Lineage for Protein: automated matches

  1. Root: SCOPe 2.03
  2. 1458801Class g: Small proteins [56992] (90 folds)
  3. 1463401Fold g.39: Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain) [57715] (1 superfamily)
    alpha+beta metal(zinc)-bound fold
  4. 1463402Superfamily g.39.1: Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain) [57716] (19 families) (S)
  5. 1463917Family g.39.1.0: automated matches [191378] (1 protein)
    not a true family
  6. 1463918Protein automated matches [190463] (4 species)
    not a true protein

Species:

  1. 1463919Bacillus anthracis [TaxId:260799] [225213] (1 PDB entry)
  2. 1463921Bacillus cereus [TaxId:1396] [225215] (1 PDB entry)
  3. 1463923Emericella nidulans [TaxId:162425] [225494] (3 PDB entries)
    1. Domains for 2vus:
      1. 1463932Domain d2vusi_: 2vus I: [153565]
        Other proteins in same PDB: d2vusa_, d2vusb_, d2vusc_, d2vusd_, d2vuse_, d2vusf_, d2vusg_, d2vush_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
      2. 1463933Domain d2vusj_: 2vus J: [153566]
        Other proteins in same PDB: d2vusa_, d2vusb_, d2vusc_, d2vusd_, d2vuse_, d2vusf_, d2vusg_, d2vush_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
      3. 1463934Domain d2vusk_: 2vus K: [153567]
        Other proteins in same PDB: d2vusa_, d2vusb_, d2vusc_, d2vusd_, d2vuse_, d2vusf_, d2vusg_, d2vush_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
      4. 1463935Domain d2vusl_: 2vus L: [153568]
        Other proteins in same PDB: d2vusa_, d2vusb_, d2vusc_, d2vusd_, d2vuse_, d2vusf_, d2vusg_, d2vush_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
      5. 1463936Domain d2vusm_: 2vus M: [153569]
        Other proteins in same PDB: d2vusa_, d2vusb_, d2vusc_, d2vusd_, d2vuse_, d2vusf_, d2vusg_, d2vush_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
      6. 1463937Domain d2vusn_: 2vus N: [153570]
        Other proteins in same PDB: d2vusa_, d2vusb_, d2vusc_, d2vusd_, d2vuse_, d2vusf_, d2vusg_, d2vush_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
      7. 1463938Domain d2vuso_: 2vus O: [153571]
        Other proteins in same PDB: d2vusa_, d2vusb_, d2vusc_, d2vusd_, d2vuse_, d2vusf_, d2vusg_, d2vush_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
      8. 1463939Domain d2vusp_: 2vus P: [153572]
        Other proteins in same PDB: d2vusa_, d2vusb_, d2vusc_, d2vusd_, d2vuse_, d2vusf_, d2vusg_, d2vush_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
    2. Domains for 2vut:
      1. 1463924Domain d2vuti_: 2vut I: [153581]
        Other proteins in same PDB: d2vuta_, d2vutb_, d2vutc_, d2vutd_, d2vute_, d2vutf_, d2vutg_, d2vuth_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
      2. 1463925Domain d2vutj_: 2vut J: [153582]
        Other proteins in same PDB: d2vuta_, d2vutb_, d2vutc_, d2vutd_, d2vute_, d2vutf_, d2vutg_, d2vuth_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
      3. 1463926Domain d2vutk_: 2vut K: [153583]
        Other proteins in same PDB: d2vuta_, d2vutb_, d2vutc_, d2vutd_, d2vute_, d2vutf_, d2vutg_, d2vuth_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
      4. 1463927Domain d2vutl_: 2vut L: [153584]
        Other proteins in same PDB: d2vuta_, d2vutb_, d2vutc_, d2vutd_, d2vute_, d2vutf_, d2vutg_, d2vuth_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
      5. 1463928Domain d2vutm_: 2vut M: [153585]
        Other proteins in same PDB: d2vuta_, d2vutb_, d2vutc_, d2vutd_, d2vute_, d2vutf_, d2vutg_, d2vuth_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
      6. 1463929Domain d2vutn_: 2vut N: [153586]
        Other proteins in same PDB: d2vuta_, d2vutb_, d2vutc_, d2vutd_, d2vute_, d2vutf_, d2vutg_, d2vuth_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
      7. 1463930Domain d2vuto_: 2vut O: [153587]
        Other proteins in same PDB: d2vuta_, d2vutb_, d2vutc_, d2vutd_, d2vute_, d2vutf_, d2vutg_, d2vuth_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
      8. 1463931Domain d2vutp_: 2vut P: [153588]
        Other proteins in same PDB: d2vuta_, d2vutb_, d2vutc_, d2vutd_, d2vute_, d2vutf_, d2vutg_, d2vuth_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
    3. Domains for 2vuu:
      1. 1463940Domain d2vuui_: 2vuu I: [153597]
        Other proteins in same PDB: d2vuua_, d2vuub_, d2vuuc_, d2vuud_, d2vuue_, d2vuuf_, d2vuug_, d2vuuh_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with nap, zn
      2. 1463941Domain d2vuuj_: 2vuu J: [153598]
        Other proteins in same PDB: d2vuua_, d2vuub_, d2vuuc_, d2vuud_, d2vuue_, d2vuuf_, d2vuug_, d2vuuh_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with nap, zn
