Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (380 folds) |
Fold d.41: alpha/beta-Hammerhead [54664] (5 superfamilies) core: beta-BETA-alpha-beta-BETA-beta-alpha; contains a beta-hammerhead motif similar to that in barrel-sandwich hybrids |
Superfamily d.41.4: Ribosomal protein L16p/L10e [54686] (2 families) |
Family d.41.4.2: Ribosomal protein L16p [117888] (1 protein) Pfam PF00252 |
Protein Ribosomal protein L16p [117889] (4 species) |
Species Thermus thermophilus [TaxId:274] [160197] (5 PDB entries) |
Domain d2hgup1: 2hgu P:6-141 [145383] Other proteins in same PDB: d2hgu11, d2hgu21, d2hgu31, d2hgu41, d2hgu51, d2hgu61, d2hgu71, d2hgu81, d2hguc1, d2hgud1, d2hgud2, d2hgue1, d2hguf1, d2hgug1, d2hguh1, d2hguh2, d2hguk1, d2hguk2, d2hgul1, d2hgul2, d2hgum1, d2hgun1, d2hguo1, d2hguq1, d2hgur1, d2hgut1, d2hguu1, d2hguv1, d2hguw1, d2hgux1, d2hguy1 automatically matched to d1wkia_ protein/RNA complex |
PDB Entry: 2hgu (more details), 4.51 Å
SCOPe Domain Sequences for d2hgup1:
Sequence; same for both SEQRES and ATOM records: (download)
>d2hgup1 d.41.4.2 (P:6-141) Ribosomal protein L16p {Thermus thermophilus [TaxId: 274]} rmkyrkqqrgrlkgatkggdyvafgdyglvalepawitaqqieaarvamvrhfrrggkif irifpdkpytkkplevrmgkgkgnvegyvavvkpgrvmfevagvteeqamealriaghkl piktkivrrdaydeaq
Timeline for d2hgup1:
View in 3D Domains from other chains: (mouse over for more information) d2hgu11, d2hgu21, d2hgu31, d2hgu41, d2hgu51, d2hgu61, d2hgu71, d2hgu81, d2hguc1, d2hgud1, d2hgud2, d2hgue1, d2hguf1, d2hgug1, d2hguh1, d2hguh2, d2hguk1, d2hguk2, d2hgul1, d2hgul2, d2hgum1, d2hgun1, d2hguo1, d2hguq1, d2hgur1, d2hgut1, d2hguu1, d2hguv1, d2hguw1, d2hgux1, d2hguy1 |