:1-86 [230810]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
    9. 1268285Domain d2iv1i1: 2iv1 I:1-86 [230812]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    10. 1268286Domain d2iv1j1: 2iv1 J:1-86 [230814]
      Other proteins in same PDB: d2iv1a2, d2iv1b2, d2iv1c2, d2iv1d2, d2iv1e2, d2iv1f2, d2iv1g2, d2iv1h2, d2iv1i2, d2iv1j2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
  2. Domain(s) for 2ivb:
    1. 1268297Domain d2ivba1: 2ivb A:1-86 [230818]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    2. 1268298Domain d2ivbb1: 2ivb B:1-86 [230820]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    3. 1268299Domain d2ivbc1: 2ivb C:1-86 [230816]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    4. 1268300Domain d2ivbd1: 2ivb D:1-86 [230824]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    5. 1268301Domain d2ivbe1: 2ivb E:1-86 [230826]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    6. 1268302Domain d2ivbf1: 2ivb F:1-86 [230822]
      Other proteins in same PDB: d2ivba2, d2ivbb2, d2ivbc2, d2ivbd2, d2ivbe2, d2ivbf2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
  3. Domain(s) for 2ivg:
    1. 1268287Domain d2ivga1: 2ivg A:1-86 [230832]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
    2. 1268288Domain d2ivgb1: 2ivg B:1-86 [230828]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    3. 1268289Domain d2ivgc1: 2ivg C:1-86 [230830]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    4. 1268290Domain d2ivgd1: 2ivg D:1-86 [230836]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    5. 1268291Domain d2ivge1: 2ivg E:1-86 [230840]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    6. 1268292Domain d2ivgf1: 2ivg F:1-86 [230842]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    7. 1268293Domain d2ivgg1: 2ivg G:1-86 [230834]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
    8. 1268294Domain d2ivgh1: 2ivg H:1-86 [230838]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    9. 1268295Domain d2ivgi1: 2ivg I:1-86 [230845]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
    10. 1268296Domain d2ivgj1: 2ivg J:1-86 [230844]
      Other proteins in same PDB: d2ivga2, d2ivgb2, d2ivgc2, d2ivgd2, d2ivge2, d2ivgf2, d2ivgg2, d2ivgh2, d2ivgi2, d2ivgj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with azi, cl, so4
  4. Domain(s) for 2ivq:
    1. 1268303Domain d2ivqa1: 2ivq A:1-86 [230850]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
    2. 1268304Domain d2ivqb1: 2ivq B:1-86 [230848]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    3. 1268305Domain d2ivqc1: 2ivq C:1-86 [230856]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
    4. 1268306Domain d2ivqd1: 2ivq D:1-86 [230852]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
    5. 1268307Domain d2ivqe1: 2ivq E:1-86 [230854]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    6. 1268308Domain d2ivqf1: 2ivq F:1-86 [230858]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
    7. 1268309Domain d2ivqg1: 2ivq G:1-86 [230860]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
    8. 1268310Domain d2ivqh1: 2ivq H:1-86 [230862]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
      complexed with cl, so4
    9. 1268311Domain d2ivqi1: 2ivq I:1-86 [230864]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1
    10. 1268312Domain d2ivqj1: 2ivq J:1-86 [230866]
      Other proteins in same PDB: d2ivqa2, d2ivqb2, d2ivqc2, d2ivqd2, d2ivqe2, d2ivqf2, d2ivqg2, d2ivqh2, d2ivqi2, d2ivqj2
      automated match to d1dwka1

More info for Species Escherichia coli [TaxId:562] from a.35.1.4 automated matches

Timeline for Species Escherichia coli [TaxId:562] from a.35.1.4 automated matches: