Lineage for Species: Roseovarius nubinhibens [TaxId: 89187]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2078560Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies)
    contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
    the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
  4. 2086988Superfamily c.1.11: Enolase C-terminal domain-like [51604] (3 families) (S)
    binds metal ion (magnesium or manganese) in conserved site inside barrel
    N-terminal alpha+beta domain is common to this superfamily
  5. 2087392Family c.1.11.0: automated matches [227196] (1 protein)
    not a true family
  6. 2087393Protein automated matches [226923] (73 species)
    not a true protein
  7. 2087849Species Roseovarius nubinhibens [TaxId:89187] [225251] (5 PDB entries)

PDB entries in Species: Roseovarius nubinhibens [TaxId: 89187]:

  1. Domain(s) for 2pce:
    1. 2087865Domain d2pcea2: 2pce A:128-372 [205496]
      Other proteins in same PDB: d2pcea1, d2pcea3, d2pceb1, d2pceb3, d2pcec1, d2pcec3, d2pced1, d2pced3, d2pcee1, d2pcee3, d2pcef1, d2pcef3, d2pceg1, d2pceg3, d2pceh1, d2pceh3
      automated match to d1jpma1
      complexed with po4
    2. 2087866Domain d2pceb2: 2pce B:128-372 [205498]
      Other proteins in same PDB: d2pcea1, d2pcea3, d2pceb1, d2pceb3, d2pcec1, d2pcec3, d2pced1, d2pced3, d2pcee1, d2pcee3, d2pcef1, d2pcef3, d2pceg1, d2pceg3, d2pceh1, d2pceh3
      automated match to d1jpma1
      complexed with po4
    3. 2087867Domain d2pcec2: 2pce C:128-372 [205500]
      Other proteins in same PDB: d2pcea1, d2pcea3, d2pceb1, d2pceb3, d2pcec1, d2pcec3, d2pced1, d2pced3, d2pcee1, d2pcee3, d2pcef1, d2pcef3, d2pceg1, d2pceg3, d2pceh1, d2pceh3
      automated match to d1jpma1
      complexed with po4
    4. 2087868Domain d2pced2: 2pce D:128-372 [205502]
      Other proteins in same PDB: d2pcea1, d2pcea3, d2pceb1, d2pceb3, d2pcec1, d2pcec3, d2pced1, d2pced3, d2pcee1, d2pcee3, d2pcef1, d2pcef3, d2pceg1, d2pceg3, d2pceh1, d2pceh3
      automated match to d1jpma1
      complexed with po4
    5. 2087869Domain d2pcee2: 2pce E:128-372 [205504]
      Other proteins in same PDB: d2pcea1, d2pcea3, d2pceb1, d2pceb3, d2pcec1, d2pcec3, d2pced1, d2pced3, d2pcee1, d2pcee3, d2pcef1, d2pcef3, d2pceg1, d2pceg3, d2pceh1, d2pceh3
      automated match to d1jpma1
      complexed with po4
    6. 2087870Domain d2pcef2: 2pce F:128-372 [205506]
      Other proteins in same PDB: d2pcea1, d2pcea3, d2pceb1, d2pceb3, d2pcec1, d2pcec3, d2pced1, d2pced3, d2pcee1, d2pcee3, d2pcef1, d2pcef3, d2pceg1, d2pceg3, d2pceh1, d2pceh3
      automated match to d1jpma1
      complexed with po4
    7. 2087871Domain d2pceg2: 2pce G:128-372 [205508]
      Other proteins in same PDB: d2pcea1, d2pcea3, d2pceb1, d2pceb3, d2pcec1, d2pcec3, d2pced1, d2pced3, d2pcee1, d2pcee3, d2pcef1, d2pcef3, d2pceg1, d2pceg3, d2pceh1, d2pceh3
