Lineage for Protein: Exosome complex exonuclease 2,ECX2

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2152203Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2157367Fold d.14: Ribosomal protein S5 domain 2-like [54210] (1 superfamily)
    core: beta(3)-alpha-beta-alpha; 2 layers: alpha/beta; left-handed crossover
  4. 2157368Superfamily d.14.1: Ribosomal protein S5 domain 2-like [54211] (13 families) (S)
  5. 2157612Family d.14.1.4: Ribonuclease PH domain 1-like [54229] (11 protein domains)
  6. 2157674Protein Exosome complex exonuclease 2,ECX2 [159920] (2 species)

Species:

  1. 2157675Archaeoglobus fulgidus [TaxId:2234] [159921] (4 PDB entries)
    Uniprot O29756 3-178
    1. Domains for 2ba0:
      1. 2157679Domain d2ba0g1: 2ba0 G:3-178 [146111]
        Other proteins in same PDB: d2ba0a1, d2ba0a2, d2ba0a3, d2ba0b1, d2ba0b2, d2ba0b3, d2ba0c1, d2ba0c2, d2ba0c3, d2ba0d1, d2ba0d2, d2ba0e1, d2ba0e2, d2ba0f1, d2ba0f2, d2ba0g2, d2ba0h2, d2ba0i2
      2. 2157680Domain d2ba0h1: 2ba0 H:3-178 [146113]
        Other proteins in same PDB: d2ba0a1, d2ba0a2, d2ba0a3, d2ba0b1, d2ba0b2, d2ba0b3, d2ba0c1, d2ba0c2, d2ba0c3, d2ba0d1, d2ba0d2, d2ba0e1, d2ba0e2, d2ba0f1, d2ba0f2, d2ba0g2, d2ba0h2, d2ba0i2
        automated match to d2ba0g1
      3. 2157681Domain d2ba0i1: 2ba0 I:3-178 [146115]
        Other proteins in same PDB: d2ba0a1, d2ba0a2, d2ba0a3, d2ba0b1, d2ba0b2, d2ba0b3, d2ba0c1, d2ba0c2, d2ba0c3, d2ba0d1, d2ba0d2, d2ba0e1, d2ba0e2, d2ba0f1, d2ba0f2, d2ba0g2, d2ba0h2, d2ba0i2
        automated match to d2ba0g1
    2. Domains for 2ba1:
      1. 2157682Domain d2ba1g1: 2ba1 G:1-178 [146123]
        Other proteins in same PDB: d2ba1d1, d2ba1d2, d2ba1e1, d2ba1e2, d2ba1f1, d2ba1f2, d2ba1g2, d2ba1h2, d2ba1i2
        automated match to d2ba0g1
        complexed with zn
      2. 2157683Domain d2ba1h1: 2ba1 H:1-178 [146125]
        Other proteins in same PDB: d2ba1d1, d2ba1d2, d2ba1e1, d2ba1e2, d2ba1f1, d2ba1f2, d2ba1g2, d2ba1h2, d2ba1i2
        automated match to d2ba0g1
        complexed with zn
      3. 2157684Domain d2ba1i1: 2ba1 I:1-178 [146127]
        Other proteins in same PDB: d2ba1d1, d2ba1d2, d2ba1e1, d2ba1e2, d2ba1f1, d2ba1f2, d2ba1g2, d2ba1h2, d2ba1i2
        automated match to d2ba0g1
        complexed with zn
    3. Domains for 3m7n:
      1. 2157676Domain d3m7ng1: 3m7n G:4-178 [213139]
        Other proteins in same PDB: d3m7nd1, d3m7nd2, d3m7ne1, d3m7ne2, d3m7nf1, d3m7nf2, d3m7ng2, d3m7nh2, d3m7ni2
        automated match to d2ba0g1
        protein/RNA complex; complexed with zn
      2. 2157677Domain d3m7nh1: 3m7n H:2-178 [213141]
        Other proteins in same PDB: d3m7nd1, d3m7nd2, d3m7ne1, d3m7ne2, d3m7nf1, d3m7nf2, d3m7ng2, d3m7nh2, d3m7ni2
        automated match to d2ba0g1
        protein/RNA complex; complexed with zn
      3. 2157678Domain d3m7ni1: 3m7n I:2-178 [213143]
        Other proteins in same PDB: d3m7nd1, d3m7nd2, d3m7ne1, d3m7ne2, d3m7nf1, d3m7nf2, d3m7ng2, d3m7nh2, d3m7ni2
        automated match to d2ba0g1
        protein/RNA complex; complexed with zn
    4. Domains for 3m85:
      1. 2157685Domain d3m85g1: 3m85 G:1-178 [247622]
        Other proteins in same PDB: d3m85d1, d3m85d2, d3m85e1, d3m85e2, d3m85f1, d3m85f2, d3m85g2, d3m85h2, d3m85i2
        automated match to d3m7nh1
        protein/RNA complex; complexed with zn
      2. 2157686Domain d3m85h1: 3m85 H:1-178 [247624]
        Other proteins in same PDB: d3m85d1, d3m85d2, d3m85e1, d3m85e2, d3m85f1, d3m85f2, d3m85g2, d3m85h2, d3m85i2
        automated match to d3m7nh1
        protein/RNA complex; complexed with zn
      3. 2157687Domain d3m85i1: 3m85 I:1-178 [247626]
        Other proteins in same PDB: d3m85d1, d3m85d2, d3m85e1, d3m85e2, d3m85f1, d3m85f2, d3m85g2, d3m85h2, d3m85i2
        automated match to d3m7nh1
        protein/RNA complex; complexed with zn
  2. 2157688Sulfolobus solfataricus [TaxId:2287] [159922] (6 PDB entries)
    Uniprot Q9UXC0 1-191
    1. Domains for 2c39:
      1. 2157694Domain d2c39a1: 2c39 A:1-191 [146324]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      2. 2157695Domain d2c39c1: 2c39 C:1-191 [146328]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      3. 2157696Domain d2c39e1: 2c39 E:1-191 [146332]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      4. 2157697Domain d2c39g1: 2c39 G:1-191 [146336]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      5. 2157698Domain d2c39i1: 2c39 I:1-191 [146338]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      6. 2157699Domain d2c39k1: 2c39 K:1-191 [146342]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      7. 2157700Domain d2c39m1: 2c39 M:1-191 [146346]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      8. 2157701Domain d2c39o1: 2c39 O:1-191 [146350]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      9. 2157702Domain d2c39q1: 2c39 Q:1-191 [146354]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      10. 2157703Domain d2c39s1: 2c39 S:1-191 [146358]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      11. 2157704Domain d2c39u1: 2c39 U:1-191 [146362]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
      12. 2157705Domain d2c39w1: 2c39 W:1-191 [146366]
        Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
        automatically matched to 2JE6 A:1-191
        protein/RNA complex; complexed with adp
    2. Domain for 2je6:
    3. Domain for 2jea:
    4. Domain for 2jeb:
    5. Domain for 4ba1:
    6. Domain for 4ba2:

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