Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds) |
Fold d.41: alpha/beta-Hammerhead [54664] (5 superfamilies) core: beta-BETA-alpha-beta-BETA-beta-alpha; contains a beta-hammerhead motif similar to that in barrel-sandwich hybrids |
Superfamily d.41.4: Ribosomal protein L16p/L10e [54686] (2 families) |
Family d.41.4.2: Ribosomal protein L16p [117888] (1 protein) Pfam PF00252 |
Protein Ribosomal protein L16p [117889] (4 species) |
Species Escherichia coli [TaxId:562] [143200] (29 PDB entries) Uniprot P0ADY7 1-136 |
Domain d2qbkm1: 2qbk M:1-136 [150635] Other proteins in same PDB: d2qbk01, d2qbk11, d2qbk31, d2qbk41, d2qbk61, d2qbkc1, d2qbkc2, d2qbkd1, d2qbke1, d2qbkf1, d2qbkg1, d2qbkg2, d2qbkh1, d2qbkh2, d2qbki1, d2qbki2, d2qbkj1, d2qbkk1, d2qbkl1, d2qbkn1, d2qbko1, d2qbkp1, d2qbkq1, d2qbkr1, d2qbks1, d2qbkt1, d2qbku1, d2qbkv1, d2qbkw1, d2qbkx1, d2qbky1, d2qbkz1 protein/RNA complex; complexed with lll, mg, zn protein/RNA complex; complexed with lll, mg, zn |
PDB Entry: 2qbk (more details), 4 Å
SCOPe Domain Sequences for d2qbkm1:
Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)
>d2qbkm1 d.41.4.2 (M:1-136) Ribosomal protein L16p {Escherichia coli [TaxId: 562]} mlqpkrtkfrkmhkgrnrglaqgtdvsfgsfglkavgrgrltarqieaarramtravkrq gkiwirvfpdkpitekplavrmgkgkgnveywvaliqpgkvlyemdgvpeelareafkla aaklpikttfvtktvm
Timeline for d2qbkm1:
View in 3D Domains from other chains: (mouse over for more information) d2qbk01, d2qbk11, d2qbk31, d2qbk41, d2qbk61, d2qbkc1, d2qbkc2, d2qbkd1, d2qbke1, d2qbkf1, d2qbkg1, d2qbkg2, d2qbkh1, d2qbkh2, d2qbki1, d2qbki2, d2qbkj1, d2qbkk1, d2qbkl1, d2qbkn1, d2qbko1, d2qbkp1, d2qbkq1, d2qbkr1, d2qbks1, d2qbkt1, d2qbku1, d2qbkv1, d2qbkw1, d2qbkx1, d2qbky1, d2qbkz1 |