Lineage for d2c38b2 (2c38 B:156-248)

  1. Root: SCOPe 2.06
  2. 2152203Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds)
  3. 2186677Fold d.101: Ribonuclease PH domain 2-like [55665] (1 superfamily)
    beta(2)-alpha-beta(2)-alpha; 3 layers: alpha/beta/alpha; antiparallel sheet: order 2134
  4. 2186678Superfamily d.101.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55666] (2 families) (S)
  5. 2186679Family d.101.1.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55667] (11 protein domains)
  6. 2186680Protein Exosome complex exonuclease 1, ECX1 [160590] (2 species)
  7. 2186688Species Sulfolobus solfataricus [TaxId:2287] [160591] (9 PDB entries)
    Uniprot Q9UXC2 156-241! Uniprot Q9UXC2 156-248
  8. 2186718Domain d2c38b2: 2c38 B:156-248 [146279]
    Other proteins in same PDB: d2c38a1, d2c38a2, d2c38b1, d2c38c1, d2c38c2, d2c38d1, d2c38e1, d2c38e2, d2c38f1, d2c38g1, d2c38g2, d2c38h1, d2c38i1, d2c38i2, d2c38j1, d2c38k1, d2c38k2, d2c38l1, d2c38m1, d2c38m2, d2c38n1, d2c38o1, d2c38o2, d2c38p1, d2c38q1, d2c38q2, d2c38r1, d2c38s1, d2c38s2, d2c38t1, d2c38u1, d2c38u2, d2c38v1, d2c38w1, d2c38w2, d2c38x1
    automatically matched to 2BR2 B:156-248
    protein/RNA complex; complexed with amp, cl

Details for d2c38b2

PDB Entry: 2c38 (more details), 3.1 Å

PDB Description: rnase ph core of the archaeal exosome in complex with a5 rna
PDB Compounds: (B:) probable exosome complex exonuclease 1

SCOPe Domain Sequences for d2c38b2:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2c38b2 d.101.1.1 (B:156-248) Exosome complex exonuclease 1, ECX1 {Sulfolobus solfataricus [TaxId: 2287]}
pmrdliagvavgkadgviildlnetedmwgeadmpiammpslnqvtlfqlngsmtpdefr
qafdlavkginiiynlerealkskyvefkeegv

SCOPe Domain Coordinates for d2c38b2:

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Timeline for d2c38b2:

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d2c38b1
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d2c38a1, d2c38a2, d2c38c1, d2c38c2, d2c38d1, d2c38d2, d2c38e1, d2c38e2, d2c38f1, d2c38f2, d2c38g1, d2c38g2, d2c38h1, d2c38h2, d2c38i1, d2c38i2, d2c38j1, d2c38j2, d2c38k1, d2c38k2, d2c38l1, d2c38l2, d2c38m1, d2c38m2, d2c38n1, d2c38n2, d2c38o1, d2c38o2, d2c38p1, d2c38p2, d2c38q1, d2c38q2, d2c38r1, d2c38r2, d2c38s1, d2c38s2, d2c38t1, d2c38t2, d2c38u1, d2c38u2, d2c38v1, d2c38v2, d2c38w1, d2c38w2, d2c38x1, d2c38x2