Lineage for Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]

  1. Root: SCOPe 2.03
  2. 1396887Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
  3. 1432788Fold d.141: Ribosomal protein L6 [56052] (1 superfamily)
    consists of two beta-sheets and one alpha-helix packed around single core
  4. 1432789Superfamily d.141.1: Ribosomal protein L6 [56053] (1 family) (S)
    automatically mapped to Pfam PF00347
  5. 1432790Family d.141.1.1: Ribosomal protein L6 [56054] (1 protein)
  6. 1432791Protein Ribosomal protein L6 [56055] (6 species)
    duplication: consists of two domains of this fold
  7. 1432946Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [160797] (15 PDB entries)
    Uniprot Q72I19 11-81! Uniprot Q72I19 82-170

PDB entries in Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]:

  1. Domain(s) for 1vsa:
    1. 1432967Domain d1vsaf1: 1vsa F:12-82 [144519]
      Other proteins in same PDB: d1vsaa1, d1vsab1, d1vsac1, d1vsah1, d1vsai1, d1vsaj1, d1vsal1, d1vsam1, d1vsao1, d1vsap1, d1vsaq1, d1vsar1, d1vsas1, d1vsat1, d1vsau1, d1vsaw1, d1vsax1, d1vsaz1
      automatically matched to 2J01 H:12-82
      protein/RNA complex
    2. 1432968Domain d1vsaf2: 1vsa F:83-171 [144520]
      Other proteins in same PDB: d1vsaa1, d1vsab1, d1vsac1, d1vsah1, d1vsai1, d1vsaj1, d1vsal1, d1vsam1, d1vsao1, d1vsap1, d1vsaq1, d1vsar1, d1vsas1, d1vsat1, d1vsau1, d1vsaw1, d1vsax1, d1vsaz1
      automatically matched to 2J01 H:83-171
      protein/RNA complex
  2. Domain(s) for 1vsp:
    1. 1432963Domain d1vspf1: 1vsp F:12-82 [145793]
      Other proteins in same PDB: d1vspa1, d1vspc1, d1vspi1, d1vspj1, d1vspo1, d1vspp1, d1vsps1, d1vspt1, d1vspz1
      automatically matched to 2J01 H:12-82
    2. 1432964Domain d1vspf2: 1vsp F:83-171 [145794]
      Other proteins in same PDB: d1vspa1, d1vspc1, d1vspi1, d1vspj1, d1vspo1, d1vspp1, d1vsps1, d1vspt1, d1vspz1
      automatically matched to 2J01 H:83-171
  3. Domain(s) for 1yl3:
    1. 1432969Domain d1yl3h1: 1yl3 H:7-81 [123578]
      Other proteins in same PDB: d1yl301, d1yl311, d1yl321, d1yl331, d1yl351, d1yl371, d1yl381, d1yl391, d1yl3c1, d1yl3d1, d1yl3d2, d1yl3f1, d1yl3i1, d1yl3i2, d1yl3j1, d1yl3j2, d1yl3k1, d1yl3k2, d1yl3l1, d1yl3l2, d1yl3m1, d1yl3n1, d1yl3r1, d1yl3s1, d1yl3t1, d1yl3u1, d1yl3v1, d1yl3w1, d1yl3x1
      automatically matched to d1rl6a1
    2. 1432970Domain d1yl3h2: 1yl3 H:82-170 [123579]
      Other proteins in same PDB: d1yl301, d1yl311, d1yl321, d1yl331, d1yl351, d1yl371, d1yl381, d1yl391, d1yl3c1, d1yl3d1, d1yl3d2, d1yl3f1, d1yl3i1, d1yl3i2, d1yl3j1, d1yl3j2, d1yl3k1, d1yl3k2, d1yl3l1, d1yl3l2, d1yl3m1, d1yl3n1, d1yl3r1, d1yl3s1, d1yl3t1, d1yl3u1, d1yl3v1, d1yl3w1, d1yl3x1
      automatically matched to d1rl6a2
  4. Domain(s) for 2b66:
    1. 1432971Domain d2b66h1: 2b66 H:7-81 [127957]
