Lineage for Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]

  1. Root: SCOPe 2.08
  2. 3012399Class e: Multi-domain proteins (alpha and beta) [56572] (74 folds)
  3. 3019956Fold e.29: beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase [64483] (1 superfamily)
    Multidomain subunits of complex domain organization
  4. 3019957Superfamily e.29.1: beta and beta-prime subunits of DNA dependent RNA-polymerase [64484] (3 families) (S)
    The catalytic site is formed by the association of two double-psi beta-barrel domains, one from each subunit
  5. 3019958Family e.29.1.1: RNA-polymerase beta [64485] (4 proteins)
  6. 3020019Protein automated matches [190192] (4 species)
    not a true protein
  7. 3020037Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [186932] (8 PDB entries)

PDB entries in Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]:

  1. Domain(s) for 1zyr:
    1. 3020051Domain d1zyrc_: 1zyr C: [125853]
      Other proteins in same PDB: d1zyra1, d1zyra2, d1zyrb1, d1zyrb2, d1zyrd_, d1zyre_, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk1, d1zyrk2, d1zyrl1, d1zyrl2, d1zyrn_, d1zyro_, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3
      automated match to d1smyc_
      protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
    2. 3020052Domain d1zyrm_: 1zyr M: [125863]
      Other proteins in same PDB: d1zyra1, d1zyra2, d1zyrb1, d1zyrb2, d1zyrd_, d1zyre_, d1zyrf1, d1zyrf2, d1zyrf3, d1zyrk1, d1zyrk2, d1zyrl1, d1zyrl2, d1zyrn_, d1zyro_, d1zyrp1, d1zyrp2, d1zyrp3
      automated match to d1smyc_
      protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
  2. Domain(s) for 2a68:
    1. 3020042Domain d2a68c_: 2a68 C: [126195]
      Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68d_, d2a68e_, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68n_, d2a68o_, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
      automated match to d1iw7c_
      protein/RNA complex; complexed with mg, rbt, zn
    2. 3020043Domain d2a68m_: 2a68 M: [126205]
      Other proteins in same PDB: d2a68a1, d2a68a2, d2a68b1, d2a68b2, d2a68d_, d2a68e_, d2a68f1, d2a68f2, d2a68f3, d2a68k1, d2a68k2, d2a68l1, d2a68l2, d2a68n_, d2a68o_, d2a68p1, d2a68p2, d2a68p3
      automated match to d1iw7c_
      protein/RNA complex; complexed with mg, rbt, zn
  3. Domain(s) for 2a69:
    1. 3020044Domain d2a69c_: 2a69 C: [126215]
      Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69d_, d2a69e_, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69n_, d2a69o_, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
      automated match to d1iw7c_
      protein/RNA complex; complexed with mg, rpt, zn
    2. 3020045Domain d2a69m_: 2a69 M: [126225]
      Other proteins in same PDB: d2a69a1, d2a69a2, d2a69b1, d2a69b2, d2a69d_, d2a69e_, d2a69f1, d2a69f2, d2a69f3, d2a69k1, d2a69k2, d2a69l1, d2a69l2, d2a69n_, d2a69o_, d2a69p1, d2a69p2, d2a69p3
      automated match to d1iw7c_
      protein/RNA complex; complexed with mg, rpt, zn
  4. Domain(s) for 2a6e:
    1. 3020048Domain d2a6ec_: 2a6e C: [126244]
      Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ed_, d2a6ee_, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6en_, d2a6eo_, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
      automated match to d1iw7c_
      complexed with mg, zn
    2. 3020049Domain d2a6em_: 2a6e M: [126254]
      Other proteins in same PDB: d2a6ea1, d2a6ea2, d2a6eb1, d2a6eb2, d2a6ed_, d2a6ee_, d2a6ef1, d2a6ef2, d2a6ef3, d2a6ek1, d2a6ek2, d2a6el1, d2a6el2, d2a6en_, d2a6eo_, d2a6ep1, d2a6ep2, d2a6ep3
      automated match to d1iw7c_
      complexed with mg, zn
  5. Domain(s) for 2a6h:
    1. 3020038Domain d2a6hc_: 2a6h C: [126264]
      Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hd_, d2a6he_, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hn_, d2a6ho_, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
      automated match to d1iw7c_
      protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
    2. 3020039Domain d2a6hm_: 2a6h M: [126274]
      Other proteins in same PDB: d2a6ha1, d2a6ha2, d2a6hb1, d2a6hb2, d2a6hd_, d2a6he_, d2a6hf1, d2a6hf2, d2a6hf3, d2a6hk1, d2a6hk2, d2a6hl1, d2a6hl2, d2a6hn_, d2a6ho_, d2a6hp1, d2a6hp2, d2a6hp3
      automated match to d1iw7c_
      protein/RNA complex; complexed with mg, std, zn
  6. Domain(s) for 2be5:
    1. 3020040Domain d2be5c_: 2be5 C: [128355]
      Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5d_, d2be5e_, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5n_, d2be5o_, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
      automated match to d1iw7c_
      protein/RNA complex; complexed with mg, tgt, zn
    2. 3020041Domain d2be5m_: 2be5 M: [128365]
      Other proteins in same PDB: d2be5a1, d2be5a2, d2be5b1, d2be5b2, d2be5d_, d2be5e_, d2be5f1, d2be5f2, d2be5f3, d2be5k1, d2be5k2, d2be5l1, d2be5l2, d2be5n_, d2be5o_, d2be5p1, d2be5p2, d2be5p3
      automated match to d1iw7c_
      protein/RNA complex; complexed with mg, tgt, zn
  7. Domain(s) for 3eql:
    1. 3020046Domain d3eqlc_: 3eql C: [175156]
      Other proteins in same PDB: d3eqla1, d3eqla2, d3eqlb1, d3eqlb2, d3eqld_, d3eqle_, d3eqlf1, d3eqlf2, d3eqlf3, d3eqlk1, d3eqlk2, d3eqll1, d3eqll2, d3eqln_, d3eqlo_, d3eqlp1, d3eqlp2, d3eqlp3
      automated match to d1iw7c_
      protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mxp, zn
    2. 3020047Domain d3eqlm_: 3eql M: [175158]
      Other proteins in same PDB: d3eqla1, d3eqla2, d3eqlb1, d3eqlb2, d3eqld_, d3eqle_, d3eqlf1, d3eqlf2, d3eqlf3, d3eqlk1, d3eqlk2, d3eqll1, d3eqll2, d3eqln_, d3eqlo_, d3eqlp1, d3eqlp2, d3eqlp3
      automated match to d1iw7c_
      protein/DNA complex; protein/RNA complex; complexed with mg, mxp, zn
  8. Domain(s) for 5tmf:

More info for Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from e.29.1.1 automated matches

Timeline for Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from e.29.1.1 automated matches: