Lineage for Species: Escherichia coli [TaxId: 562]
- Root: SCOPe 2.06
Class d: Alpha and beta proteins (a+b) [53931] (385 folds) 
Fold d.325: L28p-like [143799] (1 superfamily)
unusual fold consisting of three beta-hairpins, that form a paper clip-like structure, and two helices; could have evolved from a glucocorticoid receptor-like zinc finger domain (57715)Superfamily d.325.1: L28p-like [143800] (2 families) 
In early ribosomal structures, L28p has been misinterpreted as L31p. in the Ribosomal protein L28p family, there are sequences containing two CxxC pairs. Threading these sequences into this fold brings the four cysteines in a similar site to the zinc-binding site of glucocorticoid receptor-like zinc fingers. In the Ribosomal protein L31p, there are also members with two CxxC pairs. However, these won't form a putative zinc-binding site in this fold. The L31p family are classified here temporarily, until its true fold is known
Family d.325.1.2: Ribosomal protein L31p [143804] (1 protein)
Pfam PF01197Protein Ribosomal protein L31p [143805] (2 species) 
Species Escherichia coli [TaxId:562] [143806] (9 PDB entries)
Uniprot P0A7M9 1-70
PDB entries in Species: Escherichia coli [TaxId: 562]:
- Domain(s) for 1vs6:
Domain d1vs6z1: 1vs6 Z:1-70 [120502]
Other proteins in same PDB: d1vs601, d1vs611, d1vs621, d1vs631, d1vs641, d1vs6c1, d1vs6c2, d1vs6d1, d1vs6e1, d1vs6f1, d1vs6g1, d1vs6g2, d1vs6h1, d1vs6h2, d1vs6i1, d1vs6i2, d1vs6j1, d1vs6k1, d1vs6l1, d1vs6m1, d1vs6n1, d1vs6o1, d1vs6p1, d1vs6q1, d1vs6r1, d1vs6s1, d1vs6t1, d1vs6u1, d1vs6v1, d1vs6w1, d1vs6x1, d1vs6y1
complexed with mg
complexed with mg
- Domain(s) for 1vs8:
Domain d1vs8z1: 1vs8 Z:1-70 [120516]
Other proteins in same PDB: d1vs801, d1vs811, d1vs821, d1vs831, d1vs841, d1vs8c1, d1vs8c2, d1vs8d1, d1vs8e1, d1vs8f1, d1vs8g1, d1vs8g2, d1vs8h1, d1vs8h2, d1vs8i1, d1vs8i2, d1vs8j1, d1vs8k1, d1vs8l1, d1vs8m1, d1vs8n1, d1vs8o1, d1vs8p1, d1vs8q1, d1vs8r1, d1vs8s1, d1vs8t1, d1vs8u1, d1vs8v1, d1vs8w1, d1vs8x1, d1vs8y1
complexed with mg
complexed with mg
- Domain(s) for 2aw4:
Domain d2aw4z1: 2aw4 Z:1-70 [127407]
Other proteins in same PDB: d2aw401, d2aw411, d2aw421, d2aw431, d2aw441, d2aw4c1, d2aw4c2, d2aw4d1, d2aw4e1, d2aw4f1, d2aw4g1, d2aw4g2, d2aw4h1, d2aw4h2, d2aw4i1, d2aw4i2, d2aw4j1, d2aw4k1, d2aw4l1, d2aw4m1, d2aw4n1, d2aw4o1, d2aw4p1, d2aw4q1, d2aw4r1, d2aw4s1, d2aw4t1, d2aw4u1, d2aw4v1, d2aw4w1, d2aw4x1, d2aw4y1
protein/RNA complex; complexed with mg
protein/RNA complex; complexed with mg
- Domain(s) for 2awb:
Domain d2awbz1: 2awb Z:1-70 [127429]
Other proteins in same PDB: d2awb01, d2awb11, d2awb21, d2awb31, d2awb41, d2awbc1, d2awbc2, d2awbd1, d2awbe1, d2awbf1, d2awbg1, d2awbg2, d2awbh1, d2awbh2, d2awbi1, d2awbi2, d2awbj1, d2awbk1, d2awbl1, d2awbm1, d2awbn1, d2awbo1, d2awbp1, d2awbq1, d2awbr1, d2awbs1, d2awbt1, d2awbu1, d2awbv1, d2awbw1, d2awbx1, d2awby1
