SCOPe 2.06: Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]

Lineage for Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]

Root: SCOPe 2.06
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
Fold d.47: Ribosomal L11/L12e N-terminal domain [54746] (1 superfamily)
beta-alpha(2)-beta(2); 2 layers, alpha/beta; antiparallel beta-sheet: order 123
Superfamily d.47.1: Ribosomal L11/L12e N-terminal domain [54747] (1 family)
Family d.47.1.1: Ribosomal L11/L12e N-terminal domain [54748] (2 proteins)
Pfam PF03946
Protein Ribosomal protein L11, N-terminal domain [54749] (4 species)
Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [160200] (17 PDB entries)
Uniprot P36238 1-70! Uniprot P36238 2-68! Uniprot P36238 2-70

PDB entries in Species: Thermus thermophilus [TaxId: 274]:

Domain(s) for 1yl3:

Domain d1yl3l2: 1yl3 L:8-70 [123587]
Other proteins in same PDB: d1yl301, d1yl311, d1yl321, d1yl331, d1yl351, d1yl371, d1yl381, d1yl391, d1yl3c1, d1yl3d1, d1yl3d2, d1yl3f1, d1yl3h1, d1yl3h2, d1yl3i1, d1yl3i2, d1yl3j1, d1yl3j2, d1yl3k1, d1yl3k2, d1yl3l1, d1yl3m1, d1yl3n1, d1yl3r1, d1yl3s1, d1yl3t1, d1yl3u1, d1yl3v1, d1yl3w1, d1yl3x1

Domain(s) for 2b66:

Domain d2b66k2: 2b66 K:8-70 [127962]
Other proteins in same PDB: d2b6601, d2b6621, d2b6631, d2b6651, d2b6671, d2b6681, d2b6691, d2b66f1, d2b66h1, d2b66h2, d2b66i1, d2b66i2, d2b66k1, d2b66n1, d2b66o1, d2b66r1, d2b66t1, d2b66u1, d2b66v1, d2b66w1, d2b66x1, d2b66y1, d2b66z1

Domain(s) for 2b9n:

Domain d2b9nk2: 2b9n K:8-70 [128154]
Other proteins in same PDB: d2b9n01, d2b9n21, d2b9n31, d2b9n51, d2b9n71, d2b9n81, d2b9n91, d2b9nf1, d2b9nh1, d2b9nh2, d2b9ni1, d2b9ni2, d2b9nk1, d2b9nn1, d2b9no1, d2b9nr1, d2b9nt1, d2b9nu1, d2b9nv1, d2b9nw1, d2b9nx1, d2b9ny1, d2b9nz1

Domain(s) for 2b9p:

Domain d2b9pk2: 2b9p K:8-70 [128191]
Other proteins in same PDB: d2b9p01, d2b9p21, d2b9p31, d2b9p51, d2b9p71, d2b9p81, d2b9p91, d2b9pf1, d2b9ph1, d2b9ph2, d2b9pi1, d2b9pi2, d2b9pk1, d2b9pn1, d2b9po1, d2b9pr1, d2b9pt1, d2b9pu1, d2b9pv1, d2b9pw1, d2b9px1, d2b9py1, d2b9pz1
protein/RNA complex
protein/RNA complex

Domain(s) for 2e34:
- Domain d2e34a2: 2e34 A:2-68 [146671]
  Other proteins in same PDB: d2e34a1
  automatically matched to 2HGJ L:2-68
Domain(s) for 2e35:
- Domain d2e35a2: 2e35 A:2-68 [146673]
  Other proteins in same PDB: d2e35a1
  automatically matched to 2HGJ L:2-68
Domain(s) for 2e36:
- Domain d2e36a2: 2e36 A:2-68 [146675]
  Other proteins in same PDB: d2e36a1
  automatically matched to 2HGJ L:2-68
Domain(s) for 2h8w:
- Domain d2h8wa2: 2h8w A:2-68 [147244]
  Other proteins in same PDB: d2h8wa1
  automatically matched to 2HGJ L:2-68

Domain(s) for 2hgj:

Domain d2hgjl2: 2hgj L:2-68 [145315]
Other proteins in same PDB: d2hgj11, d2hgj21, d2hgj31, d2hgj41, d2hgj51, d2hgj61, d2hgj71, d2hgj81, d2hgjc1, d2hgjd1, d2hgjd2, d2hgje1, d2hgjf1, d2hgjg1, d2hgjh1, d2hgjh2, d2hgjk1, d2hgjk2, d2hgjl1, d2hgjm1, d2hgjn1, d2hgjo1, d2hgjp1, d2hgjq1, d2hgjr1, d2hgjt1, d2hgju1, d2hgjv1, d2hgjw1, d2hgjx1, d2hgjy1
Representative structure

Domain(s) for 2hgq:

