Lineage for Protein: automated matches

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2078560Fold c.1: TIM beta/alpha-barrel [51350] (33 superfamilies)
    contains parallel beta-sheet barrel, closed; n=8, S=8; strand order 12345678
    the first seven superfamilies have similar phosphate-binding sites
  4. 2079053Superfamily c.1.2: Ribulose-phoshate binding barrel [51366] (7 families) (S)
  5. 2079751Family c.1.2.6: PdxS-like [141755] (2 protein domains)
    Pfam PF01680; SOR/SNZ
  6. 2079760Protein automated matches [193117] (4 species)
    not a true protein

Species:

  1. 2079761Bacillus subtilis [TaxId:1423] [230975] (2 PDB entries)
    1. Domains for 2nv1:
      1. 2079762Domain d2nv1a_: 2nv1 A: [243239]
        automated match to d2nv2i_
        complexed with cl, edo, mg
      2. 2079763Domain d2nv1b_: 2nv1 B: [243240]
        automated match to d2nv2i_
        complexed with cl, edo, mg
      3. 2079764Domain d2nv1c_: 2nv1 C: [243241]
        automated match to d2nv2i_
        complexed with cl, edo, mg
      4. 2079765Domain d2nv1d_: 2nv1 D: [243242]
        automated match to d2nv2i_
        complexed with cl, edo, mg
      5. 2079766Domain d2nv1e_: 2nv1 E: [243243]
        automated match to d2nv2i_
        complexed with cl, edo, mg
      6. 2079767Domain d2nv1f_: 2nv1 F: [243244]
        automated match to d2nv2i_
        complexed with cl, edo, mg
    2. Domains for 2nv2:
      1. 2079768Domain d2nv2a_: 2nv2 A: [230976]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d4jdyc_
        complexed with cl, edo, gln
      2. 2079769Domain d2nv2c_: 2nv2 C: [230977]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d4jdyc_
        complexed with cl, edo, gln
      3. 2079770Domain d2nv2e_: 2nv2 E: [230978]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d4jdyc_
        complexed with cl, edo, gln
      4. 2079771Domain d2nv2g_: 2nv2 G: [230979]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d4jdyc_
        complexed with cl, edo, gln
      5. 2079772Domain d2nv2i_: 2nv2 I: [230980]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d4jdyc_
        complexed with cl, edo, gln
      6. 2079773Domain d2nv2k_: 2nv2 K: [230981]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d4jdyc_
        complexed with cl, edo, gln
      7. 2079774Domain d2nv2m_: 2nv2 M: [230982]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d4jdyc_
        complexed with cl, edo, gln
      8. 2079775Domain d2nv2o_: 2nv2 O: [230983]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d4jdyc_
        complexed with cl, edo, gln
      9. 2079776Domain d2nv2q_: 2nv2 Q: [238766]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d2nv2i_
        complexed with cl, edo, gln
      10. 2079777Domain d2nv2s_: 2nv2 S: [238767]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d2nv2i_
        complexed with cl, edo, gln
      11. 2079778Domain d2nv2u_: 2nv2 U: [238768]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d2nv2i_
        complexed with cl, edo, gln
      12. 2079779Domain d2nv2w_: 2nv2 W: [238769]
        Other proteins in same PDB: d2nv2b_, d2nv2d_, d2nv2f_, d2nv2h_, d2nv2j_, d2nv2l_, d2nv2n_, d2nv2p_, d2nv2r_, d2nv2t_, d2nv2v_, d2nv2x_
        automated match to d2nv2i_
        complexed with cl, edo, gln
  2. 2079780Mycobacterium tuberculosis [TaxId:1773] [193118] (1 PDB entry)
  3. 2079784Thermotoga maritima [TaxId:2336] [255244] (1 PDB entry)
  4. 2079788Thermus thermophilus HB8 [TaxId:300852] [255723] (1 PDB entry)

More info for Protein automated matches from c.1.2.6: PdxS-like

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