Lineage for d2c38m2 (2c38 M:192-275)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2170735Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2208270Fold d.101: Ribonuclease PH domain 2-like [55665] (1 superfamily)
    beta(2)-alpha-beta(2)-alpha; 3 layers: alpha/beta/alpha; antiparallel sheet: order 2134
  4. 2208271Superfamily d.101.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55666] (2 families) (S)
  5. 2208423Family d.101.1.0: automated matches [227218] (1 protein)
    not a true family
  6. 2208424Protein automated matches [226956] (5 species)
    not a true protein
  7. 2208450Species Sulfolobus solfataricus [TaxId:2287] [232814] (4 PDB entries)
  8. 2208484Domain d2c38m2: 2c38 M:192-275 [146301]
    Other proteins in same PDB: d2c38a1, d2c38b1, d2c38b2, d2c38c1, d2c38d1, d2c38d2, d2c38e1, d2c38f1, d2c38f2, d2c38g1, d2c38h1, d2c38h2, d2c38i1, d2c38j1, d2c38j2, d2c38k1, d2c38l1, d2c38l2, d2c38m1, d2c38n1, d2c38n2, d2c38o1, d2c38p1, d2c38p2, d2c38q1, d2c38r1, d2c38r2, d2c38s1, d2c38t1, d2c38t2, d2c38u1, d2c38v1, d2c38v2, d2c38w1, d2c38x1, d2c38x2
    automated match to d2je6a2
    protein/RNA complex; complexed with amp, cl

Details for d2c38m2

PDB Entry: 2c38 (more details), 3.1 Å

PDB Description: rnase ph core of the archaeal exosome in complex with a5 rna
PDB Compounds: (M:) probable exosome complex exonuclease 2

SCOPe Domain Sequences for d2c38m2:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2c38m2 d.101.1.0 (M:192-275) automated matches {Sulfolobus solfataricus [TaxId: 2287]}
plnypvvtisvakvdkylvvdpdldeesimdakisfsytpdlkivgiqksgkgsmslqdi
dqaentarstavklleelkkhlgi

SCOPe Domain Coordinates for d2c38m2:

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Timeline for d2c38m2:

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d2c38m1
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d2c38a1, d2c38a2, d2c38b1, d2c38b2, d2c38c1, d2c38c2, d2c38d1, d2c38d2, d2c38e1, d2c38e2, d2c38f1, d2c38f2, d2c38g1, d2c38g2, d2c38h1, d2c38h2, d2c38i1, d2c38i2, d2c38j1, d2c38j2, d2c38k1, d2c38k2, d2c38l1, d2c38l2, d2c38n1, d2c38n2, d2c38o1, d2c38o2, d2c38p1, d2c38p2, d2c38q1, d2c38q2, d2c38r1, d2c38r2, d2c38s1, d2c38s2, d2c38t1, d2c38t2, d2c38u1, d2c38u2, d2c38v1, d2c38v2, d2c38w1, d2c38w2, d2c38x1, d2c38x2