Lineage for Protein: automated matches

  1. Root: SCOPe 2.05
  2. 1886641Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (381 folds)
  3. 1933670Fold d.145: FAD-binding/transporter-associated domain-like [56175] (1 superfamily)
    consists of two alpha+beta subdomains
  4. 1933671Superfamily d.145.1: FAD-binding/transporter-associated domain-like [56176] (5 families) (S)
  5. 1933899Family d.145.1.0: automated matches [191624] (1 protein)
    not a true family
  6. 1933900Protein automated matches [191143] (7 species)
    not a true protein

Species:

  1. 1933901Brevibacterium sterolicum [TaxId:1702] [255227] (1 PDB entry)
  2. 1933903Listeria monocytogenes [TaxId:1639] [226225] (1 PDB entry)
  3. 1933905Maize (Zea mays) [TaxId:4577] [225479] (14 PDB entries)
    1. Domain for 2qkn:
    2. Domain for 2qpm:
    3. Domain for 3bw7:
    4. Domain for 3c0p:
    5. Domain for 3dq0:
    6. Domain for 3kjm:
    7. Domain for 3s1c:
    8. Domain for 3s1d:
    9. Domain for 3s1e:
    10. Domain for 3s1f:
    11. Domains for 4ml8:
      1. 1933921Domain d4ml8a1: 4ml8 A:29-234 [269679]
        Other proteins in same PDB: d4ml8a2, d4ml8b2, d4ml8c2, d4ml8d2
        automated match to d3s1da1
        complexed with fad, peg
      2. 1933922Domain d4ml8b1: 4ml8 B:29-234 [269675]
        Other proteins in same PDB: d4ml8a2, d4ml8b2, d4ml8c2, d4ml8d2
        automated match to d3s1da1
        complexed with fad, peg
      3. 1933923Domain d4ml8c1: 4ml8 C:29-234 [269677]
        Other proteins in same PDB: d4ml8a2, d4ml8b2, d4ml8c2, d4ml8d2
        automated match to d3s1da1
        complexed with fad, peg
      4. 1933924Domain d4ml8d1: 4ml8 D:29-234 [269670]
        Other proteins in same PDB: d4ml8a2, d4ml8b2, d4ml8c2, d4ml8d2
        automated match to d3s1da1
        complexed with fad, peg
    12. Domains for 4mla:
      1. 1933919Domain d4mlaa1: 4mla A:29-234 [269681]
        Other proteins in same PDB: d4mlaa2, d4mlab2
        automated match to d3s1da1
        complexed with edo, fad, gol, ipa
      2. 1933920Domain d4mlab1: 4mla B:29-234 [269669]
        Other proteins in same PDB: d4mlaa2, d4mlab2
        automated match to d3s1da1
        complexed with edo, fad, gol, ipa
    13. Domain for 4o95:
    14. Domains for 4oal:
      1. 1933917Domain d4oala1: 4oal A:40-246 [270983]
        Other proteins in same PDB: d4oala2, d4oalb2
        automated match to d1w1oa2
        complexed with 245, dms, fad
      2. 1933918Domain d4oalb1: 4oal B:40-246 [270985]
        Other proteins in same PDB: d4oala2, d4oalb2
        automated match to d1w1oa2
        complexed with 245, dms, fad
  4. 1933925Pseudomonas aeruginosa [TaxId:287] [189275] (1 PDB entry)
  5. 1933927Rhodobacter capsulatus [TaxId:1061] [255637] (2 PDB entries)
    1. Domains for 2w3r:
      1. 1933932Domain d2w3ra3: 2w3r A:179-345 [238898]
        Other proteins in same PDB: d2w3ra1, d2w3ra2, d2w3ra4, d2w3rb1, d2w3rb2, d2w3rc1, d2w3rc2, d2w3rc4, d2w3rd1, d2w3rd2, d2w3re1, d2w3re2, d2w3re4, d2w3rf1, d2w3rf2, d2w3rg1, d2w3rg2, d2w3rg4, d2w3rh1, d2w3rh2