Domain d2hgql2: 2hgq L:2-68 [145347]
Other proteins in same PDB: d2hgq11, d2hgq21, d2hgq31, d2hgq41, d2hgq51, d2hgq61, d2hgq71, d2hgq81, d2hgqc1, d2hgqd1, d2hgqd2, d2hgqe1, d2hgqf1, d2hgqg1, d2hgqh1, d2hgqh2, d2hgqk1, d2hgqk2, d2hgql1, d2hgqm1, d2hgqn1, d2hgqo1, d2hgqp1, d2hgqq1, d2hgqr1, d2hgqt1, d2hgqu1, d2hgqv1, d2hgqw1, d2hgqx1, d2hgqy1

Domain(s) for 2hgu:

Domain d2hgul2: 2hgu L:2-68 [145379]
Other proteins in same PDB: d2hgu11, d2hgu21, d2hgu31, d2hgu41, d2hgu51, d2hgu61, d2hgu71, d2hgu81, d2hguc1, d2hgud1, d2hgud2, d2hgue1, d2hguf1, d2hgug1, d2hguh1, d2hguh2, d2hguk1, d2hguk2, d2hgul1, d2hgum1, d2hgun1, d2hguo1, d2hgup1, d2hguq1, d2hgur1, d2hgut1, d2hguu1, d2hguv1, d2hguw1, d2hgux1, d2hguy1
protein/RNA complex
protein/RNA complex

Domain(s) for 2nxn:
- Domain d2nxnb2: 2nxn B:2-68 [145700]
  Other proteins in same PDB: d2nxna1, d2nxnb1
  automatically matched to 2HGJ L:2-68

Domain(s) for 3cjq:

Domain d3cjqb2: 3cjq B:2-70 [156704]
Other proteins in same PDB: d3cjqa1, d3cjqb1, d3cjqd1, d3cjqe1, d3cjqg1, d3cjqh1
automatically matched to 3CJR B:1-70
protein/RNA complex; complexed with 2mm, iod, sah

Domain d3cjqe2: 3cjq E:2-70 [156707]
Other proteins in same PDB: d3cjqa1, d3cjqb1, d3cjqd1, d3cjqe1, d3cjqg1, d3cjqh1
automatically matched to 3CJR B:1-70
protein/RNA complex; complexed with 2mm, iod, sah

Domain d3cjqh2: 3cjq H:2-70 [156710]
Other proteins in same PDB: d3cjqa1, d3cjqb1, d3cjqd1, d3cjqe1, d3cjqg1, d3cjqh1
automatically matched to 3CJR B:1-70
protein/RNA complex; complexed with 2mm, iod, sah

Domain(s) for 3cjr:
- Domain d3cjrb2: 3cjr B:1-70 [156713]
  Other proteins in same PDB: d3cjra1, d3cjrb1
  protein/RNA complex; complexed with sfg
Domain(s) for 3cjs:
1. Domain d3cjsb1: 3cjs B:1-70 [156714]
  protein/RNA complex; complexed with edo
2. Domain d3cjsc1: 3cjs C:3-70 [156715]
  automatically matched to 3CJS B:1-70
  protein/RNA complex; complexed with edo
Domain(s) for 3cjt:
1. Domain d3cjtb2: 3cjt B:2-68 [156717]
  Other proteins in same PDB: d3cjtb1, d3cjtf1, d3cjtj1, d3cjtn1
  automatically matched to 2HGJ L:2-68
  protein/RNA complex; complexed with 2mm, cl, edo, no3, sah, sam
2. Domain d3cjtf2: 3cjt F:2-68 [156719]
  Other proteins in same PDB: d3cjtb1, d3cjtf1, d3cjtj1, d3cjtn1
  automatically matched to 2HGJ L:2-68
  protein/RNA complex; complexed with 2mm, cl, edo, no3, sah, sam
3. Domain d3cjtj2: 3cjt J:2-68 [156721]
  Other proteins in same PDB: d3cjtb1, d3cjtf1, d3cjtj1, d3cjtn1
  automatically matched to 2HGJ L:2-68
  protein/RNA complex; complexed with 2mm, cl, edo, no3, sah, sam
4. Domain d3cjtn2: 3cjt N:2-68 [156723]
  Other proteins in same PDB: d3cjtb1, d3cjtf1, d3cjtj1, d3cjtn1
  automatically matched to 2HGJ L:2-68
  protein/RNA complex; complexed with 2mm, cl, edo, no3, sah, sam
Domain(s) for 3egv:
- Domain d3egvb1: 3egv B:2-70 [158149]
  Other proteins in same PDB: d3egva1
  protein/RNA complex; complexed with 4mm, cl, gol, iod, sah

More info for Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from d.47.1.1 Ribosomal protein L11, N-terminal domain

Timeline for Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from d.47.1.1 Ribosomal protein L11, N-terminal domain:

Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from d.47.1.1 Ribosomal protein L11, N-terminal domain first appeared in SCOP 1.75
Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from d.47.1.1 Ribosomal protein L11, N-terminal domain appears in SCOPe 2.05
Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from d.47.1.1 Ribosomal protein L11, N-terminal domain appears in SCOPe 2.07
Species Thermus thermophilus [TaxId:274] from d.47.1.1 Ribosomal protein L11, N-terminal domain appears in the current release, SCOPe 2.08