Lineage for d2c39r2 (2c39 R:156-248)

  1. Root: SCOPe 2.07
  2. 2494617Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (388 folds)
  3. 2532281Fold d.101: Ribonuclease PH domain 2-like [55665] (1 superfamily)
    beta(2)-alpha-beta(2)-alpha; 3 layers: alpha/beta/alpha; antiparallel sheet: order 2134
  4. 2532282Superfamily d.101.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55666] (2 families) (S)
  5. 2532283Family d.101.1.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55667] (11 proteins)
  6. 2532284Protein Exosome complex exonuclease 1, ECX1 [160590] (2 species)
  7. 2532292Species Sulfolobus solfataricus [TaxId:2287] [160591] (9 PDB entries)
    Uniprot Q9UXC2 156-241! Uniprot Q9UXC2 156-248
  8. 2532341Domain d2c39r2: 2c39 R:156-248 [146357]
    Other proteins in same PDB: d2c39a1, d2c39a2, d2c39b1, d2c39c1, d2c39c2, d2c39d1, d2c39e1, d2c39e2, d2c39f1, d2c39g1, d2c39g2, d2c39i1, d2c39i2, d2c39j1, d2c39k1, d2c39k2, d2c39l1, d2c39m1, d2c39m2, d2c39n1, d2c39o1, d2c39o2, d2c39p1, d2c39q1, d2c39q2, d2c39r1, d2c39s1, d2c39s2, d2c39t1, d2c39u1, d2c39u2, d2c39v1, d2c39w1, d2c39w2, d2c39x1
    automatically matched to 2BR2 B:156-248
    protein/RNA complex; complexed with adp

Details for d2c39r2

PDB Entry: 2c39 (more details), 3.3 Å

PDB Description: rnase ph core of the archaeal exosome in complex with adp
PDB Compounds: (R:) probable exosome complex exonuclease 1

SCOPe Domain Sequences for d2c39r2:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2c39r2 d.101.1.1 (R:156-248) Exosome complex exonuclease 1, ECX1 {Sulfolobus solfataricus [TaxId: 2287]}
pmrdliagvavgkadgviildlnetedmwgeadmpiammpslnqvtlfqlngsmtpdefr
qafdlavkginiiynlerealkskyvefkeegv

SCOPe Domain Coordinates for d2c39r2:

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Timeline for d2c39r2:

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d2c39r1
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d2c39a1, d2c39a2, d2c39b1, d2c39b2, d2c39c1, d2c39c2, d2c39d1, d2c39d2, d2c39e1, d2c39e2, d2c39f1, d2c39f2, d2c39g1, d2c39g2, d2c39i1, d2c39i2, d2c39j1, d2c39j2, d2c39k1, d2c39k2, d2c39l1, d2c39l2, d2c39m1, d2c39m2, d2c39n1, d2c39n2, d2c39o1, d2c39o2, d2c39p1, d2c39p2, d2c39q1, d2c39q2, d2c39s1, d2c39s2, d2c39t1, d2c39t2, d2c39u1, d2c39u2, d2c39v1, d2c39v2, d2c39w1, d2c39w2, d2c39x1, d2c39x2