Lineage for Protein: Exosome complex exonuclease 2, ECX2

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2170735Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2208270Fold d.101: Ribonuclease PH domain 2-like [55665] (1 superfamily)
    beta(2)-alpha-beta(2)-alpha; 3 layers: alpha/beta/alpha; antiparallel sheet: order 2134
  4. 2208271Superfamily d.101.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55666] (2 families) (S)
  5. 2208272Family d.101.1.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55667] (11 proteins)
  6. 2208334Protein Exosome complex exonuclease 2, ECX2 [160597] (2 species)

Species:

  1. 2208335Archaeoglobus fulgidus [TaxId:2234] [160598] (4 PDB entries)
    Uniprot O29756 179-257
    1. Domains for 2ba0:
      1. 2208339Domain d2ba0g2: 2ba0 G:179-257 [146112]
        Other proteins in same PDB: d2ba0a1, d2ba0a2, d2ba0a3, d2ba0b1, d2ba0b2, d2ba0b3, d2ba0c1, d2ba0c2, d2ba0c3, d2ba0d1, d2ba0d2, d2ba0e1, d2ba0e2, d2ba0f1, d2ba0f2, d2ba0g1, d2ba0h1, d2ba0i1
      2. 2208340Domain d2ba0h2: 2ba0 H:179-258 [146114]
        Other proteins in same PDB: d2ba0a1, d2ba0a2, d2ba0a3, d2ba0b1, d2ba0b2, d2ba0b3, d2ba0c1, d2ba0c2, d2ba0c3, d2ba0d1, d2ba0d2, d2ba0e1, d2ba0e2, d2ba0f1, d2ba0f2, d2ba0g1, d2ba0h1, d2ba0i1
        automated match to d2ba0g2
      3. 2208341Domain d2ba0i2: 2ba0 I:179-257 [146116]
        Other proteins in same PDB: d2ba0a1, d2ba0a2, d2ba0a3, d2ba0b1, d2ba0b2, d2ba0b3, d2ba0c1, d2ba0c2, d2ba0c3, d2ba0d1, d2ba0d2, d2ba0e1, d2ba0e2, d2ba0f1, d2ba0f2, d2ba0g1, d2ba0h1, d2ba0i1
        automated match to d2ba0g2
    2. Domains for 2ba1:
      1. 2208342Domain d2ba1g2: 2ba1 G:179-258 [146124]
        Other proteins in same PDB: d2ba1d1, d2ba1d2, d2ba1e1, d2ba1e2, d2ba1f1, d2ba1f2, d2ba1g1, d2ba1h1, d2ba1i1
        automated match to d2ba0g2
        complexed with zn
      2. 2208343Domain d2ba1h2: 2ba1 H:179-258 [146126]
        Other proteins in same PDB: d2ba1d1, d2ba1d2, d2ba1e1, d2ba1e2, d2ba1f1, d2ba1f2, d2ba1g1, d2ba1h1, d2ba1i1
        automated match to d2ba0g2
        complexed with zn
      3. 2208344Domain d2ba1i2: 2ba1 I:179-258 [146128]
        Other proteins in same PDB: d2ba1d1, d2ba1d2, d2ba1e1, d2ba1e2, d2ba1f1, d2ba1f2, d2ba1g1, d2ba1h1, d2ba1i1
        automated match to d2ba0g2
        complexed with zn
    3. Domains for 3m7n:
      1. 2208336Domain d3m7ng2: 3m7n G:179-257 [213140]
        Other proteins in same PDB: d3m7nd1, d3m7nd2, d3m7ne1, d3m7ne2, d3m7nf1, d3m7nf2, d3m7ng1, d3m7nh1, d3m7ni1
        automated match to d2ba0g2
        protein/RNA complex; complexed with zn
      2. 2208337Domain d3m7nh2: 3m7n H:179-259 [213142]
        Other proteins in same PDB: d3m7nd1, d3m7nd2, d3m7ne1, d3m7ne2, d3m7nf1, d3m7nf2, d3m7ng1, d3m7nh1, d3m7ni1
        automated match to d2ba0g2
        protein/RNA complex; complexed with zn
      3. 2208338Domain d3m7ni2: 3m7n I:179-259 [213144]
        Other proteins in same PDB: d3m7nd1, d3m7nd2, d3m7ne1, d3m7ne2, d3m7nf1, d3m7nf2, d3m7ng1, d3m7nh1, d3m7ni1
        automated match to d2ba0g2
        protein/RNA complex; complexed with zn
    4. Domains for 3m85:
      1. 2208345Domain d3m85g2: 3m85 G:179-258 [247623]
        Other proteins in same PDB: d3m85d1, d3m85d2, d3m85e1, d3m85e2, d3m85f1, d3m85f2, d3m85g1, d3m85h1, d3m85i1
        automated match to d3m7nh2
        protein/RNA complex; complexed with zn
      2. 2208346Domain d3m85h2: 3m85 H:179-258 [247625]
        Other proteins in same PDB: d3m85d1, d3m85d2, d3m85e1, d3m85e2, d3m85f1, d3m85f2, d3m85g1, d3m85h1, d3m85i1
        automated match to d3m7nh2
        protein/RNA complex; complexed with zn
      3. 2208347Domain d3m85i2: 3m85 I:179-259 [247627]
        Other proteins in same PDB: d3m85d1, d3m85d2, d3m85e1, d3m85e2, d3m85f1, d3m85f2, d3m85g1, d3m85h1, d3m85i1
        automated match to d3m7nh2
        protein/RNA complex; complexed with zn
  2. 2208348Sulfolobus solfataricus [TaxId:2287] [160599] (6 PDB entries)
    Uniprot Q9UXC0 192-275
    1. Domains for 2c39:
      1. 2208354Domain d2c39a2: 2c39 A:192-275 [146325]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      2. 2208355Domain d2c39c2: 2c39 C:192-275 [146329]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      3. 2208356Domain d2c39e2: 2c39 E:192-275 [146333]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      4. 2208357Domain d2c39g2: 2c39 G:192-275 [146337]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      5. 2208358Domain d2c39i2: 2c39 I:192-275 [146339]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      6. 2208359Domain d2c39k2: 2c39 K:192-275 [146343]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      7. 2208360Domain d2c39m2: 2c39 M:192-275 [146347]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      8. 2208361Domain d2c39o2: 2c39 O:192-275 [146351]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      9. 2208362Domain d2c39q2: 2c39 Q:192-275 [146355]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      10. 2208363Domain d2c39s2: 2c39 S:192-274 [146359]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      11. 2208364Domain d2c39u2: 2c39 U:192-274 [146363]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
      12. 2208365Domain d2c39w2: 2c39 W:192-275 [146367]
        Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39i1, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:192-275
        protein/RNA complex; complexed with adp
    2. Domain for 2je6:
    3. Domain for 2jea:
    4. Domain for 2jeb:
    5. Domain for 4ba1:
    6. Domain for 4ba2:

More info for Protein Exosome complex exonuclease 2, ECX2 from d.101.1.1: Ribonuclease PH domain 2-like

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