      automated match to d1jpma1
      complexed with po4
    8. 2087872Domain d2pceh2: 2pce H:128-372 [205510]
      Other proteins in same PDB: d2pcea1, d2pcea3, d2pceb1, d2pceb3, d2pcec1, d2pcec3, d2pced1, d2pced3, d2pcee1, d2pcee3, d2pcef1, d2pcef3, d2pceg1, d2pceg3, d2pceh1, d2pceh3
      automated match to d1jpma1
      complexed with po4
  2. Domain(s) for 2qdd:
    1. 2087875Domain d2qdda2: 2qdd A:128-368 [231200]
      Other proteins in same PDB: d2qdda1, d2qdda3, d2qdda4, d2qddb1, d2qddb3, d2qddb4
      automated match to d3eeza2
      complexed with gol
    2. 2087876Domain d2qddb2: 2qdd B:128-368 [231202]
      Other proteins in same PDB: d2qdda1, d2qdda3, d2qdda4, d2qddb1, d2qddb3, d2qddb4
      automated match to d3eeza2
      complexed with gol
  3. Domain(s) for 2rdx:
    1. 2087858Domain d2rdxa2: 2rdx A:128-368 [231270]
      Other proteins in same PDB: d2rdxa1, d2rdxa3, d2rdxb1, d2rdxb3, d2rdxc1, d2rdxc3, d2rdxd1, d2rdxd3, d2rdxe1, d2rdxe3, d2rdxe4, d2rdxf1, d2rdxf2, d2rdxg1, d2rdxg3, d2rdxh1, d2rdxh3
      automated match to d4mggf2
      complexed with gol, mg
    2. 2087859Domain d2rdxb2: 2rdx B:128-368 [231264]
      Other proteins in same PDB: d2rdxa1, d2rdxa3, d2rdxb1, d2rdxb3, d2rdxc1, d2rdxc3, d2rdxd1, d2rdxd3, d2rdxe1, d2rdxe3, d2rdxe4, d2rdxf1, d2rdxf2, d2rdxg1, d2rdxg3, d2rdxh1, d2rdxh3
      automated match to d4mggf2
      complexed with gol, mg
    3. 2087860Domain d2rdxc2: 2rdx C:128-368 [231266]
      Other proteins in same PDB: d2rdxa1, d2rdxa3, d2rdxb1, d2rdxb3, d2rdxc1, d2rdxc3, d2rdxd1, d2rdxd3, d2rdxe1, d2rdxe3, d2rdxe4, d2rdxf1, d2rdxf2, d2rdxg1, d2rdxg3, d2rdxh1, d2rdxh3
      automated match to d4mggf2
      complexed with gol, mg
    4. 2087861Domain d2rdxd2: 2rdx D:128-368 [231268]
      Other proteins in same PDB: d2rdxa1, d2rdxa3, d2rdxb1, d2rdxb3, d2rdxc1, d2rdxc3, d2rdxd1, d2rdxd3, d2rdxe1, d2rdxe3, d2rdxe4, d2rdxf1, d2rdxf2, d2rdxg1, d2rdxg3, d2rdxh1, d2rdxh3
      automated match to d4mggf2
      complexed with gol, mg
    5. 2087862Domain d2rdxe2: 2rdx E:128-369 [231272]
      Other proteins in same PDB: d2rdxa1, d2rdxa3, d2rdxb1, d2rdxb3, d2rdxc1, d2rdxc3, d2rdxd1, d2rdxd3, d2rdxe1, d2rdxe3, d2rdxe4, d2rdxf1, d2rdxf2, d2rdxg1, d2rdxg3, d2rdxh1, d2rdxh3
      automated match to d4mggf2
      complexed with gol, mg
    6. 2087863Domain d2rdxg2: 2rdx G:128-369 [238855]
      Other proteins in same PDB: d2rdxa1, d2rdxa3, d2rdxb1, d2rdxb3, d2rdxc1, d2rdxc3, d2rdxd1, d2rdxd3, d2rdxe1, d2rdxe3, d2rdxe4, d2rdxf1, d2rdxf2, d2rdxg1, d2rdxg3, d2rdxh1, d2rdxh3
      automated match to d2rdxe2
      complexed with gol, mg
    7. 2087864Domain d2rdxh2: 2rdx H:128-368 [238857]
      Other proteins in same PDB: d2rdxa1, d2rdxa3, d2rdxb1, d2rdxb3, d2rdxc1, d2rdxc3, d2rdxd1, d2rdxd3, d2rdxe1, d2rdxe3, d2rdxe4, d2rdxf1, d2rdxf2, d2rdxg1, d2rdxg3, d2rdxh1, d2rdxh3
