Class g: Small proteins [56992] (90 folds) |
Fold g.41: Rubredoxin-like [57769] (17 superfamilies) metal(zinc or iron)-bound fold; sequence contains two CX(n)C motifs, in most cases n = 2 |
Superfamily g.41.8: Zn-binding ribosomal proteins [57829] (8 families) |
Family g.41.8.6: Ribosomal protein L33p [144203] (1 protein) Pfam PF00471; corresponds structurally and functionally to the ribosomal L44e from eukaryota and archaea; metal ion-binding site is lost in most members |
Protein Ribosomal protein L33p [144204] (3 species) |
Deinococcus radiodurans [TaxId:1299] [161179] (6 PDB entries) Uniprot Q9RSS4 2-54 |
Domain d1xbp11: 1xbp 1:2-54 [145861] Other proteins in same PDB: d1xbp21, d1xbp31, d1xbp41, d1xbpa1, d1xbpa2, d1xbpb1, d1xbpc1, d1xbpd1, d1xbpe1, d1xbpe2, d1xbpg1, d1xbpg2, d1xbph1, d1xbpi1, d1xbpj1, d1xbpl1, d1xbpm1, d1xbpn1, d1xbpo1, d1xbpp1, d1xbpq1, d1xbpr1, d1xbps1, d1xbpt1, d1xbpu1, d1xbpw1, d1xbpx1, d1xbpz1 automatically matched to 2ZJR 1:2-54 complexed with mul |
Domain d2zjp11: 2zjp 1:2-54 [154486] Other proteins in same PDB: d2zjp21, d2zjp31, d2zjp41, d2zjpa1, d2zjpa2, d2zjpb1, d2zjpc1, d2zjpd1, d2zjpe1, d2zjpe2, d2zjpf1, d2zjpf2, d2zjpg1, d2zjph1, d2zjpi1, d2zjpj1, d2zjpk1, d2zjpl1, d2zjpm1, d2zjpn1, d2zjpo1, d2zjpp1, d2zjpq1, d2zjpr1, d2zjps1, d2zjpt1, d2zjpu1, d2zjpv1, d2zjpw1, d2zjpy1 automatically matched to 2ZJR 1:2-54 protein/RNA complex; complexed with mg, no1, zn |
Domain d2zjq11: 2zjq 1:2-54 [154517] Other proteins in same PDB: d2zjq21, d2zjq31, d2zjq41, d2zjq51, d2zjqa1, d2zjqa2, d2zjqb1, d2zjqc1, d2zjqd1, d2zjqe1, d2zjqe2, d2zjqf1, d2zjqf2, d2zjqg1, d2zjqh1, d2zjqi1, d2zjqj1, d2zjqk1, d2zjql1, d2zjqm1, d2zjqn1, d2zjqo1, d2zjqp1, d2zjqq1, d2zjqr1, d2zjqs1, d2zjqt1, d2zjqu1, d2zjqv1, d2zjqw1, d2zjqz1 automatically matched to 2ZJR 1:2-54 protein/RNA complex |
Domain d2zjr11: 2zjr 1:2-54 [154549] Other proteins in same PDB: d2zjr21, d2zjr31, d2zjr41, d2zjra1, d2zjra2, d2zjrb1, d2zjrc1, d2zjrd1, d2zjre1, d2zjre2, d2zjrg1, d2zjrh1, d2zjri1, d2zjrj1, d2zjrk1, d2zjrl1, d2zjrm1, d2zjrn1, d2zjro1, d2zjrp1, d2zjrq1, d2zjrr1, d2zjrs1, d2zjrt1, d2zjru1, d2zjrv1, d2zjrw1, d2zjrz1 Representative structure complexed with mg |
Domain d3cf511: 3cf5 1:2-54 [156534] Other proteins in same PDB: d3cf521, d3cf531, d3cf541, d3cf5a1, d3cf5a2, d3cf5b1, d3cf5c1, d3cf5d1, d3cf5e1, d3cf5e2, d3cf5f1, d3cf5f2, d3cf5g1, d3cf5h1, d3cf5i1, d3cf5j1, d3cf5k1, d3cf5l1, d3cf5m1, d3cf5n1, d3cf5o1, d3cf5p1, d3cf5q1, d3cf5r1, d3cf5s1, d3cf5t1, d3cf5u1, d3cf5v1, d3cf5w1, d3cf5y1 automatically matched to 2ZJR 1:2-54 protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d3dll11: 3dll 1:2-54 [157775] Other proteins in same PDB: d3dll21, d3dll31, d3dll41, d3dllb1, d3dllc1, d3dlld1, d3dlle1, d3dlle2, d3dllg1, d3dllh1, d3dlli1, d3dllj1, d3dllk1, d3dlll1, d3dllm1, d3dlln1, d3dllo1, d3dllp1, d3dllq1, d3dllr1, d3dlls1, d3dllt1, d3dllu1, d3dllv1, d3dllw1, d3dlly1 automatically matched to 2ZJR 1:2-54 complexed with mg, zld, zn |
