Lineage for Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2078559Class c: Alpha and beta proteins (a/b) [51349] (148 folds)
  3. 2109203Fold c.37: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52539] (1 superfamily)
    3 layers: a/b/a, parallel or mixed beta-sheets of variable sizes
  4. 2109204Superfamily c.37.1: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases [52540] (26 families) (S)
    division into families based on beta-sheet topologies
  5. 2110099Family c.37.1.8: G proteins [52592] (79 protein domains)
    core: mixed beta-sheet of 6 strands, order 231456; strand 2 is antiparallel to the rest
  6. 2111131Protein automated matches [190047] (28 species)
    not a true protein
  7. 2111132Species Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId:4932] [187069] (9 PDB entries)

PDB entries in Species: Baker's yeast (Saccharomyces cerevisiae) [TaxId: 4932]:

  1. Domain(s) for 1zm2:
    1. 2111142Domain d1zm2a2: 1zm2 A:2-343 [125281]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a3, d1zm2a4, d1zm2a5, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c3, d1zm2c4, d1zm2c5, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e3, d1zm2e4, d1zm2e5, d1zm2f_
      automated match to d1n0ua2
      complexed with apr
    2. 2111143Domain d1zm2c2: 1zm2 C:2-343 [125287]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a3, d1zm2a4, d1zm2a5, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c3, d1zm2c4, d1zm2c5, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e3, d1zm2e4, d1zm2e5, d1zm2f_
      automated match to d1n0ua2
      complexed with apr
    3. 2111144Domain d1zm2e2: 1zm2 E:2-343 [125293]
      Other proteins in same PDB: d1zm2a1, d1zm2a3, d1zm2a4, d1zm2a5, d1zm2b_, d1zm2c1, d1zm2c3, d1zm2c4, d1zm2c5, d1zm2d_, d1zm2e1, d1zm2e3, d1zm2e4, d1zm2e5, d1zm2f_
      automated match to d1n0ua2
      complexed with apr
  2. Domain(s) for 1zm3:
    1. 2111145Domain d1zm3a2: 1zm3 A:2-343 [125299]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a3, d1zm3a4, d1zm3a5, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c3, d1zm3c4, d1zm3c5, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e3, d1zm3e4, d1zm3e5, d1zm3f_
      automated match to d1n0ua2
    2. 2111146Domain d1zm3c2: 1zm3 C:2-343 [125305]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a3, d1zm3a4, d1zm3a5, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c3, d1zm3c4, d1zm3c5, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e3, d1zm3e4, d1zm3e5, d1zm3f_
      automated match to d1n0ua2
    3. 2111147Domain d1zm3e2: 1zm3 E:2-343 [125311]
      Other proteins in same PDB: d1zm3a1, d1zm3a3, d1zm3a4, d1zm3a5, d1zm3b_, d1zm3c1, d1zm3c3, d1zm3c4, d1zm3c5, d1zm3d_, d1zm3e1, d1zm3e3, d1zm3e4, d1zm3e5, d1zm3f_
      automated match to d1n0ua2
  3. Domain(s) for 2e1r:
  4. Domain(s) for 2eqb:
  5. Domain(s) for 2k5u:
  6. Domain(s) for 2ksq:
  7. Domain(s) for 2x19:
  8. Domain(s) for 2zit:
    1. 2111136Domain d2zita1: 2zit A:2-343 [239064]
      Other proteins in same PDB: d2zita2, d2zita3, d2zita4, d2zita5, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc2, d2zitc3, d2zitc4, d2zitc5, d2zitd2, d2zitd3, d2zite2, d2zite3, d2zite4, d2zite5, d2zitf2, d2zitf3
      automated match to d1n0ua2
      protein/RNA complex; complexed with nad
    2. 2111137Domain d2zitc1: 2zit C:2-343 [239069]
      Other proteins in same PDB: d2zita2, d2zita3, d2zita4, d2zita5, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc2, d2zitc3, d2zitc4, d2zitc5, d2zitd2, d2zitd3, d2zite2, d2zite3, d2zite4, d2zite5, d2zitf2, d2zitf3
      automated match to d1n0ua2
      protein/RNA complex; complexed with nad
    3. 2111138Domain d2zite1: 2zit E:2-343 [239074]
      Other proteins in same PDB: d2zita2, d2zita3, d2zita4, d2zita5, d2zitb2, d2zitb3, d2zitc2, d2zitc3, d2zitc4, d2zitc5, d2zitd2, d2zitd3, d2zite2, d2zite3, d2zite4, d2zite5, d2zitf2, d2zitf3
      automated match to d1n0ua2
      protein/RNA complex; complexed with nad
  9. Domain(s) for 3a58:
    1. 2111133Domain d3a58b_: 3a58 B: [171747]
      automated match to d1ow3b_
      complexed with gnp, mg, po4
    2. 2111134Domain d3a58d_: 3a58 D: [171748]
      automated match to d1ow3b_
      complexed with gnp, mg, po4
    3. 2111135Domain d3a58f_: 3a58 F: [171749]
      automated match to d1ow3b_
      complexed with gnp, mg, po4

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