Class b: All beta proteins [48724] (178 folds) |
Fold b.21: Virus attachment protein globular domain [49834] (1 superfamily) sandwich, 10 strands in 2 sheets; greek-key |
Superfamily b.21.1: Virus attachment protein globular domain [49835] (4 families) |
Family b.21.1.1: Adenovirus fiber protein "knob" domain [49836] (2 proteins) automatically mapped to Pfam PF00541 |
Protein automated matches [190333] (6 species) not a true protein |
Canine adenovirus 2 [TaxId:10514] [187888] (3 PDB entries) |
Domain d2j1kd_: 2j1k D: [145611] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2j1ke_: 2j1k E: [145612] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2j1kf_: 2j1k F: [145613] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2j1kh_: 2j1k H: [145614] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2j1ki_: 2j1k I: [145615] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2j1kl_: 2j1k L: [145616] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2j1km_: 2j1k M: [145617] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2j1kn_: 2j1k N: [145618] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2j1kq_: 2j1k Q: [145619] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2j1kr_: 2j1k R: [145620] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2j1ks_: 2j1k S: [145621] Other proteins in same PDB: d2j1ka_, d2j1kb_, d2j1kc1, d2j1kg_, d2j1kj_, d2j1kk_, d2j1ko_, d2j1kp_, d2j1kt_, d2j1kv_, d2j1kx_, d2j1ky_, d2j1kz_ automated match to d2j1kc1 |
Domain d2w9lc_: 2w9l C: [169122] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
Domain d2w9ld_: 2w9l D: [169123] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
Domain d2w9le_: 2w9l E: [169124] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
Domain d2w9lf_: 2w9l F: [169125] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
Domain d2w9lh_: 2w9l H: [169127] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
Domain d2w9li_: 2w9l I: [169128] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
Domain d2w9ll_: 2w9l L: [169131] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
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Domain d2w9ln_: 2w9l N: [169133] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
Domain d2w9lq_: 2w9l Q: [169136] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
Domain d2w9lr_: 2w9l R: [169137] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
Domain d2w9ls_: 2w9l S: [169138] Other proteins in same PDB: d2w9la_, d2w9lb_, d2w9lg_, d2w9lj_, d2w9lk_, d2w9lo_, d2w9lp_, d2w9lt_, d2w9lv_, d2w9lx_, d2w9ly_, d2w9lz_ automated match to d2j1kc1 complexed with gal, gl0, sia |
Domain d2wbva_: 2wbv A: [169189] automated match to d2j1kc1 complexed with gol, sia |
Domain d2wbvb_: 2wbv B: [169190] automated match to d2j1kc1 complexed with gol, sia |
Domain d2wbvc_: 2wbv C: [169191] automated match to d2j1kc1 complexed with gol, sia |
Domain d2wbvd_: 2wbv D: [169192] automated match to d2j1kc1 complexed with gol, sia |
Domain d2wbve_: 2wbv E: [169193] automated match to d2j1kc1 complexed with gol, sia |
Domain d2wbvf_: 2wbv F: [169194] automated match to d2j1kc1 complexed with gol, sia |
Chimpanzee adenovirus y25 [TaxId:1123958] [406124] (1 PDB entry) |
Domain d7op2a_: 7op2 A: [406185] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2b_: 7op2 B: [406189] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2c_: 7op2 C: [406212] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2d_: 7op2 D: [406229] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2e_: 7op2 E: [406193] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2f_: 7op2 F: [406132] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2g_: 7op2 G: [406125] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2h_: 7op2 H: [406188] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2i_: 7op2 I: [406127] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2j_: 7op2 J: [406146] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2k_: 7op2 K: [406135] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Domain d7op2l_: 7op2 L: [406133] automated match to d1knba_ complexed with ca, edo, trs |
Human adenovirus 11 [TaxId:10541] [225988] (1 PDB entry) |
Domain d3o8ea_: 3o8e A: [214228] automated match to d3f0ya_ complexed with dtd, nag |
Domain d3o8ec_: 3o8e C: [214229] automated match to d3f0ya_ complexed with dtd, nag |
Human adenovirus 14 [TaxId:10521] [188677] (1 PDB entry) |
Domain d3f0ya_: 3f0y A: [175388] automated match to d2o39a1 complexed with gol, imd |
Domain d3f0yb_: 3f0y B: [175389] automated match to d2o39a1 complexed with gol, imd |
Domain d3f0yc_: 3f0y C: [175390] automated match to d2o39a1 complexed with gol, imd |
Domain d3f0yd_: 3f0y D: [175391] automated match to d2o39a1 complexed with gol, imd |
Domain d3f0ye_: 3f0y E: [175392] automated match to d2o39a1 complexed with gol, imd |
Domain d3f0yf_: 3f0y F: [175393] automated match to d2o39a1 complexed with gol, imd |
Domain d3f0yg_: 3f0y G: [175394] automated match to d2o39a1 complexed with gol, imd |
Domain d3f0yh_: 3f0y H: [175395] automated match to d2o39a1 complexed with gol, imd |
Domain d3f0yi_: 3f0y I: [175396] automated match to d2o39a1 complexed with gol, imd |
Human adenovirus 37 [TaxId:52275] [188823] (4 PDB entries) |
Domain d2j12a_: 2j12 A: [137932] Other proteins in same PDB: d2j12b_ automated match to d1uxaa_ complexed with ca |
Domain d2wbwa_: 2wbw A: [169195] Other proteins in same PDB: d2wbwb_ automated match to d1uxaa_ complexed with ca, sia |
Domain d2wgta_: 2wgt A: [169329] automated match to d1uxaa_ complexed with 18d, zn |
Domain d2wgtb_: 2wgt B: [169330] automated match to d1uxaa_ complexed with 18d, zn |
Domain d2wgtc_: 2wgt C: [169331] automated match to d1uxaa_ complexed with 18d, zn |
Domain d2wgua_: 2wgu A: [169332] automated match to d1uxaa_ complexed with 42d, zn |
Domain d2wgub_: 2wgu B: [169333] automated match to d1uxaa_ complexed with 42d, zn |
Domain d2wguc_: 2wgu C: [169334] automated match to d1uxaa_ complexed with 42d, zn |
Human adenovirus 48 [TaxId:39641] [364468] (1 PDB entry) |
Domain d6fjqa_: 6fjq A: [364469] automated match to d1uxba_ complexed with edo, gol, so4 |
Domain d6fjqb_: 6fjq B: [364479] automated match to d1uxba_ complexed with edo, gol, so4 |
Timeline for Protein automated matches from b.21.1.1: Adenovirus fiber protein "knob" domain: