Lineage for d2c39u1 (2c39 U:1-191)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2152203Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2157367Fold d.14: Ribosomal protein S5 domain 2-like [54210] (1 superfamily)
    core: beta(3)-alpha-beta-alpha; 2 layers: alpha/beta; left-handed crossover
  4. 2157368Superfamily d.14.1: Ribosomal protein S5 domain 2-like [54211] (13 families) (S)
  5. 2157612Family d.14.1.4: Ribonuclease PH domain 1-like [54229] (11 protein domains)
  6. 2157674Protein Exosome complex exonuclease 2,ECX2 [159920] (2 species)
  7. 2157688Species Sulfolobus solfataricus [TaxId:2287] [159922] (6 PDB entries)
    Uniprot Q9UXC0 1-191
  8. 2157704Domain d2c39u1: 2c39 U:1-191 [146362]
    Other proteins in same PDB: d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g2, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2
    automatically matched to 2JE6 A:1-191
    protein/RNA complex; complexed with adp

Details for d2c39u1

PDB Entry: 2c39 (more details), 3.3 Å

PDB Description: rnase ph core of the archaeal exosome in complex with adp
PDB Compounds: (U:) probable exosome complex exonuclease 2

SCOPe Domain Sequences for d2c39u1:

Sequence, based on SEQRES records: (download)

>d2c39u1 d.14.1.4 (U:1-191) Exosome complex exonuclease 2,ECX2 {Sulfolobus solfataricus [TaxId: 2287]}
msstpsnqniipiikkesivslfekgirqdgrkltdyrplsitldyakkadgsalvklgt
tmvlagtkleidkpyedtpnqgnlivnvellplayetfepgppdenaielarvvdrslrd
skaldltklviepgksvwtvwldvyvldyggnvldactlasvaalyntkvykveqhsngi
svnknevvgkl

Sequence, based on observed residues (ATOM records): (download)

>d2c39u1 d.14.1.4 (U:1-191) Exosome complex exonuclease 2,ECX2 {Sulfolobus solfataricus [TaxId: 2287]}
msstpsnqniipiikkesivslfekgirqdgrkltdyrplsitldyakkadgsalvklgt
tmvlagtkleidkpyedtpnqgnlivnvellpdenaielarvvdrslrdskaldltklvi
epgksvwtvwldvyvldyggnvldactlasvaalyntkvykvvnknevvgkl

SCOPe Domain Coordinates for d2c39u1:

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Timeline for d2c39u1:

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d2c39u2
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d2c39a1, d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39g2, d2c39i1, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39q2, d2c39r1, d2c39r2, d2c39s1, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2