      Other proteins in same PDB: d2b6601, d2b6621, d2b6631, d2b6651, d2b6671, d2b6681, d2b6691, d2b66f1, d2b66i1, d2b66i2, d2b66k1, d2b66k2, d2b66n1, d2b66o1, d2b66r1, d2b66t1, d2b66u1, d2b66v1, d2b66w1, d2b66x1, d2b66y1, d2b66z1
      automatically matched to d1rl6a1
    2. 1432972Domain d2b66h2: 2b66 H:82-170 [127958]
      Other proteins in same PDB: d2b6601, d2b6621, d2b6631, d2b6651, d2b6671, d2b6681, d2b6691, d2b66f1, d2b66i1, d2b66i2, d2b66k1, d2b66k2, d2b66n1, d2b66o1, d2b66r1, d2b66t1, d2b66u1, d2b66v1, d2b66w1, d2b66x1, d2b66y1, d2b66z1
      automatically matched to d1rl6a2
  5. Domain(s) for 2b9n:
    1. 1432975Domain d2b9nh1: 2b9n H:7-81 [128149]
      Other proteins in same PDB: d2b9n01, d2b9n21, d2b9n31, d2b9n51, d2b9n71, d2b9n81, d2b9n91, d2b9nf1, d2b9ni1, d2b9ni2, d2b9nk1, d2b9nk2, d2b9nn1, d2b9no1, d2b9nr1, d2b9nt1, d2b9nu1, d2b9nv1, d2b9nw1, d2b9nx1, d2b9ny1, d2b9nz1
      automatically matched to d1rl6a1
    2. 1432976Domain d2b9nh2: 2b9n H:82-170 [128150]
      Other proteins in same PDB: d2b9n01, d2b9n21, d2b9n31, d2b9n51, d2b9n71, d2b9n81, d2b9n91, d2b9nf1, d2b9ni1, d2b9ni2, d2b9nk1, d2b9nk2, d2b9nn1, d2b9no1, d2b9nr1, d2b9nt1, d2b9nu1, d2b9nv1, d2b9nw1, d2b9nx1, d2b9ny1, d2b9nz1
      automatically matched to d1rl6a2
  6. Domain(s) for 2b9p:
    1. 1432973Domain d2b9ph1: 2b9p H:7-81 [128186]
      Other proteins in same PDB: d2b9p01, d2b9p21, d2b9p31, d2b9p51, d2b9p71, d2b9p81, d2b9p91, d2b9pf1, d2b9pi1, d2b9pi2, d2b9pk1, d2b9pk2, d2b9pn1, d2b9po1, d2b9pr1, d2b9pt1, d2b9pu1, d2b9pv1, d2b9pw1, d2b9px1, d2b9py1, d2b9pz1
      automatically matched to d1rl6a1
      protein/RNA complex
    2. 1432974Domain d2b9ph2: 2b9p H:82-170 [128187]
      Other proteins in same PDB: d2b9p01, d2b9p21, d2b9p31, d2b9p51, d2b9p71, d2b9p81, d2b9p91, d2b9pf1, d2b9pi1, d2b9pi2, d2b9pk1, d2b9pk2, d2b9pn1, d2b9po1, d2b9pr1, d2b9pt1, d2b9pu1, d2b9pv1, d2b9pw1, d2b9px1, d2b9py1, d2b9pz1
      automatically matched to d1rl6a2
      protein/RNA complex
  7. Domain(s) for 2hgj:
    1. 1432961Domain d2hgjh1: 2hgj H:12-82 [145310]
      Other proteins in same PDB: d2hgj11, d2hgj21, d2hgj31, d2hgj41, d2hgj51, d2hgj61, d2hgj71, d2hgj81, d2hgjc1, d2hgjd1, d2hgjd2, d2hgje1, d2hgjf1, d2hgjg1, d2hgjk1, d2hgjk2, d2hgjl1, d2hgjl2, d2hgjm1, d2hgjn1, d2hgjo1, d2hgjp1, d2hgjq1, d2hgjr1, d2hgjt1, d2hgju1, d2hgjv1, d2hgjw1, d2hgjx1, d2hgjy1
      automatically matched to 2J01 H:12-82
    2. 1432962Domain d2hgjh2: 2hgj H:83-171 [145311]
      Other proteins in same PDB: d2hgj11, d2hgj21, d2hgj31, d2hgj41, d2hgj51, d2hgj61, d2hgj71, d2hgj81, d2hgjc1, d2hgjd1, d2hgjd2, d2hgje1, d2hgjf1, d2hgjg1, d2hgjk1, d2hgjk2, d2hgjl1, d2hgjl2, d2hgjm1, d2hgjn1, d2hgjo1, d2hgjp1, d2hgjq1, d2hgjr1, d2hgjt1, d2hgju1, d2hgjv1, d2hgjw1, d2hgjx1, d2hgjy1