        automated match to d1jroa4
        complexed with ca, fad, fes, hpa, mom, mpn
      2. 1933933Domain d2w3rc3: 2w3r C:179-345 [238902]
        Other proteins in same PDB: d2w3ra1, d2w3ra2, d2w3ra4, d2w3rb1, d2w3rb2, d2w3rc1, d2w3rc2, d2w3rc4, d2w3rd1, d2w3rd2, d2w3re1, d2w3re2, d2w3re4, d2w3rf1, d2w3rf2, d2w3rg1, d2w3rg2, d2w3rg4, d2w3rh1, d2w3rh2
        automated match to d1jroa4
        complexed with ca, fad, fes, hpa, mom, mpn
      3. 1933934Domain d2w3re3: 2w3r E:179-345 [238906]
        Other proteins in same PDB: d2w3ra1, d2w3ra2, d2w3ra4, d2w3rb1, d2w3rb2, d2w3rc1, d2w3rc2, d2w3rc4, d2w3rd1, d2w3rd2, d2w3re1, d2w3re2, d2w3re4, d2w3rf1, d2w3rf2, d2w3rg1, d2w3rg2, d2w3rg4, d2w3rh1, d2w3rh2
        automated match to d1jroa4
        complexed with ca, fad, fes, hpa, mom, mpn
      4. 1933935Domain d2w3rg3: 2w3r G:179-345 [238910]
        Other proteins in same PDB: d2w3ra1, d2w3ra2, d2w3ra4, d2w3rb1, d2w3rb2, d2w3rc1, d2w3rc2, d2w3rc4, d2w3rd1, d2w3rd2, d2w3re1, d2w3re2, d2w3re4, d2w3rf1, d2w3rf2, d2w3rg1, d2w3rg2, d2w3rg4, d2w3rh1, d2w3rh2
        automated match to d1jroa4
        complexed with ca, fad, fes, hpa, mom, mpn
    2. Domains for 2w3s:
      1. 1933928Domain d2w3sa3: 2w3s A:179-345 [238914]
        Other proteins in same PDB: d2w3sa1, d2w3sa2, d2w3sa4, d2w3sb1, d2w3sb2, d2w3sc1, d2w3sc2, d2w3sc4, d2w3sd1, d2w3sd2, d2w3se1, d2w3se2, d2w3se4, d2w3sf1, d2w3sf2, d2w3sg1, d2w3sg2, d2w3sg4, d2w3sh1, d2w3sh2
        automated match to d1jroa4
        complexed with ca, fad, fes, mom, mpn, xan
      2. 1933929Domain d2w3sc3: 2w3s C:179-345 [238918]
        Other proteins in same PDB: d2w3sa1, d2w3sa2, d2w3sa4, d2w3sb1, d2w3sb2, d2w3sc1, d2w3sc2, d2w3sc4, d2w3sd1, d2w3sd2, d2w3se1, d2w3se2, d2w3se4, d2w3sf1, d2w3sf2, d2w3sg1, d2w3sg2, d2w3sg4, d2w3sh1, d2w3sh2
        automated match to d1jroa4
        complexed with ca, fad, fes, mom, mpn, xan
      3. 1933930Domain d2w3se3: 2w3s E:179-345 [238922]
        Other proteins in same PDB: d2w3sa1, d2w3sa2, d2w3sa4, d2w3sb1, d2w3sb2, d2w3sc1, d2w3sc2, d2w3sc4, d2w3sd1, d2w3sd2, d2w3se1, d2w3se2, d2w3se4, d2w3sf1, d2w3sf2, d2w3sg1, d2w3sg2, d2w3sg4, d2w3sh1, d2w3sh2
        automated match to d1jroa4
        complexed with ca, fad, fes, mom, mpn, xan
      4. 1933931Domain d2w3sg3: 2w3s G:179-345 [238926]
        Other proteins in same PDB: d2w3sa1, d2w3sa2, d2w3sa4, d2w3sb1, d2w3sb2, d2w3sc1, d2w3sc2, d2w3sc4, d2w3sd1, d2w3sd2, d2w3se1, d2w3se2, d2w3se4, d2w3sf1, d2w3sf2, d2w3sg1, d2w3sg2, d2w3sg4, d2w3sh1, d2w3sh2
        automated match to d1jroa4
        complexed with ca, fad, fes, mom, mpn, xan
  6. 1933936Thale cress (Arabidopsis thaliana) [TaxId:3702] [225037] (2 PDB entries)
    1. Domain for 2exr:
    2. Domain for 2q4w:
  7. 1933939Vibrio cholerae [TaxId:243277] [232563] (1 PDB entry)

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