Lineage for d2c38l1 (2c38 L:8-155)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2152203Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2157367Fold d.14: Ribosomal protein S5 domain 2-like [54210] (1 superfamily)
    core: beta(3)-alpha-beta-alpha; 2 layers: alpha/beta; left-handed crossover
  4. 2157368Superfamily d.14.1: Ribosomal protein S5 domain 2-like [54211] (13 families) (S)
  5. 2157612Family d.14.1.4: Ribonuclease PH domain 1-like [54229] (11 protein domains)
  6. 2157613Protein Exosome complex exonuclease 1, ECX1 [159923] (2 species)
  7. 2157621Species Sulfolobus solfataricus [TaxId:2287] [159924] (9 PDB entries)
    Uniprot Q9UXC2 8-155
  8. 2157656Domain d2c38l1: 2c38 L:8-155 [146298]
    Other proteins in same PDB: d2c38a1, d2c38a2, d2c38b2, d2c38c1, d2c38c2, d2c38d2, d2c38e1, d2c38e2, d2c38f2, d2c38g1, d2c38g2, d2c38h2, d2c38i1, d2c38i2, d2c38j2, d2c38k1, d2c38k2, d2c38l2, d2c38m1, d2c38m2, d2c38n2, d2c38o1, d2c38o2, d2c38p2, d2c38q1, d2c38q2, d2c38r2, d2c38s1, d2c38s2, d2c38t2, d2c38u1, d2c38u2, d2c38v2, d2c38w1, d2c38w2, d2c38x2
    automatically matched to 2BR2 B:8-155
    protein/RNA complex; complexed with amp, cl

Details for d2c38l1

PDB Entry: 2c38 (more details), 3.1 Å

PDB Description: rnase ph core of the archaeal exosome in complex with a5 rna
PDB Compounds: (L:) probable exosome complex exonuclease 1

SCOPe Domain Sequences for d2c38l1:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2c38l1 d.14.1.4 (L:8-155) Exosome complex exonuclease 1, ECX1 {Sulfolobus solfataricus [TaxId: 2287]}

SCOPe Domain Coordinates for d2c38l1:

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Timeline for d2c38l1:

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