      automatically matched to 2J01 H:83-171
  8. Domain(s) for 2hgq:
    1. 1432959Domain d2hgqh1: 2hgq H:12-82 [145342]
      Other proteins in same PDB: d2hgq11, d2hgq21, d2hgq31, d2hgq41, d2hgq51, d2hgq61, d2hgq71, d2hgq81, d2hgqc1, d2hgqd1, d2hgqd2, d2hgqe1, d2hgqf1, d2hgqg1, d2hgqk1, d2hgqk2, d2hgql1, d2hgql2, d2hgqm1, d2hgqn1, d2hgqo1, d2hgqp1, d2hgqq1, d2hgqr1, d2hgqt1, d2hgqu1, d2hgqv1, d2hgqw1, d2hgqx1, d2hgqy1
      automatically matched to 2J01 H:12-82
    2. 1432960Domain d2hgqh2: 2hgq H:83-171 [145343]
      Other proteins in same PDB: d2hgq11, d2hgq21, d2hgq31, d2hgq41, d2hgq51, d2hgq61, d2hgq71, d2hgq81, d2hgqc1, d2hgqd1, d2hgqd2, d2hgqe1, d2hgqf1, d2hgqg1, d2hgqk1, d2hgqk2, d2hgql1, d2hgql2, d2hgqm1, d2hgqn1, d2hgqo1, d2hgqp1, d2hgqq1, d2hgqr1, d2hgqt1, d2hgqu1, d2hgqv1, d2hgqw1, d2hgqx1, d2hgqy1
      automatically matched to 2J01 H:83-171
  9. Domain(s) for 2hgu:
    1. 1432965Domain d2hguh1: 2hgu H:12-82 [145374]
      Other proteins in same PDB: d2hgu11, d2hgu21, d2hgu31, d2hgu41, d2hgu51, d2hgu61, d2hgu71, d2hgu81, d2hguc1, d2hgud1, d2hgud2, d2hgue1, d2hguf1, d2hgug1, d2hguk1, d2hguk2, d2hgul1, d2hgul2, d2hgum1, d2hgun1, d2hguo1, d2hgup1, d2hguq1, d2hgur1, d2hgut1, d2hguu1, d2hguv1, d2hguw1, d2hgux1, d2hguy1
      automatically matched to 2J01 H:12-82
      protein/RNA complex
    2. 1432966Domain d2hguh2: 2hgu H:83-171 [145375]
      Other proteins in same PDB: d2hgu11, d2hgu21, d2hgu31, d2hgu41, d2hgu51, d2hgu61, d2hgu71, d2hgu81, d2hguc1, d2hgud1, d2hgud2, d2hgue1, d2hguf1, d2hgug1, d2hguk1, d2hguk2, d2hgul1, d2hgul2, d2hgum1, d2hgun1, d2hguo1, d2hgup1, d2hguq1, d2hgur1, d2hgut1, d2hguu1, d2hguv1, d2hguw1, d2hgux1, d2hguy1
      automatically matched to 2J01 H:83-171
      protein/RNA complex
  10. Domain(s) for 2j01:
    1. 1432949Domain d2j01h1: 2j01 H:12-82 [145569]
      Other proteins in same PDB: d2j0111, d2j0121, d2j0131, d2j0141, d2j0151, d2j0161, d2j0171, d2j0181, d2j01c1, d2j01d1, d2j01d2, d2j01e1, d2j01f1, d2j01g1, d2j01i1, d2j01i2, d2j01n1, d2j01o1, d2j01p1, d2j01q1, d2j01r1, d2j01s1, d2j01t1, d2j01u1, d2j01v1, d2j01w1, d2j01x1, d2j01y1, d2j01z1
      Representative structure
      protein/RNA complex
    2. 1432950Domain d2j01h2: 2j01 H:83-171 [145570]
      Other proteins in same PDB: d2j0111, d2j0121, d2j0131, d2j0141, d2j0151, d2j0161, d2j0171, d2j0181, d2j01c1, d2j01d1, d2j01d2, d2j01e1, d2j01f1, d2j01g1, d2j01i1, d2j01i2, d2j01n1, d2j01o1, d2j01p1, d2j01q1, d2j01r1, d2j01s1, d2j01t1, d2j01u1, d2j01v1, d2j01w1, d2j01x1, d2j01y1, d2j01z1
      Representative structure
      protein/RNA complex
  11. Domain(s) for 2j03:
    1. 1432947Domain d2j03h1: 2j03 H:12-82 [145596]