      3. 1463942Domain d2vuuk_: 2vuu K: [153599]
        Other proteins in same PDB: d2vuua_, d2vuub_, d2vuuc_, d2vuud_, d2vuue_, d2vuuf_, d2vuug_, d2vuuh_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with nap, zn
      4. 1463943Domain d2vuul_: 2vuu L: [153600]
        Other proteins in same PDB: d2vuua_, d2vuub_, d2vuuc_, d2vuud_, d2vuue_, d2vuuf_, d2vuug_, d2vuuh_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with nap, zn
      5. 1463944Domain d2vuum_: 2vuu M: [153601]
        Other proteins in same PDB: d2vuua_, d2vuub_, d2vuuc_, d2vuud_, d2vuue_, d2vuuf_, d2vuug_, d2vuuh_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with nap, zn
      6. 1463945Domain d2vuun_: 2vuu N: [153602]
        Other proteins in same PDB: d2vuua_, d2vuub_, d2vuuc_, d2vuud_, d2vuue_, d2vuuf_, d2vuug_, d2vuuh_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with nap, zn
      7. 1463946Domain d2vuuo_: 2vuu O: [153603]
        Other proteins in same PDB: d2vuua_, d2vuub_, d2vuuc_, d2vuud_, d2vuue_, d2vuuf_, d2vuug_, d2vuuh_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with nap, zn
      8. 1463947Domain d2vuup_: 2vuu P: [153604]
        Other proteins in same PDB: d2vuua_, d2vuub_, d2vuuc_, d2vuud_, d2vuue_, d2vuuf_, d2vuug_, d2vuuh_
        automated match to d1gnfa_
        protein/DNA complex; complexed with nap, zn
  4. 1463948Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [187379] (3 PDB entries)
    1. Domains for 1w4r:
      1. 1463949Domain d1w4ra2: 1w4r A:151-191 [230357]
        Other proteins in same PDB: d1w4ra1, d1w4rb1, d1w4rc1, d1w4rd1, d1w4re1, d1w4rf1, d1w4rg1, d1w4rh1
        automated match to d1xbta2
        complexed with dtu, ttp, zn
      2. 1463950Domain d1w4rb2: 1w4r B:151-191 [230355]
        Other proteins in same PDB: d1w4ra1, d1w4rb1, d1w4rc1, d1w4rd1, d1w4re1, d1w4rf1, d1w4rg1, d1w4rh1
        automated match to d1xbta2
        complexed with dtu, ttp, zn
      3. 1463951Domain d1w4rc2: 1w4r C:151-191 [230359]
        Other proteins in same PDB: d1w4ra1, d1w4rb1, d1w4rc1, d1w4rd1, d1w4re1, d1w4rf1, d1w4rg1, d1w4rh1
        automated match to d1xbta2
        complexed with dtu, ttp, zn
      4. 1463952Domain d1w4rd2: 1w4r D:151-191 [230361]
        Other proteins in same PDB: d1w4ra1, d1w4rb1, d1w4rc1, d1w4rd1, d1w4re1, d1w4rf1, d1w4rg1, d1w4rh1
        automated match to d1xbta2
        complexed with dtu, ttp, zn
      5. 1463953Domain d1w4re2: 1w4r E:151-191 [230363]
        Other proteins in same PDB: d1w4ra1, d1w4rb1, d1w4rc1, d1w4rd1, d1w4re1, d1w4rf1, d1w4rg1, d1w4rh1
        automated match to d1xbta2
        complexed with dtu, ttp, zn
      6. 1463954Domain d1w4rf2: 1w4r F:151-191 [230365]
        Other proteins in same PDB: d1w4ra1, d1w4rb1, d1w4rc1, d1w4rd1, d1w4re1, d1w4rf1, d1w4rg1, d1w4rh1
        automated match to d1xbta2
        complexed with dtu, ttp, zn
      7. 1463955Domain d1w4rg2: 1w4r G:151-191 [230367]
        Other proteins in same PDB: d1w4ra1, d1w4rb1, d1w4rc1, d1w4rd1, d1w4re1, d1w4rf1, d1w4rg1, d1w4rh1
        automated match to d1xbta2
        complexed with dtu, ttp, zn
      8. 1463956Domain d1w4rh2: 1w4r H:151-191 [230369]
        Other proteins in same PDB: d1w4ra1, d1w4rb1, d1w4rc1, d1w4rd1, d1w4re1, d1w4rf1, d1w4rg1, d1w4rh1
        automated match to d1xbta2
        complexed with dtu, ttp, zn
    2. Domain for 2a66:
    3. Domains for 2wvj:
      1. 1463957Domain d2wvja2: 2wvj A:151-191 [231526]
        Other proteins in same PDB: d2wvja1, d2wvjb1, d2wvjc1, d2wvjd1, d2wvje1
        automated match to d1xbta2
        complexed with mg, ttp, zn; mutant
      2. 1463958Domain d2wvjb2: 2wvj B:151-192 [231520]
        Other proteins in same PDB: d2wvja1, d2wvjb1, d2wvjc1, d2wvjd1, d2wvje1
        automated match to d1xbta2
        complexed with mg, ttp, zn; mutant
      3. 1463959Domain d2wvjc2: 2wvj C:151-191 [231522]
        Other proteins in same PDB: d2wvja1, d2wvjb1, d2wvjc1, d2wvjd1, d2wvje1
        automated match to d1xbta2
        complexed with mg, ttp, zn; mutant
      4. 1463960Domain d2wvjd2: 2wvj D:151-191 [231528]
        Other proteins in same PDB: d2wvja1, d2wvjb1, d2wvjc1, d2wvjd1, d2wvje1
        automated match to d1xbta2
        complexed with mg, ttp, zn; mutant
      5. 1463961Domain d2wvje2: 2wvj E:151-191 [231527]
        Other proteins in same PDB: d2wvja1, d2wvjb1, d2wvjc1, d2wvjd1, d2wvje1
        automated match to d1xbta2
        complexed with mg, ttp, zn; mutant

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