Escherichia coli [TaxId:562] [144205] (9 PDB entries) Uniprot P0A7N9 1-54 |
Domain d1vs611: 1vs6 1:1-54 [120491] Other proteins in same PDB: d1vs601, d1vs621, d1vs631, d1vs641, d1vs6c1, d1vs6c2, d1vs6d1, d1vs6e1, d1vs6f1, d1vs6g1, d1vs6g2, d1vs6h1, d1vs6h2, d1vs6i1, d1vs6i2, d1vs6j1, d1vs6k1, d1vs6l1, d1vs6m1, d1vs6n1, d1vs6o1, d1vs6p1, d1vs6q1, d1vs6r1, d1vs6s1, d1vs6t1, d1vs6u1, d1vs6v1, d1vs6w1, d1vs6x1, d1vs6y1, d1vs6z1 automatically matched to 2AW4 1:1-54 complexed with mg |
Domain d1vs811: 1vs8 1:1-54 [120505] Other proteins in same PDB: d1vs801, d1vs821, d1vs831, d1vs841, d1vs8c1, d1vs8c2, d1vs8d1, d1vs8e1, d1vs8f1, d1vs8g1, d1vs8g2, d1vs8h1, d1vs8h2, d1vs8i1, d1vs8i2, d1vs8j1, d1vs8k1, d1vs8l1, d1vs8m1, d1vs8n1, d1vs8o1, d1vs8p1, d1vs8q1, d1vs8r1, d1vs8s1, d1vs8t1, d1vs8u1, d1vs8v1, d1vs8w1, d1vs8x1, d1vs8y1, d1vs8z1 automatically matched to 2AW4 1:1-54 complexed with mg |
Domain d2aw411: 2aw4 1:1-54 [127396] Other proteins in same PDB: d2aw401, d2aw421, d2aw431, d2aw441, d2aw4c1, d2aw4c2, d2aw4d1, d2aw4e1, d2aw4f1, d2aw4g1, d2aw4g2, d2aw4h1, d2aw4h2, d2aw4i1, d2aw4i2, d2aw4j1, d2aw4k1, d2aw4l1, d2aw4m1, d2aw4n1, d2aw4o1, d2aw4p1, d2aw4q1, d2aw4r1, d2aw4s1, d2aw4t1, d2aw4u1, d2aw4v1, d2aw4w1, d2aw4x1, d2aw4y1, d2aw4z1 protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2awb11: 2awb 1:1-54 [127418] Other proteins in same PDB: d2awb01, d2awb21, d2awb31, d2awb41, d2awbc1, d2awbc2, d2awbd1, d2awbe1, d2awbf1, d2awbg1, d2awbg2, d2awbh1, d2awbh2, d2awbi1, d2awbi2, d2awbj1, d2awbk1, d2awbl1, d2awbm1, d2awbn1, d2awbo1, d2awbp1, d2awbq1, d2awbr1, d2awbs1, d2awbt1, d2awbu1, d2awbv1, d2awbw1, d2awbx1, d2awby1, d2awbz1 automatically matched to 2AW4 1:1-54 protein/RNA complex; complexed with mg |
Domain d2gya11: 2gya 1:1-52 [135833] Other proteins in same PDB: d2gya31, d2gya32, d2gya51, d2gya52, d2gyab1, d2gyac1, d2gyad1, d2gyaf1, d2gyaf2, d2gyag1, d2gyag2, d2gyah1, d2gyai1, d2gyaj1, d2gyak1, d2gyam1, d2gyan1, d2gyao1, d2gyaq1, d2gyas1, d2gyat1, d2gyau1, d2gyaw1, d2gyax1 automatically matched to 2AW4 1:1-54 |
Domain d2gyc11: 2gyc 1:1-52 [135845] Other proteins in same PDB: d2gyc31, d2gyc32, d2gyc51, d2gyc52, d2gycb1, d2gycc1, d2gycd1, d2gycf1, d2gycf2, d2gycg1, d2gycg2, d2gych1, d2gyci1, d2gycj1, d2gyck1, d2gycm1, d2gycn1, d2gyco1, d2gycq1, d2gycs1, d2gyct1, d2gycu1, d2gycw1, d2gycx1 automatically matched to 2AW4 1:1-54 protein/RNA complex |
Domain d2i2t11: 2i2t 1:3-52 [136995] Other proteins in same PDB: d2i2t01, d2i2t21, d2i2t31, d2i2t41, d2i2tc1, d2i2tc2, d2i2td1, d2i2te1, d2i2tf1, d2i2tg1, d2i2tg2, d2i2th1, d2i2th2, d2i2ti1, d2i2ti2, d2i2tj1, d2i2tk1, d2i2tl1, d2i2tm1, d2i2tn1, d2i2to1, d2i2tp1, d2i2tq1, d2i2tr1, d2i2ts1, d2i2tt1, d2i2tu1, d2i2tv1, d2i2tw1, d2i2tx1, d2i2ty1, d2i2tz1 automatically matched to 2AW4 1:1-54 protein/RNA complex; complexed with mg, zn |