      Other proteins in same PDB: d2j0311, d2j0321, d2j0331, d2j0341, d2j0351, d2j0361, d2j0371, d2j0381, d2j03c1, d2j03d1, d2j03d2, d2j03e1, d2j03f1, d2j03g1, d2j03i1, d2j03i2, d2j03n1, d2j03o1, d2j03p1, d2j03q1, d2j03r1, d2j03s1, d2j03t1, d2j03u1, d2j03v1, d2j03w1, d2j03x1, d2j03y1, d2j03z1
      automatically matched to 2J01 H:12-82
      protein/RNA complex
    2. 1432948Domain d2j03h2: 2j03 H:83-171 [145597]
      Other proteins in same PDB: d2j0311, d2j0321, d2j0331, d2j0341, d2j0351, d2j0361, d2j0371, d2j0381, d2j03c1, d2j03d1, d2j03d2, d2j03e1, d2j03f1, d2j03g1, d2j03i1, d2j03i2, d2j03n1, d2j03o1, d2j03p1, d2j03q1, d2j03r1, d2j03s1, d2j03t1, d2j03u1, d2j03v1, d2j03w1, d2j03x1, d2j03y1, d2j03z1
      automatically matched to 2J01 H:83-171
      protein/RNA complex
  12. Domain(s) for 2v47:
    1. 1432955Domain d2v47h1: 2v47 H:12-82 [152512]
      Other proteins in same PDB: d2v4741, d2v4751, d2v4761, d2v4771, d2v47c1, d2v47e1, d2v47f1, d2v47n1, d2v47p1, d2v47t1, d2v47u1, d2v47v1, d2v47y1, d2v47z1
      automatically matched to 2J01 H:12-82
    2. 1432956Domain d2v47h2: 2v47 H:83-171 [152513]
      Other proteins in same PDB: d2v4741, d2v4751, d2v4761, d2v4771, d2v47c1, d2v47e1, d2v47f1, d2v47n1, d2v47p1, d2v47t1, d2v47u1, d2v47v1, d2v47y1, d2v47z1
      automatically matched to 2J01 H:83-171
  13. Domain(s) for 2v49:
    1. 1432957Domain d2v49h1: 2v49 H:12-82 [152547]
      Other proteins in same PDB: d2v4941, d2v4951, d2v4961, d2v4971, d2v49e1, d2v49f1, d2v49n1, d2v49p1, d2v49t1, d2v49u1, d2v49v1, d2v49y1, d2v49z1
      automatically matched to 2J01 H:12-82
    2. 1432958Domain d2v49h2: 2v49 H:83-171 [152548]
      Other proteins in same PDB: d2v4941, d2v4951, d2v4961, d2v4971, d2v49e1, d2v49f1, d2v49n1, d2v49p1, d2v49t1, d2v49u1, d2v49v1, d2v49y1, d2v49z1
      automatically matched to 2J01 H:83-171
  14. Domain(s) for 3d5b:
    1. 1432951Domain d3d5bh1: 3d5b H:12-82 [157358]
      Other proteins in same PDB: d3d5b61, d3d5b71, d3d5be1, d3d5bn1, d3d5bo1, d3d5bp1, d3d5bu1, d3d5bv1, d3d5by1, d3d5bz1
      automatically matched to 2J01 H:12-82
      complexed with mg
    2. 1432952Domain d3d5bh2: 3d5b H:83-170 [157359]
      Other proteins in same PDB: d3d5b61, d3d5b71, d3d5be1, d3d5bn1, d3d5bo1, d3d5bp1, d3d5bu1, d3d5bv1, d3d5by1, d3d5bz1
      automatically matched to 2J01 H:83-171
      complexed with mg
  15. Domain(s) for 3d5d:
    1. 1432953Domain d3d5dh1: 3d5d H:12-82 [157388]
      Other proteins in same PDB: d3d5d61, d3d5d71, d3d5de1, d3d5dn1, d3d5do1, d3d5dp1, d3d5du1, d3d5dv1, d3d5dy1, d3d5dz1
      automatically matched to 2J01 H:12-82
      complexed with mg
    2. 1432954Domain d3d5dh2: 3d5d H:83-170 [157389]
      Other proteins in same PDB: d3d5d61, d3d5d71, d3d5de1, d3d5dn1, d3d5do1, d3d5dp1, d3d5du1, d3d5dv1, d3d5dy1, d3d5dz1
      automatically matched to 2J01 H:83-171
      complexed with mg

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