      automated match to d2rdxb2
      complexed with gol, mg
  4. Domain(s) for 3fv9:
    1. 2087850Domain d3fv9a2: 3fv9 A:128-374 [210201]
      Other proteins in same PDB: d3fv9a1, d3fv9a3, d3fv9b1, d3fv9b3, d3fv9c1, d3fv9c3, d3fv9d1, d3fv9d3, d3fv9e1, d3fv9e3, d3fv9f1, d3fv9f3, d3fv9g1, d3fv9g3, d3fv9h1, d3fv9h3
      automated match to d1jpma1
      complexed with mg
    2. 2087851Domain d3fv9b2: 3fv9 B:128-373 [210203]
      Other proteins in same PDB: d3fv9a1, d3fv9a3, d3fv9b1, d3fv9b3, d3fv9c1, d3fv9c3, d3fv9d1, d3fv9d3, d3fv9e1, d3fv9e3, d3fv9f1, d3fv9f3, d3fv9g1, d3fv9g3, d3fv9h1, d3fv9h3
      automated match to d1jpma1
      complexed with mg
    3. 2087852Domain d3fv9c2: 3fv9 C:128-374 [210205]
      Other proteins in same PDB: d3fv9a1, d3fv9a3, d3fv9b1, d3fv9b3, d3fv9c1, d3fv9c3, d3fv9d1, d3fv9d3, d3fv9e1, d3fv9e3, d3fv9f1, d3fv9f3, d3fv9g1, d3fv9g3, d3fv9h1, d3fv9h3
      automated match to d1jpma1
      complexed with mg
    4. 2087853Domain d3fv9d2: 3fv9 D:128-373 [210207]
      Other proteins in same PDB: d3fv9a1, d3fv9a3, d3fv9b1, d3fv9b3, d3fv9c1, d3fv9c3, d3fv9d1, d3fv9d3, d3fv9e1, d3fv9e3, d3fv9f1, d3fv9f3, d3fv9g1, d3fv9g3, d3fv9h1, d3fv9h3
      automated match to d1jpma1
      complexed with mg
    5. 2087854Domain d3fv9e2: 3fv9 E:128-373 [210209]
      Other proteins in same PDB: d3fv9a1, d3fv9a3, d3fv9b1, d3fv9b3, d3fv9c1, d3fv9c3, d3fv9d1, d3fv9d3, d3fv9e1, d3fv9e3, d3fv9f1, d3fv9f3, d3fv9g1, d3fv9g3, d3fv9h1, d3fv9h3
      automated match to d1jpma1
      complexed with mg
    6. 2087855Domain d3fv9f2: 3fv9 F:128-373 [210211]
      Other proteins in same PDB: d3fv9a1, d3fv9a3, d3fv9b1, d3fv9b3, d3fv9c1, d3fv9c3, d3fv9d1, d3fv9d3, d3fv9e1, d3fv9e3, d3fv9f1, d3fv9f3, d3fv9g1, d3fv9g3, d3fv9h1, d3fv9h3
      automated match to d1jpma1
      complexed with mg
    7. 2087856Domain d3fv9g2: 3fv9 G:128-373 [210213]
      Other proteins in same PDB: d3fv9a1, d3fv9a3, d3fv9b1, d3fv9b3, d3fv9c1, d3fv9c3, d3fv9d1, d3fv9d3, d3fv9e1, d3fv9e3, d3fv9f1, d3fv9f3, d3fv9g1, d3fv9g3, d3fv9h1, d3fv9h3
      automated match to d1jpma1
      complexed with mg
    8. 2087857Domain d3fv9h2: 3fv9 H:128-374 [210215]
      Other proteins in same PDB: d3fv9a1, d3fv9a3, d3fv9b1, d3fv9b3, d3fv9c1, d3fv9c3, d3fv9d1, d3fv9d3, d3fv9e1, d3fv9e3, d3fv9f1, d3fv9f3, d3fv9g1, d3fv9g3, d3fv9h1, d3fv9h3
      automated match to d1jpma1
      complexed with mg
  5. Domain(s) for 3fvd:
    1. 2087873Domain d3fvda2: 3fvd A:128-368 [246189]
      Other proteins in same PDB: d3fvda1, d3fvda3, d3fvda4, d3fvdb1, d3fvdb3, d3fvdb4
      automated match to d2qdda2
      complexed with mg
    2. 2087874Domain d3fvdb2: 3fvd B:128-368 [246191]
      Other proteins in same PDB: d3fvda1, d3fvda3, d3fvda4, d3fvdb1, d3fvdb3, d3fvdb4
      automated match to d2qdda2
      complexed with mg

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