Domain d2i2v11: 2i2v 1:3-52 [137008] Other proteins in same PDB: d2i2v01, d2i2v21, d2i2v31, d2i2v41, d2i2vc1, d2i2vc2, d2i2vd1, d2i2ve1, d2i2vf1, d2i2vg1, d2i2vg2, d2i2vh1, d2i2vh2, d2i2vi1, d2i2vi2, d2i2vj1, d2i2vk1, d2i2vl1, d2i2vm1, d2i2vn1, d2i2vo1, d2i2vp1, d2i2vq1, d2i2vr1, d2i2vs1, d2i2vt1, d2i2vu1, d2i2vv1, d2i2vw1, d2i2vx1, d2i2vy1, d2i2vz1 automatically matched to 2AW4 1:1-54 protein/RNA complex; complexed with mg, zn |
Domain d2j2811: 2j28 1:1-54 [137960] Other proteins in same PDB: d2j2801, d2j2821, d2j2831, d2j2841, d2j28c1, d2j28c2, d2j28d1, d2j28e1, d2j28f1, d2j28g1, d2j28g2, d2j28h1, d2j28h2, d2j28i1, d2j28i2, d2j28j1, d2j28k1, d2j28l1, d2j28m1, d2j28n1, d2j28o1, d2j28p1, d2j28q1, d2j28r1, d2j28s1, d2j28t1, d2j28u1, d2j28v1, d2j28w1, d2j28x1, d2j28y1, d2j28z1 automatically matched to 2AW4 1:1-54 protein/RNA complex; complexed with mg |
Thermus thermophilus [TaxId:274] [161180] (9 PDB entries) Uniprot P35871 8-52 |
Domain d2hgj51: 2hgj 5:9-53 [145301] Other proteins in same PDB: d2hgj11, d2hgj21, d2hgj31, d2hgj41, d2hgj61, d2hgj71, d2hgj81, d2hgjc1, d2hgjd1, d2hgjd2, d2hgje1, d2hgjf1, d2hgjg1, d2hgjh1, d2hgjh2, d2hgjk1, d2hgjk2, d2hgjl1, d2hgjl2, d2hgjm1, d2hgjn1, d2hgjo1, d2hgjp1, d2hgjq1, d2hgjr1, d2hgjt1, d2hgju1, d2hgjv1, d2hgjw1, d2hgjx1, d2hgjy1 automatically matched to 2J01 6:9-53 |
Domain d2hgq51: 2hgq 5:9-53 [145333] Other proteins in same PDB: d2hgq11, d2hgq21, d2hgq31, d2hgq41, d2hgq61, d2hgq71, d2hgq81, d2hgqc1, d2hgqd1, d2hgqd2, d2hgqe1, d2hgqf1, d2hgqg1, d2hgqh1, d2hgqh2, d2hgqk1, d2hgqk2, d2hgql1, d2hgql2, d2hgqm1, d2hgqn1, d2hgqo1, d2hgqp1, d2hgqq1, d2hgqr1, d2hgqt1, d2hgqu1, d2hgqv1, d2hgqw1, d2hgqx1, d2hgqy1 automatically matched to 2J01 6:9-53 |
Domain d2hgu51: 2hgu 5:9-53 [145365] Other proteins in same PDB: d2hgu11, d2hgu21, d2hgu31, d2hgu41, d2hgu61, d2hgu71, d2hgu81, d2hguc1, d2hgud1, d2hgud2, d2hgue1, d2hguf1, d2hgug1, d2hguh1, d2hguh2, d2hguk1, d2hguk2, d2hgul1, d2hgul2, d2hgum1, d2hgun1, d2hguo1, d2hgup1, d2hguq1, d2hgur1, d2hgut1, d2hguu1, d2hguv1, d2hguw1, d2hgux1, d2hguy1 automatically matched to 2J01 6:9-53 protein/RNA complex |
Domain d2j0161: 2j01 6:9-53 [145561] Other proteins in same PDB: d2j0111, d2j0121, d2j0131, d2j0141, d2j0151, d2j0171, d2j0181, d2j01c1, d2j01d1, d2j01d2, d2j01e1, d2j01f1, d2j01g1, d2j01h1, d2j01h2, d2j01i1, d2j01i2, d2j01n1, d2j01o1, d2j01p1, d2j01q1, d2j01r1, d2j01s1, d2j01t1, d2j01u1, d2j01v1, d2j01w1, d2j01x1, d2j01y1, d2j01z1 Representative structure protein/RNA complex |
Domain d2j0361: 2j03 6:9-53 [145588] Other proteins in same PDB: d2j0311, d2j0321, d2j0331, d2j0341, d2j0351, d2j0371, d2j0381, d2j03c1, d2j03d1, d2j03d2, d2j03e1, d2j03f1, d2j03g1, d2j03h1, d2j03h2, d2j03i1, d2j03i2, d2j03n1, d2j03o1, d2j03p1, d2j03q1, d2j03r1, d2j03s1, d2j03t1, d2j03u1, d2j03v1, d2j03w1, d2j03x1, d2j03y1, d2j03z1 automatically matched to 2J01 6:9-53 protein/RNA complex |
Timeline for Protein Ribosomal protein L33p from g.41.8.6: Ribosomal protein L33p: