Lineage for d2c39x2 (2c39 X:156-248)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2170735Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2208270Fold d.101: Ribonuclease PH domain 2-like [55665] (1 superfamily)
    beta(2)-alpha-beta(2)-alpha; 3 layers: alpha/beta/alpha; antiparallel sheet: order 2134
  4. 2208271Superfamily d.101.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55666] (2 families) (S)
  5. 2208272Family d.101.1.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55667] (11 protein domains)
  6. 2208273Protein Exosome complex exonuclease 1, ECX1 [160590] (2 species)
  7. 2208281Species Sulfolobus solfataricus [TaxId:2287] [160591] (9 PDB entries)
    Uniprot Q9UXC2 156-241! Uniprot Q9UXC2 156-248
  8. 2208333Domain d2c39x2: 2c39 X:156-248 [146369]
    Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39a2, d2c39b1, d2c39c1, d2c39c2, d2c39d1, d2c39e1, d2c39e2, d2c39f1, d2c39g1, d2c39g2, d2c39i1, d2c39i2, d2c39j1, d2c39k1, d2c39k2, d2c39l1, d2c39m1, d2c39m2, d2c39n1, d2c39o1, d2c39o2, d2c39p1, d2c39q1, d2c39q2, d2c39r1, d2c39s1, d2c39s2, d2c39t1, d2c39u1, d2c39u2, d2c39v1, d2c39w1, d2c39w2, d2c39x1
    automatically matched to 2BR2 B:156-248
    protein/RNA complex; complexed with adp

Details for d2c39x2

PDB Entry: 2c39 (more details), 3.3 Å

PDB Description: rnase ph core of the archaeal exosome in complex with adp
PDB Compounds: (X:) probable exosome complex exonuclease 1

SCOPe Domain Sequences for d2c39x2:

Sequence, based on SEQRES records: (download)

>d2c39x2 d.101.1.1 (X:156-248) Exosome complex exonuclease 1, ECX1 {Sulfolobus solfataricus [TaxId: 2287]}
pmrdliagvavgkadgviildlnetedmwgeadmpiammpslnqvtlfqlngsmtpdefr
qafdlavkginiiynlerealkskyvefkeegv

Sequence, based on observed residues (ATOM records): (download)

>d2c39x2 d.101.1.1 (X:156-248) Exosome complex exonuclease 1, ECX1 {Sulfolobus solfataricus [TaxId: 2287]}
pmrdliagvavgdgviildlnetedmwgeadmpiammpslnqvtlfqlngsmtpdefrqa
fdlavkginiiynlerealkskyvefkeegv

SCOPe Domain Coordinates for d2c39x2:

Click to download the PDB-style file with coordinates for d2c39x2.
(The format of our PDB-style files is described here.)

Timeline for d2c39x2:

View in 3D
Domains from same chain:
(mouse over for more information)
d2c39x1
View in 3D
Domains from other chains:
(mouse over for more information)
d2c39a1, d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39g2, d2c39i1, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39w2