SCOPe 2.01: Species: Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]

Lineage for Species: Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]

Root: SCOPe 2.01
Class b: All beta proteins [48724] (174 folds)
Fold b.1: Immunoglobulin-like beta-sandwich [48725] (28 superfamilies)
sandwich; 7 strands in 2 sheets; greek-key
some members of the fold have additional strands
Superfamily b.1.1: Immunoglobulin [48726] (5 families)
Family b.1.1.1: V set domains (antibody variable domain-like) [48727] (33 proteins)
Protein automated matches [190119] (11 species)
not a true protein
Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] [188740] (24 PDB entries)

PDB entries in Species: Human (Homo sapiens) [TaxId: 9606]:

Domain(s) for 1t2j:
- Domain d1t2ja_: 1t2j A: [161745]
  automated match to d1vhpa_
  complexed with peg
Domain(s) for 2eiz:
- Domain d2eiza_: 2eiz A: [161412]
  Other proteins in same PDB: d2eizc1
  automated match to d1c08a_
  mutant
Domain(s) for 2eks:
- Domain d2eksa_: 2eks A: [161415]
  Other proteins in same PDB: d2eksc1
  automated match to d1c08a_
Domain(s) for 2hp4:
1. Domain d2hp4a_: 2hp4 A: [165191]
  automated match to d1akjd_
  complexed with gol, so4; mutant
2. Domain d2hp4b_: 2hp4 B: [165192]
  automated match to d1akjd_
  complexed with gol, so4; mutant
Domain(s) for 2j12:
- Domain d2j12b_: 2j12 B: [137933]
  Other proteins in same PDB: d2j12a_
  automated match to d1eaja_
  complexed with ca
Domain(s) for 2j1k:
1. Domain d2j1ka_: 2j1k A: [137941]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
2. Domain d2j1kb_: 2j1k B: [137942]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
3. Domain d2j1kg_: 2j1k G: [137943]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
4. Domain d2j1kj_: 2j1k J: [137944]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
5. Domain d2j1kk_: 2j1k K: [137945]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
6. Domain d2j1ko_: 2j1k O: [137946]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
7. Domain d2j1kp_: 2j1k P: [137947]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
8. Domain d2j1kt_: 2j1k T: [137948]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
9. Domain d2j1kv_: 2j1k V: [137949]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
10. Domain d2j1kx_: 2j1k X: [137950]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
11. Domain d2j1ky_: 2j1k Y: [137951]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
12. Domain d2j1kz_: 2j1k Z: [137952]
  Other proteins in same PDB: d2j1kc1, d2j1kd_, d2j1ke_, d2j1kf_, d2j1kh_, d2j1ki_, d2j1kl_, d2j1km_, d2j1kn_, d2j1kq_, d2j1kr_, d2j1ks_
  automated match to d1eaja_
Domain(s) for 2q1e:
1. Domain d2q1ea_: 2q1e A: [167389]
  automated match to d1b0wa_
  complexed with so4
2. Domain d2q1eb_: 2q1e B: [167390]
  automated match to d1b0wa_
  complexed with so4
3. Domain d2q1ec_: 2q1e C: [167391]
  automated match to d1b0wa_
  complexed with so4
4. Domain d2q1ed_: 2q1e D: [167392]
  automated match to d1b0wa_
  complexed with so4
Domain(s) for 2q20:
1. Domain d2q20a_: 2q20 A: [167393]
  automated match to d1igml_
2. Domain d2q20b_: 2q20 B: [167394]
  automated match to d1igml_
Domain(s) for 2w0k:
1. Domain d2w0ka_: 2w0k A: [168982]
  automated match to d1cd0a_