protein/RNA complex; complexed with mg
protein/RNA complex; complexed with mg
- Domain(s) for 2j28:
Domain d2j28z1: 2j28 Z:1-70 [137971]
Other proteins in same PDB: d2j2801, d2j2811, d2j2821, d2j2831, d2j2841, d2j28c1, d2j28c2, d2j28d1, d2j28e1, d2j28f1, d2j28g1, d2j28g2, d2j28h1, d2j28h2, d2j28i1, d2j28i2, d2j28j1, d2j28k1, d2j28l1, d2j28m1, d2j28n1, d2j28o1, d2j28p1, d2j28q1, d2j28r1, d2j28s1, d2j28t1, d2j28u1, d2j28v1, d2j28w1, d2j28x1, d2j28y1
automatically matched to 2AW4 Z:1-70
protein/RNA complex; complexed with mg
- Domain(s) for 2rdo:
Domain d2rdoz1: 2rdo Z:1-70 [151966]
Other proteins in same PDB: d2rdo01, d2rdo11, d2rdo31, d2rdo41, d2rdo81, d2rdoc1, d2rdoc2, d2rdod1, d2rdoe1, d2rdof1, d2rdog1, d2rdog2, d2rdoh1, d2rdoh2, d2rdoi1, d2rdoi2, d2rdoj1, d2rdok1, d2rdol1, d2rdom1, d2rdon1, d2rdoo1, d2rdop1, d2rdoq1, d2rdor1, d2rdos1, d2rdot1, d2rdou1, d2rdov1, d2rdow1, d2rdox1, d2rdoy1
automatically matched to d1vs6z1
- Domain(s) for 2vhm:
Domain d2vhmz1: 2vhm Z:1-70 [153089]
Other proteins in same PDB: d2vhm01, d2vhm11, d2vhm31, d2vhm41, d2vhmc1, d2vhmc2, d2vhmd1, d2vhme1, d2vhmf1, d2vhmg1, d2vhmg2, d2vhmh1, d2vhmh2, d2vhmi1, d2vhmi2, d2vhmj1, d2vhmk1, d2vhml1, d2vhmm1, d2vhmn1, d2vhmo1, d2vhmp1, d2vhmq1, d2vhmr1, d2vhms1, d2vhmt1, d2vhmu1, d2vhmv1, d2vhmw1, d2vhmx1, d2vhmy1
protein/RNA complex; complexed with mg
protein/RNA complex; complexed with mg
- Domain(s) for 2vhn:
Domain d2vhnz1: 2vhn Z:1-70 [153121]
Other proteins in same PDB: d2vhn01, d2vhn11, d2vhn31, d2vhn41, d2vhnc1, d2vhnc2, d2vhnd1, d2vhne1, d2vhnf1, d2vhng1, d2vhng2, d2vhnh1, d2vhnh2, d2vhni1, d2vhni2, d2vhnj1, d2vhnk1, d2vhnl1, d2vhnm1, d2vhnn1, d2vhno1, d2vhnp1, d2vhnq1, d2vhnr1, d2vhns1, d2vhnt1, d2vhnu1, d2vhnv1, d2vhnw1, d2vhnx1, d2vhny1
protein/RNA complex; complexed with mg
protein/RNA complex; complexed with mg
- Domain(s) for 3bbx:
Domain d3bbxz1: 3bbx Z:1-70 [155123]
Other proteins in same PDB: d3bbx01, d3bbx11, d3bbx31, d3bbx41, d3bbxc1, d3bbxc2, d3bbxd1, d3bbxe1, d3bbxf1, d3bbxg1, d3bbxg2, d3bbxh1, d3bbxh2, d3bbxj1, d3bbxk1, d3bbxl1, d3bbxm1, d3bbxn1, d3bbxo1, d3bbxp1, d3bbxq1, d3bbxr1, d3bbxs1, d3bbxt1, d3bbxu1, d3bbxv1, d3bbxw1, d3bbxx1, d3bbxy1
automatically matched to d1vs6z1
protein/RNA complex; complexed with mg
More info for Species Escherichia coli [TaxId:562] from d.325.1.2 Ribosomal protein L31p
Timeline for Species Escherichia coli [TaxId:562] from d.325.1.2 Ribosomal protein L31p:
- Species Escherichia coli [TaxId:562] from d.325.1.2 Ribosomal protein L31p first appeared in SCOP 1.73
- Species Escherichia coli [TaxId:562] from d.325.1.2 Ribosomal protein L31p appears in SCOPe 2.05
- Species Escherichia coli [TaxId:562] from d.325.1.2 Ribosomal protein L31p appears in SCOPe 2.07
- Species Escherichia coli [TaxId:562] from d.325.1.2 Ribosomal protein L31p appears in the current release, SCOPe 2.08