Lineage for d2fjfm2 (2fjf M:108-211)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2021373Class b: All beta proteins [48724] (177 folds)
  3. 2021374Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (33 superfamilies)
    sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
    some members of the fold have additional strands
  4. 2021375Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families) (S)
  5. 2025133Family b.1.1.2: C1 set domains (antibody constant domain-like) [48942] (24 proteins)
  6. 2029182Protein automated matches [190374] (16 species)
    not a true protein
  7. 2029210Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [187221] (698 PDB entries)
  8. 2029856Domain d2fjfm2: 2fjf M:108-211 [197903]
    Other proteins in same PDB: d2fjfa1, d2fjfb1, d2fjfb2, d2fjfc1, d2fjfd1, d2fjfd2, d2fjfe1, d2fjff1, d2fjff2, d2fjfg1, d2fjfh1, d2fjfh2, d2fjfi1, d2fjfi2, d2fjfj1, d2fjfk1, d2fjfk2, d2fjfl1, d2fjfm1, d2fjfn1, d2fjfn2, d2fjfo1, d2fjfp1, d2fjfp2, d2fjfq1, d2fjfr1, d2fjfr2, d2fjfs1, d2fjft1, d2fjft2, d2fjfu1, d2fjfv1, d2fjfv2, d2fjfw1, d2fjfx1, d2fjfx2
    automated match to d1rhha2

Details for d2fjfm2

PDB Entry: 2fjf (more details), 2.65 Å

PDB Description: Structure of the G6 Fab, a phage derived VEGF binding Fab
PDB Compounds: (M:) Light Chain of a VEGF binding Antibody

SCOPe Domain Sequences for d2fjfm2:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2fjfm2 b.1.1.2 (M:108-211) automated matches {Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]}
rtvaapsvfifppsdeqlksgtasvvcllnnfypreakvqwkvdnalqsgnsqesvteqd
skdstyslsstltlskadyekhkvyacevthqglsspvtksfnr

SCOPe Domain Coordinates for d2fjfm2:

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Timeline for d2fjfm2:

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d2fjfm1
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d2fjfa1, d2fjfa2, d2fjfb1, d2fjfb2, d2fjfc1, d2fjfc2, d2fjfd1, d2fjfd2, d2fjfe1, d2fjfe2, d2fjff1, d2fjff2, d2fjfg1, d2fjfg2, d2fjfh1, d2fjfh2, d2fjfi1, d2fjfi2, d2fjfj1, d2fjfj2, d2fjfk1, d2fjfk2, d2fjfl1, d2fjfl2, d2fjfn1, d2fjfn2, d2fjfo1, d2fjfo2, d2fjfp1, d2fjfp2, d2fjfq1, d2fjfq2, d2fjfr1, d2fjfr2, d2fjfs1, d2fjfs2, d2fjft1, d2fjft2, d2fjfu1, d2fjfu2, d2fjfv1, d2fjfv2, d2fjfw1, d2fjfw2, d2fjfx1, d2fjfx2