2. Domain d2w0kb_: 2w0k B: [168983]
  automated match to d1cd0a_
Domain(s) for 2w0l:
- Domain d2w0ld_: 2w0l D: [168984]
  automated match to d1cd0a_
  mutant
Domain(s) for 2wbw:
- Domain d2wbwb_: 2wbw B: [169196]
  Other proteins in same PDB: d2wbwa_
  automated match to d1eaja_
  complexed with ca, sia
Domain(s) for 2x44:
- Domain d2x44d_: 2x44 D: [169850]
  automated match to d1ah1a_
Domain(s) for 2x89:
1. Domain d2x89a_: 2x89 A: [169936]
  Other proteins in same PDB: d2x89d_, d2x89e_, d2x89f_, d2x89g_
  automated match to d1jtoa_
2. Domain d2x89b_: 2x89 B: [169937]
  Other proteins in same PDB: d2x89d_, d2x89e_, d2x89f_, d2x89g_
  automated match to d1jtoa_
3. Domain d2x89c_: 2x89 C: [169938]
  Other proteins in same PDB: d2x89d_, d2x89e_, d2x89f_, d2x89g_
  automated match to d1jtoa_
Domain(s) for 2yss:
- Domain d2yssa_: 2yss A: [161589]
  Other proteins in same PDB: d2yssc1
  automated match to d1c08a_
  mutant
Domain(s) for 3b5g:
1. Domain d3b5ga_: 3b5g A: [172430]
  automated match to d1cd0a_
  complexed with act, gol, na; mutant
2. Domain d3b5gb_: 3b5g B: [172431]
  automated match to d1cd0a_
  complexed with act, gol, na; mutant
Domain(s) for 3b9v:
- Domain d3b9vd_: 3b9v D: [172512]
  automated match to d1fvcb_
Domain(s) for 3bdx:
1. Domain d3bdxa_: 3bdx A: [172565]
  automated match to d1cd0a_
  complexed with act, gol, mes; mutant
2. Domain d3bdxb_: 3bdx B: [172566]
  automated match to d1cd0a_
  complexed with act, gol, mes; mutant
3. Domain d3bdxc_: 3bdx C: [172567]
  automated match to d1cd0a_
  complexed with act, gol, mes; mutant
Domain(s) for 3bx7:
- Domain d3bx7c_: 3bx7 C: [172894]
  Other proteins in same PDB: d3bx7a_
  automated match to d1ah1a_
Domain(s) for 3cdc:
1. Domain d3cdca_: 3cdc A: [173145]
  automated match to d1b0wa_
2. Domain d3cdcb_: 3cdc B: [173146]
  automated match to d1b0wa_
Domain(s) for 3cdf:
1. Domain d3cdfa_: 3cdf A: [173149]
  automated match to d1igml_
2. Domain d3cdfb_: 3cdf B: [173150]
  automated match to d1igml_
3. Domain d3cdfc_: 3cdf C: [173151]
  automated match to d1igml_
4. Domain d3cdfd_: 3cdf D: [173152]
  automated match to d1igml_
5. Domain d3cdfe_: 3cdf E: [173153]
  automated match to d1igml_
6. Domain d3cdff_: 3cdf F: [173154]
  automated match to d1igml_
Domain(s) for 3cdy:
1. Domain d3cdya_: 3cdy A: [173170]
  automated match to d1b0wa_
2. Domain d3cdyb_: 3cdy B: [173171]
  automated match to d1b0wa_
Domain(s) for 3dvi:
- Domain d3dvia_: 3dvi A: [174282]
  automated match to d1igml_
Domain(s) for 3lrh:
- Domain d3lrho_: 3lrh O: [180527]
  automated match to d2rhea_
Domain(s) for 3osk:
1. Domain d3oska_: 3osk A: [183269]
  automated match to d1ah1a_
  complexed with gol, nag
2. Domain d3oskb_: 3osk B: [183270]
  automated match to d1ah1a_
  complexed with gol, nag

More info for Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.1.1.1 automated matches

Timeline for Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.1.1.1 automated matches:

Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.1.1.1 automated matches is new in SCOPe 2.01-stable
Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.1.1.1 automated matches appears in SCOPe 2.02
Species Human (Homo sapiens) [TaxId:9606] from b.1.1.1 automated matches appears in the current release, SCOPe 2.08