Lineage for Species: Emericella nidulans [TaxId: 162425]

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 2826024Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2841004Fold c.2: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51734] (1 superfamily)
    core: 3 layers, a/b/a; parallel beta-sheet of 6 strands, order 321456
    The nucleotide-binding modes of this and the next two folds/superfamilies are similar
  4. 2841005Superfamily c.2.1: NAD(P)-binding Rossmann-fold domains [51735] (13 families) (S)
  5. 2841375Family c.2.1.2: Tyrosine-dependent oxidoreductases [51751] (73 proteins)
    also known as short-chain dehydrogenases and SDR family
    parallel beta-sheet is extended by 7th strand, order 3214567; left-handed crossover connection between strands 6 and 7
    has additional subdomain(s) that are not in the common domain
  6. 2842913Protein automated matches [190085] (59 species)
    not a true protein
  7. 2843088Species Emericella nidulans [TaxId:162425] [187249] (3 PDB entries)

PDB entries in Species: Emericella nidulans [TaxId: 162425]:

  1. Domain(s) for 2vus:
    1. 2843097Domain d2vusa_: 2vus A: [153557]
      Other proteins in same PDB: d2vusi_, d2vusj_, d2vusk_, d2vusl_, d2vusm_, d2vusn_, d2vuso_, d2vusp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
    2. 2843098Domain d2vusb_: 2vus B: [153558]
      Other proteins in same PDB: d2vusi_, d2vusj_, d2vusk_, d2vusl_, d2vusm_, d2vusn_, d2vuso_, d2vusp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
    3. 2843099Domain d2vusc_: 2vus C: [153559]
      Other proteins in same PDB: d2vusi_, d2vusj_, d2vusk_, d2vusl_, d2vusm_, d2vusn_, d2vuso_, d2vusp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
    4. 2843100Domain d2vusd_: 2vus D: [153560]
      Other proteins in same PDB: d2vusi_, d2vusj_, d2vusk_, d2vusl_, d2vusm_, d2vusn_, d2vuso_, d2vusp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
    5. 2843101Domain d2vuse_: 2vus E: [153561]
      Other proteins in same PDB: d2vusi_, d2vusj_, d2vusk_, d2vusl_, d2vusm_, d2vusn_, d2vuso_, d2vusp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
    6. 2843102Domain d2vusf_: 2vus F: [153562]
      Other proteins in same PDB: d2vusi_, d2vusj_, d2vusk_, d2vusl_, d2vusm_, d2vusn_, d2vuso_, d2vusp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
    7. 2843103Domain d2vusg_: 2vus G: [153563]
      Other proteins in same PDB: d2vusi_, d2vusj_, d2vusk_, d2vusl_, d2vusm_, d2vusn_, d2vuso_, d2vusp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
    8. 2843104Domain d2vush_: 2vus H: [153564]
      Other proteins in same PDB: d2vusi_, d2vusj_, d2vusk_, d2vusl_, d2vusm_, d2vusn_, d2vuso_, d2vusp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, so4, zn
  2. Domain(s) for 2vut:
    1. 2843089Domain d2vuta_: 2vut A: [153573]
      Other proteins in same PDB: d2vuti_, d2vutj_, d2vutk_, d2vutl_, d2vutm_, d2vutn_, d2vuto_, d2vutp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
    2. 2843090Domain d2vutb_: 2vut B: [153574]
      Other proteins in same PDB: d2vuti_, d2vutj_, d2vutk_, d2vutl_, d2vutm_, d2vutn_, d2vuto_, d2vutp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
    3. 2843091Domain d2vutc_: 2vut C: [153575]
      Other proteins in same PDB: d2vuti_, d2vutj_, d2vutk_, d2vutl_, d2vutm_, d2vutn_, d2vuto_, d2vutp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
    4. 2843092Domain d2vutd_: 2vut D: [153576]
      Other proteins in same PDB: d2vuti_, d2vutj_, d2vutk_, d2vutl_, d2vutm_, d2vutn_, d2vuto_, d2vutp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
    5. 2843093Domain d2vute_: 2vut E: [153577]
      Other proteins in same PDB: d2vuti_, d2vutj_, d2vutk_, d2vutl_, d2vutm_, d2vutn_, d2vuto_, d2vutp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
    6. 2843094Domain d2vutf_: 2vut F: [153578]
      Other proteins in same PDB: d2vuti_, d2vutj_, d2vutk_, d2vutl_, d2vutm_, d2vutn_, d2vuto_, d2vutp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
    7. 2843095Domain d2vutg_: 2vut G: [153579]
      Other proteins in same PDB: d2vuti_, d2vutj_, d2vutk_, d2vutl_, d2vutm_, d2vutn_, d2vuto_, d2vutp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
    8. 2843096Domain d2vuth_: 2vut H: [153580]
      Other proteins in same PDB: d2vuti_, d2vutj_, d2vutk_, d2vutl_, d2vutm_, d2vutn_, d2vuto_, d2vutp_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with cl, gol, nad, zn
  3. Domain(s) for 2vuu:
    1. 2843105Domain d2vuua_: 2vuu A: [153589]
      Other proteins in same PDB: d2vuui_, d2vuuj_, d2vuuk_, d2vuul_, d2vuum_, d2vuun_, d2vuuo_, d2vuup_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with nap, zn
    2. 2843106Domain d2vuub_: 2vuu B: [153590]
      Other proteins in same PDB: d2vuui_, d2vuuj_, d2vuuk_, d2vuul_, d2vuum_, d2vuun_, d2vuuo_, d2vuup_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with nap, zn
    3. 2843107Domain d2vuuc_: 2vuu C: [153591]
      Other proteins in same PDB: d2vuui_, d2vuuj_, d2vuuk_, d2vuul_, d2vuum_, d2vuun_, d2vuuo_, d2vuup_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with nap, zn
    4. 2843108Domain d2vuud_: 2vuu D: [153592]
      Other proteins in same PDB: d2vuui_, d2vuuj_, d2vuuk_, d2vuul_, d2vuum_, d2vuun_, d2vuuo_, d2vuup_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with nap, zn
    5. 2843109Domain d2vuue_: 2vuu E: [153593]
      Other proteins in same PDB: d2vuui_, d2vuuj_, d2vuuk_, d2vuul_, d2vuum_, d2vuun_, d2vuuo_, d2vuup_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with nap, zn
    6. 2843110Domain d2vuuf_: 2vuu F: [153594]
      Other proteins in same PDB: d2vuui_, d2vuuj_, d2vuuk_, d2vuul_, d2vuum_, d2vuun_, d2vuuo_, d2vuup_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with nap, zn
    7. 2843111Domain d2vuug_: 2vuu G: [153595]
      Other proteins in same PDB: d2vuui_, d2vuuj_, d2vuuk_, d2vuul_, d2vuum_, d2vuun_, d2vuuo_, d2vuup_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with nap, zn
    8. 2843112Domain d2vuuh_: 2vuu H: [153596]
      Other proteins in same PDB: d2vuui_, d2vuuj_, d2vuuk_, d2vuul_, d2vuum_, d2vuun_, d2vuuo_, d2vuup_
      automated match to d1k6jb_
      protein/DNA complex; complexed with nap, zn

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