Lineage for d2c37v2 (2c37 V:156-248)

  1. Root: SCOPe 2.02
  2. 1190016Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (376 folds)
  3. 1214221Fold d.101: Ribonuclease PH domain 2-like [55665] (1 superfamily)
    beta(2)-alpha-beta(2)-alpha; 3 layers: alpha/beta/alpha; antiparallel sheet: order 2134
  4. 1214222Superfamily d.101.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55666] (1 family) (S)
  5. 1214223Family d.101.1.1: Ribonuclease PH domain 2-like [55667] (10 proteins)
  6. 1214224Protein Exosome complex exonuclease 1, ECX1 [160590] (2 species)
  7. 1214232Species Sulfolobus solfataricus [TaxId:2287] [160591] (7 PDB entries)
    Uniprot Q9UXC2 156-241! Uniprot Q9UXC2 156-248
  8. 1214258Domain d2c37v2: 2c37 V:156-248 [146271]
    Other proteins in same PDB: d2c37a1, d2c37a2, d2c37b1, d2c37c1, d2c37c2, d2c37d1, d2c37e1, d2c37e2, d2c37f1, d2c37g1, d2c37g2, d2c37h1, d2c37i1, d2c37i2, d2c37j1, d2c37k1, d2c37k2, d2c37l1, d2c37m1, d2c37m2, d2c37n1, d2c37o1, d2c37o2, d2c37p1, d2c37q1, d2c37q2, d2c37r1, d2c37s1, d2c37s2, d2c37t1, d2c37u1, d2c37u2, d2c37v1, d2c37w1, d2c37w2, d2c37x1
    automatically matched to 2BR2 B:156-248
    protein/RNA complex; complexed with cl, na, rp5, u5p

Details for d2c37v2

PDB Entry: 2c37 (more details), 2.8 Å

PDB Description: rnase ph core of the archaeal exosome in complex with u8 rna
PDB Compounds: (V:) probable exosome complex exonuclease 1

SCOPe Domain Sequences for d2c37v2:

Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)

>d2c37v2 d.101.1.1 (V:156-248) Exosome complex exonuclease 1, ECX1 {Sulfolobus solfataricus [TaxId: 2287]}
pmrdliagvavgkadgviildlnetedmwgeadmpiammpslnqvtlfqlngsmtpdefr
qafdlavkginiiynlerealkskyvefkeegv

SCOPe Domain Coordinates for d2c37v2:

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Timeline for d2c37v2:

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d2c37v1
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d2c37a1, d2c37a2, d2c37b1, d2c37b2, d2c37c1, d2c37c2, d2c37d1, d2c37d2, d2c37e1, d2c37e2, d2c37f1, d2c37f2, d2c37g1, d2c37g2, d2c37h1, d2c37h2, d2c37i1, d2c37i2, d2c37j1, d2c37j2, d2c37k1, d2c37k2, d2c37l1, d2c37l2, d2c37m1, d2c37m2, d2c37n1, d2c37n2, d2c37o1, d2c37o2, d2c37p1, d2c37p2, d2c37q1, d2c37q2, d2c37r1, d2c37r2, d2c37s1, d2c37s2, d2c37t1, d2c37t2, d2c37u1, d2c37u2, d2c37w1, d2c37w2, d2c37x1, d2c37x2