Lineage for Protein: automated matches

  1. Root: SCOPe 2.01
  2. 1054197Class e: Multi-domain proteins (alpha and beta) [56572] (66 folds)
  3. 1057387Fold e.29: beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase [64483] (1 superfamily)
    Multidomain subunits of complex domain organization
  4. 1057388Superfamily e.29.1: beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase [64484] (2 families) (S)
    The catalytic site is formed by the association of two double-psi beta-barrel domains, one from each subunit
  5. 1057389Family e.29.1.1: RNA-polymerase beta [64485] (3 proteins)
  6. 1057441Protein automated matches [190192] (3 species)
    not a true protein

Species:

  1. 1057442Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [187158] (2 PDB entries)
    1. Domain for 2nvq:
    2. Domain for 3cqz:
  2. 1057445Thermus thermophilus [TaxId:274] [186932] (6 PDB entries)
    1. Domains for 2a68:
      1. 1057450Domain d2a68c_: 2a68 C: [126195]
        Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68d1, d2a68e_, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68n1, d2a68o_, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
        automated match to d1iw7c_
        protein/RNA complex; complexed with mg, rbt, zn
      2. 1057451Domain d2a68m_: 2a68 M: [126205]
        Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68d1, d2a68e_, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68n1, d2a68o_, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
        automated match to d1iw7c_
        protein/RNA complex; complexed with mg, rbt, zn
    2. Domains for 2a69:
      1. 1057452Domain d2a69c_: 2a69 C: [126215]
        Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69d1, d2a69e_, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69n1, d2a69o_, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
        automated match to d1iw7c_
        protein/RNA complex; complexed with mg, rpt, zn
      2. 1057453Domain d2a69m_: 2a69 M: [126225]
        Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69d1, d2a69e_, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69n1, d2a69o_, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
        automated match to d1iw7c_
        protein/RNA complex; complexed with mg, rpt, zn
    3. Domains for 2a6e:
      1. 1057456Domain d2a6ec_: 2a6e C: [126244]
        Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ed1, d2a6ee_, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6en1, d2a6eo_, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
        automated match to d1iw7c_
        complexed with mg, zn
      2. 1057457Domain d2a6em_: 2a6e M: [126254]
        Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ed1, d2a6ee_, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6en1, d2a6eo_, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
        automated match to d1iw7c_
        complexed with mg, zn
    4. Domains for 2a6h:
      1. 1057446Domain d2a6hc_: 2a6h C: [126264]
        Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hd1, d2a6he_, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hn1, d2a6ho_, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
        automated match to d1iw7c_
        protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
      2. 1057447Domain d2a6hm_: 2a6h M: [126274]
        Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hd1, d2a6he_, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hn1, d2a6ho_, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
        automated match to d1iw7c_
        protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
    5. Domains for 2be5:
      1. 1057448Domain d2be5c_: 2be5 C: [128355]
        Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5d1, d2be5e_, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5n1, d2be5o_, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
        automated match to d1iw7c_
        protein/RNA complex; complexed with mg, tgt, zn
      2. 1057449Domain d2be5m_: 2be5 M: [128365]
        Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5d1, d2be5e_, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5n1, d2be5o_, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
        automated match to d1iw7c_
        protein/RNA complex; complexed with mg, tgt, zn
    6. Domains for 3eql:
      1. 1057454Domain d3eqlc_: 3eql C: [175156]
        Other proteins in same PDB: d3eqle_, d3eqlo_
        automated match to d1iw7c_
        protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mxp, zn
      2. 1057455Domain d3eqlm_: 3eql M: [175158]
        Other proteins in same PDB: d3eqle_, d3eqlo_
        automated match to d1iw7c_
        protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mxp, zn
  3. 1057458Thermus thermophilus [TaxId:300852] [187303] (1 PDB entry)

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